RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578431.1

EPB41L3-210, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3, humanhuman

TSL 2

Gene EPB41L3, Length 570 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3-210ENST00000578431 SHROOM2Q13796 1616 aa48.03■■■■■ 5.28
EPB41L3-210ENST00000578431 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.99■■■■■ 5.27
EPB41L3-210ENST00000578431 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa47.97■■■■■ 5.27
EPB41L3-210ENST00000578431 IQGAP2Q13576 1575 aa47.79■■■■■ 5.24
EPB41L3-210ENST00000578431 KIF21BO75037 1637 aa47.78■■■■■ 5.24
EPB41L3-210ENST00000578431 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa47.77■■■■■ 5.24
EPB41L3-210ENST00000578431 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.75■■■■■ 5.23
EPB41L3-210ENST00000578431 JPH4Q96JJ6 628 aa47.73■■■■■ 5.23
EPB41L3-210ENST00000578431 ARAP1Q96P48 1450 aa47.72■■■■■ 5.23
EPB41L3-210ENST00000578431 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.7■■■■■ 5.23
EPB41L3-210ENST00000578431 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.66■■■■■ 5.22
EPB41L3-210ENST00000578431 UGGT2Q9NYU1 1516 aa47.56■■■■■ 5.2
EPB41L3-210ENST00000578431 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.44■■■■■ 5.18
EPB41L3-210ENST00000578431 GOLGA3Q08378 1498 aa47.44■■■■■ 5.18
EPB41L3-210ENST00000578431 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa47.41■■■■■ 5.18
EPB41L3-210ENST00000578431 DISP1Q96F81 1524 aa47.4■■■■■ 5.18
EPB41L3-210ENST00000578431 KIAA0556O60303 1618 aa47.34■■■■■ 5.17
EPB41L3-210ENST00000578431 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.23■■■■■ 5.15
EPB41L3-210ENST00000578431 SAMD9Q5K651 1589 aa47.17■■■■■ 5.14
EPB41L3-210ENST00000578431 PTPRGP23470 1445 aa47.13■■■■■ 5.13
EPB41L3-210ENST00000578431 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
EPB41L3-210ENST00000578431 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.03■■■■■ 5.12
EPB41L3-210ENST00000578431 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.01■■■■■ 5.12
EPB41L3-210ENST00000578431 ADCY10Q96PN6 1610 aa46.99■■■■■ 5.11
EPB41L3-210ENST00000578431 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa46.89■■■■■ 5.1
EPB41L3-210ENST00000578431 UACAQ9BZF9 1416 aa46.88■■■■■ 5.09
EPB41L3-210ENST00000578431 ABCC2Q92887 1545 aa46.85■■■■■ 5.09
EPB41L3-210ENST00000578431 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46.82■■■■■ 5.09
EPB41L3-210ENST00000578431 ABCA8O94911 1581 aa46.8■■■■■ 5.08
EPB41L3-210ENST00000578431 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.76■■■■■ 5.08
EPB41L3-210ENST00000578431 FHOD3Q2V2M9 1422 aa46.75■■■■■ 5.07
EPB41L3-210ENST00000578431 P3H3Q8IVL6 736 aa46.75■■■■■ 5.07
EPB41L3-210ENST00000578431 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.75■■■■■ 5.07
EPB41L3-210ENST00000578431 PLB1Q6P1J6 1458 aa46.74■■■■■ 5.07
EPB41L3-210ENST00000578431 MAPKBP1O60336 1514 aa46.68■■■■■ 5.06
EPB41L3-210ENST00000578431 KDM5BQ9UGL1 1544 aa46.65■■■■■ 5.06
EPB41L3-210ENST00000578431 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP46.64■■■■■ 5.06
EPB41L3-210ENST00000578431 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa46.61■■■■■ 5.05
EPB41L3-210ENST00000578431 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
EPB41L3-210ENST00000578431 CLIP1P30622 1438 aa46.54■■■■■ 5.04
EPB41L3-210ENST00000578431 FMN1Q68DA7 1419 aa46.52■■■■■ 5.04
EPB41L3-210ENST00000578431 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.45■■■■■ 5.03
EPB41L3-210ENST00000578431 CEP162Q5TB80 1403 aa46.43■■■■■ 5.02
EPB41L3-210ENST00000578431 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
EPB41L3-210ENST00000578431 ASXL2Q76L83 1435 aa46.37■■■■■ 5.01
EPB41L3-210ENST00000578431 ABCC10Q5T3U5 1492 aa46.35■■■■■ 5.01
EPB41L3-210ENST00000578431 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.35■■■■■ 5.01
EPB41L3-210ENST00000578431 DIP2BQ9P265 1576 aa46.34■■■■■ 5.01
EPB41L3-210ENST00000578431 ATP10BO94823 1461 aa46.33■■■■■ 5.01
