RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580740.1

SEPT4-212, Transcript of septin 4, humanhuman

TSL 4

Gene SEPT4, Length 549 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT4-212ENST00000580740 SYNJ2O15056 1496 aa25.22■■□□□ 1.63
SEPT4-212ENST00000580740 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.18■■□□□ 1.62
SEPT4-212ENST00000580740 GRIN2AQ12879 1464 aa25.17■■□□□ 1.62
SEPT4-212ENST00000580740 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.16■■□□□ 1.62
SEPT4-212ENST00000580740 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.16■■□□□ 1.62
SEPT4-212ENST00000580740 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.16■■□□□ 1.62
SEPT4-212ENST00000580740 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.15■■□□□ 1.62
SEPT4-212ENST00000580740 ARAP1Q96P48 1450 aa25.13■■□□□ 1.61
SEPT4-212ENST00000580740 IQGAP2Q13576 1575 aa25.11■■□□□ 1.61
SEPT4-212ENST00000580740 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.07■■□□□ 1.6
SEPT4-212ENST00000580740 SAMD9Q5K651 1589 aa25.07■■□□□ 1.6
SEPT4-212ENST00000580740 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SEPT4-212ENST00000580740 ARHGEF11O15085 1522 aa25.04■■□□□ 1.6
SEPT4-212ENST00000580740 NUP160Q12769 1436 aa25.02■■□□□ 1.6
SEPT4-212ENST00000580740 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.02■■□□□ 1.6
SEPT4-212ENST00000580740 CEP170Q5SW79 1584 aa24.98■■□□□ 1.59
SEPT4-212ENST00000580740 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SEPT4-212ENST00000580740 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.97■■□□□ 1.59
SEPT4-212ENST00000580740 FMN1Q68DA7 1419 aa24.95■■□□□ 1.58
SEPT4-212ENST00000580740 CHD1O14646 1710 aa24.94■■□□□ 1.58
SEPT4-212ENST00000580740 APLP2Q06481 763 aa24.9■■□□□ 1.58
SEPT4-212ENST00000580740 MAP3K1Q13233 1512 aa24.9■■□□□ 1.58
SEPT4-212ENST00000580740 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.88■■□□□ 1.57
SEPT4-212ENST00000580740 FBLN2P98095 1184 aa24.87■■□□□ 1.57
SEPT4-212ENST00000580740 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.86■■□□□ 1.57
SEPT4-212ENST00000580740 KIAA0556O60303 1618 aa24.85■■□□□ 1.57
SEPT4-212ENST00000580740 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SEPT4-212ENST00000580740 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.83■■□□□ 1.57
SEPT4-212ENST00000580740 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SEPT4-212ENST00000580740 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.79■■□□□ 1.56
SEPT4-212ENST00000580740 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SEPT4-212ENST00000580740 DISP1Q96F81 1524 aa24.79■■□□□ 1.56
SEPT4-212ENST00000580740 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.78■■□□□ 1.56
SEPT4-212ENST00000580740 TIAM1Q13009 1591 aa24.76■■□□□ 1.55
SEPT4-212ENST00000580740 P3H3Q8IVL6 736 aa24.74■■□□□ 1.55
SEPT4-212ENST00000580740 SHROOM2Q13796 1616 aa24.74■■□□□ 1.55
SEPT4-212ENST00000580740 HECW1Q76N89 1606 aa24.72■■□□□ 1.55
SEPT4-212ENST00000580740 JPH4Q96JJ6 628 aa24.71■■□□□ 1.55
SEPT4-212ENST00000580740 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.7■■□□□ 1.54
SEPT4-212ENST00000580740 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.68■■□□□ 1.54
SEPT4-212ENST00000580740 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.61■■□□□ 1.53
SEPT4-212ENST00000580740 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.6■■□□□ 1.53
SEPT4-212ENST00000580740 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.6■■□□□ 1.53
SEPT4-212ENST00000580740 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SEPT4-212ENST00000580740 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SEPT4-212ENST00000580740 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.55■■□□□ 1.52
SEPT4-212ENST00000580740 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SEPT4-212ENST00000580740 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.51■■□□□ 1.51
SEPT4-212ENST00000580740 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SEPT4-212ENST00000580740 ABCA8O94911 1581 aa24.5■■□□□ 1.51
SEPT4-212ENST00000580740 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SEPT4-212ENST00000580740 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
SEPT4-212ENST00000580740 PTPRGP23470 1445 aa24.45■■□□□ 1.51
SEPT4-212ENST00000580740 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.44■■□□□ 1.5
SEPT4-212ENST00000580740 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SEPT4-212ENST00000580740 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SEPT4-212ENST00000580740 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SEPT4-212ENST00000580740 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.4■■□□□ 1.5
SEPT4-212ENST00000580740 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SEPT4-212ENST00000580740 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SEPT4-212ENST00000580740 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SEPT4-212ENST00000580740 UACAQ9BZF9 1416 aa24.35■■□□□ 1.49
SEPT4-212ENST00000580740 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.34■■□□□ 1.49
SEPT4-212ENST00000580740 ABCC2Q92887 1545 aa24.32■■□□□ 1.48
SEPT4-212ENST00000580740 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.32■■□□□ 1.48
SEPT4-212ENST00000580740 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.31■■□□□ 1.48
SEPT4-212ENST00000580740 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.3■■□□□ 1.48
SEPT4-212ENST00000580740 NCOA2Q15596 1464 aa24.3■■□□□ 1.48
SEPT4-212ENST00000580740 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
SEPT4-212ENST00000580740 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.28■■□□□ 1.48
SEPT4-212ENST00000580740 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.27■■□□□ 1.48
SEPT4-212ENST00000580740 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SEPT4-212ENST00000580740 ATP10BO94823 1461 aa24.25■■□□□ 1.47
SEPT4-212ENST00000580740 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.24■■□□□ 1.47
SEPT4-212ENST00000580740 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.21■■□□□ 1.47
SEPT4-212ENST00000580740 KIF14Q15058 1648 aa24.19■■□□□ 1.46
SEPT4-212ENST00000580740 MIA2Q96PC5 1412 aa24.18■■□□□ 1.46
SEPT4-212ENST00000580740 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SEPT4-212ENST00000580740 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SEPT4-212ENST00000580740 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.18■■□□□ 1.46
SEPT4-212ENST00000580740 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.16■■□□□ 1.46
SEPT4-212ENST00000580740 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.15■■□□□ 1.46
SEPT4-212ENST00000580740 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SEPT4-212ENST00000580740 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SEPT4-212ENST00000580740 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.12■■□□□ 1.45
SEPT4-212ENST00000580740 ARID3CA6NKF2 412 aa24.1■■□□□ 1.45
SEPT4-212ENST00000580740 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.03■■□□□ 1.44
SEPT4-212ENST00000580740 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SEPT4-212ENST00000580740 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SEPT4-212ENST00000580740 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.99■■□□□ 1.43
SEPT4-212ENST00000580740 PREX2Q70Z35 1606 aa23.95■■□□□ 1.43
SEPT4-212ENST00000580740 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.94■■□□□ 1.42
SEPT4-212ENST00000580740 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
SEPT4-212ENST00000580740 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.93■■□□□ 1.42
SEPT4-212ENST00000580740 HRCP23327 699 aa23.92■■□□□ 1.42
SEPT4-212ENST00000580740 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.92■■□□□ 1.42
SEPT4-212ENST00000580740 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SEPT4-212ENST00000580740 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.91■■□□□ 1.42
SEPT4-212ENST00000580740 AKNAQ7Z591 1439 aa23.91■■□□□ 1.42
SEPT4-212ENST00000580740 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms