RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		41.36	■■■■■ 4.21
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGEF11	O15085	1522 aa		41.33	■■■■■ 4.21
GPS1-223	ENST00000584229	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		41.31	■■■■■ 4.2
GPS1-223	ENST00000584229	SHROOM2	Q13796	1616 aa		41.26	■■■■■ 4.19
GPS1-223	ENST00000584229	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		41.24	■■■■■ 4.19
GPS1-223	ENST00000584229	KIF21B	O75037	1637 aa		41.22	■■■■■ 4.19
GPS1-223	ENST00000584229	IQGAP2	Q13576	1575 aa		41.2	■■■■■ 4.19
GPS1-223	ENST00000584229	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		41.1	■■■■■ 4.17
GPS1-223	ENST00000584229	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		41.1	■■■■■ 4.17
GPS1-223	ENST00000584229	JPH4	Q96JJ6	628 aa		41.09	■■■■■ 4.17
GPS1-223	ENST00000584229	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	41.06	■■■■■ 4.16
GPS1-223	ENST00000584229	ARAP1	Q96P48	1450 aa		41.01	■■■■■ 4.16
GPS1-223	ENST00000584229	GOLGA3	Q08378	1498 aa		40.99	■■■■■ 4.15
GPS1-223	ENST00000584229	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		40.89	■■■■■ 4.14
GPS1-223	ENST00000584229	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		40.88	■■■■■ 4.14
GPS1-223	ENST00000584229	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	40.86	■■■■■ 4.13
GPS1-223	ENST00000584229	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		40.85	■■■■■ 4.13
GPS1-223	ENST00000584229	KIAA0556	O60303	1618 aa		40.81	■■■■■ 4.12
GPS1-223	ENST00000584229	DISP1	Q96F81	1524 aa		40.77	■■■■■ 4.12
GPS1-223	ENST00000584229	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	40.76	■■■■■ 4.12
GPS1-223	ENST00000584229	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	40.74	■■■■■ 4.11
GPS1-223	ENST00000584229	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		40.64	■■■■■ 4.1
GPS1-223	ENST00000584229	SAMD9	Q5K651	1589 aa		40.63	■■■■■ 4.09
GPS1-223	ENST00000584229	PTPRG	P23470	1445 aa		40.59	■■■■■ 4.09
GPS1-223	ENST00000584229	P3H3	Q8IVL6	736 aa		40.55	■■■■■ 4.08
GPS1-223	ENST00000584229	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		40.52	■■■■■ 4.08
GPS1-223	ENST00000584229	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		40.46	■■■■■ 4.07
GPS1-223	ENST00000584229	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		40.41	■■■■■ 4.06
GPS1-223	ENST00000584229	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		40.36	■■■■■ 4.05
GPS1-223	ENST00000584229	UACA	Q9BZF9	1416 aa		40.33	■■■■■ 4.05
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		40.32	■■■■■ 4.05
GPS1-223	ENST00000584229	ABCC2	Q92887	1545 aa		40.32	■■■■■ 4.04
GPS1-223	ENST00000584229	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		40.3	■■■■■ 4.04
GPS1-223	ENST00000584229	ABCA8	O94911	1581 aa		40.27	■■■■■ 4.04
GPS1-223	ENST00000584229	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	40.25	■■■■■ 4.03
GPS1-223	ENST00000584229	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		40.25	■■■■■ 4.03
GPS1-223	ENST00000584229	CLIP1	P30622	1438 aa		40.24	■■■■■ 4.03
GPS1-223	ENST00000584229	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		40.23	■■■■■ 4.03
GPS1-223	ENST00000584229	CEP162	Q5TB80	1403 aa		40.16	■■■■■ 4.02
GPS1-223	ENST00000584229	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	40.16	■■■■■ 4.02
GPS1-223	ENST00000584229	FMN1	Q68DA7	1419 aa		40.09	■■■■■ 4.01
GPS1-223	ENST00000584229	MAPKBP1	O60336	1514 aa		40.06	■■■■■ 4
GPS1-223	ENST00000584229	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		40.06	■■■■■ 4
GPS1-223	ENST00000584229	ARID3C	A6NKF2	412 aa		40.05	■■■■■ 4
GPS1-223	ENST00000584229	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	40.03	■■■■■ 4
GPS1-223	ENST00000584229	HECW1	Q76N89	1606 aa		40	■■■■□ 3.99
GPS1-223	ENST00000584229	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	39.97	■■■■□ 3.99
GPS1-223	ENST00000584229	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	39.96	■■■■□ 3.99
GPS1-223	ENST00000584229	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	39.96	■■■■□ 3.99
GPS1-223	ENST00000584229	ASXL2	Q76L83	1435 aa		39.92	■■■■□ 3.98
GPS1-223	ENST00000584229	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		39.92	■■■■□ 3.98