EPB41L3-210ENST00000578431 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.32■■■■■ 5.01
EPB41L3-210ENST00000578431 HECW1Q76N89 1606 aa46.31■■■■■ 5
EPB41L3-210ENST00000578431 WDR7Q9Y4E6 1490 aa46.25■■■■■ 4.99
EPB41L3-210ENST00000578431 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP46.21■■■■■ 4.99
EPB41L3-210ENST00000578431 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.19■■■■■ 4.98
EPB41L3-210ENST00000578431 GLI2P10070 1586 aa46.18■■■■■ 4.98
EPB41L3-210ENST00000578431 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP46.14■■■■■ 4.98
EPB41L3-210ENST00000578431 FYCO1Q9BQS8 1478 aa46.14■■■■■ 4.98
EPB41L3-210ENST00000578431 ARID3CA6NKF2 412 aa46.1■■■■■ 4.97
EPB41L3-210ENST00000578431 FAM69CQ0P6D2 419 aa46.08■■■■■ 4.97
EPB41L3-210ENST00000578431 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa46.08■■■■■ 4.97
EPB41L3-210ENST00000578431 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP46.07■■■■■ 4.97
EPB41L3-210ENST00000578431 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.01■■■■■ 4.96
EPB41L3-210ENST00000578431 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP45.98■■■■■ 4.95
EPB41L3-210ENST00000578431 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP45.98■■■■■ 4.95
EPB41L3-210ENST00000578431 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa45.97■■■■■ 4.95
EPB41L3-210ENST00000578431 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.94■■■■■ 4.94
EPB41L3-210ENST00000578431 CFAP43Q8NDM7 1665 aa45.92■■■■■ 4.94
EPB41L3-210ENST00000578431 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.88■■■■■ 4.94
EPB41L3-210ENST00000578431 PLEKHD1A6NEE1 506 aa45.87■■■■■ 4.93
EPB41L3-210ENST00000578431 ABCA9Q8IUA7 1624 aa45.86■■■■■ 4.93
EPB41L3-210ENST00000578431 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP45.83■■■■■ 4.93
EPB41L3-210ENST00000578431 TSPOAP1O95153 1857 aa45.83■■■■■ 4.93
EPB41L3-210ENST00000578431 KCNH8Q96L42 1107 aa45.81■■■■■ 4.92
EPB41L3-210ENST00000578431 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP45.81■■■■■ 4.92
EPB41L3-210ENST00000578431 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP45.75■■■■■ 4.91
EPB41L3-210ENST00000578431 CD109Q6YHK3 1445 aa45.71■■■■■ 4.91
EPB41L3-210ENST00000578431 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa45.71■■■■■ 4.91
EPB41L3-210ENST00000578431 TEX14Q8IWB6 1497 aa45.68■■■■■ 4.9
EPB41L3-210ENST00000578431 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP45.67■■■■■ 4.9
EPB41L3-210ENST00000578431 KIF14Q15058 1648 aa45.67■■■■■ 4.9
EPB41L3-210ENST00000578431 TTC37Q6PGP7 1564 aa45.63■■■■■ 4.9
EPB41L3-210ENST00000578431 TIAM1Q13009 1591 aa45.56■■■■■ 4.88
EPB41L3-210ENST00000578431 MAP3K1Q13233 1512 aa45.53■■■■■ 4.88
EPB41L3-210ENST00000578431 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa45.5■■■■■ 4.87
EPB41L3-210ENST00000578431 MYO5CQ9NQX4 1742 aa45.47■■■■■ 4.87
EPB41L3-210ENST00000578431 KDM6BO15054 1643 aa45.47■■■■■ 4.87
EPB41L3-210ENST00000578431 ARAP3Q8WWN8 1544 aa45.45■■■■■ 4.87
EPB41L3-210ENST00000578431 MTUS2Q5JR59 1369 aa45.44■■■■■ 4.86
EPB41L3-210ENST00000578431 NEO1Q92859 1461 aa45.42■■■■■ 4.86
EPB41L3-210ENST00000578431 CFAP74Q9C0B2 1584 aa45.41■■■■■ 4.86
EPB41L3-210ENST00000578431 PLCH2O75038 1416 aa45.39■■■■■ 4.86
EPB41L3-210ENST00000578431 PHLDB1Q86UU1 1377 aa45.38■■■■■ 4.86
EPB41L3-210ENST00000578431 PREX2Q70Z35 1606 aa45.33■■■■■ 4.85
EPB41L3-210ENST00000578431 FANCAO15360 1455 aa45.32■■■■■ 4.85
EPB41L3-210ENST00000578431 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa45.32■■■■■ 4.85
EPB41L3-210ENST00000578431 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa45.29■■■■■ 4.84
EPB41L3-210ENST00000578431 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP45.27■■■■■ 4.84
EPB41L3-210ENST00000578431 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa45.27■■■■■ 4.84
EPB41L3-210ENST00000578431 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.27■■■■■ 4.84
EPB41L3-210ENST00000578431 ARHGAP5Q13017 1502 aa45.21■■■■■ 4.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms