RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.77■□□□□ 0.6
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GGA3-211ENST00000582232 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.72■□□□□ 0.59
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GGA3-211ENST00000582232 SHROOM2Q13796 1616 aa18.67■□□□□ 0.58
GGA3-211ENST00000582232 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.64■□□□□ 0.58
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GGA3-211ENST00000582232 CEP162Q5TB80 1403 aa18.54■□□□□ 0.56
GGA3-211ENST00000582232 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.53■□□□□ 0.56
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GGA3-211ENST00000582232 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.42■□□□□ 0.54
GGA3-211ENST00000582232 ARAP1Q96P48 1450 aa18.42■□□□□ 0.54
GGA3-211ENST00000582232 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.41■□□□□ 0.54
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GGA3-211ENST00000582232 PTPRGP23470 1445 aa18.39■□□□□ 0.53
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GGA3-211ENST00000582232 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.31■□□□□ 0.52
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GGA3-211ENST00000582232 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.28■□□□□ 0.52
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GGA3-211ENST00000582232 HECW1Q76N89 1606 aa18.23■□□□□ 0.51
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GGA3-211ENST00000582232 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.23■□□□□ 0.51
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GGA3-211ENST00000582232 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.18■□□□□ 0.5
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GGA3-211ENST00000582232 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
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GGA3-211ENST00000582232 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
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GGA3-211ENST00000582232 ASXL2Q76L83 1435 aa18.01■□□□□ 0.47
GGA3-211ENST00000582232 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.01■□□□□ 0.47
GGA3-211ENST00000582232 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.01■□□□□ 0.47
GGA3-211ENST00000582232 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.01■□□□□ 0.47
GGA3-211ENST00000582232 WDR7Q9Y4E6 1490 aa18■□□□□ 0.47
GGA3-211ENST00000582232 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
GGA3-211ENST00000582232 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa17.98■□□□□ 0.47
GGA3-211ENST00000582232 MTUS2Q5JR59 1369 aa17.97■□□□□ 0.47
GGA3-211ENST00000582232 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
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GGA3-211ENST00000582232 CCNB3Q8WWL7 1395 aa17.79■□□□□ 0.44
GGA3-211ENST00000582232 PLCH2O75038 1416 aa17.79■□□□□ 0.44
GGA3-211ENST00000582232 PREX2Q70Z35 1606 aa17.79■□□□□ 0.44
GGA3-211ENST00000582232 PHLDB1Q86UU1 1377 aa17.79■□□□□ 0.44
GGA3-211ENST00000582232 CD109Q6YHK3 1445 aa17.78■□□□□ 0.44
GGA3-211ENST00000582232 MYOM3Q5VTT5 1437 aa17.77■□□□□ 0.44
GGA3-211ENST00000582232 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa17.77■□□□□ 0.44
GGA3-211ENST00000582232 MIA2Q96PC5 1412 aa17.75■□□□□ 0.43
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