GPS1-223	ENST00000584229	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	39.91	■■■■□ 3.98
GPS1-223	ENST00000584229	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	39.91	■■■■□ 3.98
GPS1-223	ENST00000584229	ATP10B	O94823	1461 aa		39.88	■■■■□ 3.98
GPS1-223	ENST00000584229	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		39.85	■■■■□ 3.97
GPS1-223	ENST00000584229	DIP2B	Q9P265	1576 aa		39.85	■■■■□ 3.97
GPS1-223	ENST00000584229	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	39.82	■■■■□ 3.97
GPS1-223	ENST00000584229	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		39.8	■■■■□ 3.96
GPS1-223	ENST00000584229	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		39.8	■■■■□ 3.96
GPS1-223	ENST00000584229	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		39.79	■■■■□ 3.96
GPS1-223	ENST00000584229	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		39.78	■■■■□ 3.96
GPS1-223	ENST00000584229	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	39.76	■■■■□ 3.96
GPS1-223	ENST00000584229	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		39.72	■■■■□ 3.95
GPS1-223	ENST00000584229	TSPOAP1	O95153	1857 aa		39.7	■■■■□ 3.95
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		39.67	■■■■□ 3.94
GPS1-223	ENST00000584229	KCNH8	Q96L42	1107 aa		39.65	■■■■□ 3.94
GPS1-223	ENST00000584229	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		39.63	■■■■□ 3.93
GPS1-223	ENST00000584229	GLI2	P10070	1586 aa		39.62	■■■■□ 3.93
GPS1-223	ENST00000584229	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		39.59	■■■■□ 3.93
GPS1-223	ENST00000584229	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		39.54	■■■■□ 3.92
GPS1-223	ENST00000584229	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		39.54	■■■■□ 3.92
GPS1-223	ENST00000584229	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	39.53	■■■■□ 3.92
GPS1-223	ENST00000584229	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		39.46	■■■■□ 3.91
GPS1-223	ENST00000584229	KIF14	Q15058	1648 aa		39.43	■■■■□ 3.9
GPS1-223	ENST00000584229	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	39.43	■■■■□ 3.9
GPS1-223	ENST00000584229	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	39.4	■■■■□ 3.9
GPS1-223	ENST00000584229	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		39.4	■■■■□ 3.9
GPS1-223	ENST00000584229	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		39.38	■■■■□ 3.89
GPS1-223	ENST00000584229	CD109	Q6YHK3	1445 aa		39.37	■■■■□ 3.89
GPS1-223	ENST00000584229	TIAM1	Q13009	1591 aa		39.37	■■■■□ 3.89
GPS1-223	ENST00000584229	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	39.36	■■■■□ 3.89
GPS1-223	ENST00000584229	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		39.3	■■■■□ 3.88
GPS1-223	ENST00000584229	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		39.3	■■■■□ 3.88
GPS1-223	ENST00000584229	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		39.29	■■■■□ 3.88
GPS1-223	ENST00000584229	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		39.28	■■■■□ 3.88
GPS1-223	ENST00000584229	APLP2	Q06481	763 aa		39.25	■■■■□ 3.87
GPS1-223	ENST00000584229	KDM6B	O15054	1643 aa		39.18	■■■■□ 3.86
GPS1-223	ENST00000584229	MAP3K1	Q13233	1512 aa		39.17	■■■■□ 3.86
GPS1-223	ENST00000584229	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	39.17	■■■■□ 3.86
GPS1-223	ENST00000584229	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		39.14	■■■■□ 3.86
GPS1-223	ENST00000584229	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		39.13	■■■■□ 3.85
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		39.11	■■■■□ 3.85
GPS1-223	ENST00000584229	PREX2	Q70Z35	1606 aa		39.11	■■■■□ 3.85
GPS1-223	ENST00000584229	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		39.09	■■■■□ 3.85
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		39.07	■■■■□ 3.84
GPS1-223	ENST00000584229	FANCA	O15360	1455 aa		39.05	■■■■□ 3.84
GPS1-223	ENST00000584229	PLCH2	O75038	1416 aa		39.05	■■■■□ 3.84
GPS1-223	ENST00000584229	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		39.03	■■■■□ 3.84
GPS1-223	ENST00000584229	NEO1	Q92859	1461 aa		39.02	■■■■□ 3.84
GPS1-223	ENST00000584229	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	39.01	■■■■□ 3.84

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