RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573850.1

KIAA0556-209, Transcript of KIAA0556, humanhuman

TSL 5

Gene KIAA0556, Length 3,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556-209ENST00000573850 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.42■□□□□ 0.22
KIAA0556-209ENST00000573850 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.39■□□□□ 0.21
KIAA0556-209ENST00000573850 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
KIAA0556-209ENST00000573850 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
KIAA0556-209ENST00000573850 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.36■□□□□ 0.21
KIAA0556-209ENST00000573850 P3H3Q8IVL6 736 aa16.34■□□□□ 0.21
KIAA0556-209ENST00000573850 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
KIAA0556-209ENST00000573850 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
KIAA0556-209ENST00000573850 WDR97A6NE52 1622 aa16.3■□□□□ 0.2
KIAA0556-209ENST00000573850 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.28■□□□□ 0.2
KIAA0556-209ENST00000573850 CUL7Q14999 1698 aa16.28■□□□□ 0.2
KIAA0556-209ENST00000573850 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
KIAA0556-209ENST00000573850 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.25■□□□□ 0.19
KIAA0556-209ENST00000573850 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
KIAA0556-209ENST00000573850 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.23■□□□□ 0.19
KIAA0556-209ENST00000573850 BCANQ96GW7 911 aa16.22■□□□□ 0.19
KIAA0556-209ENST00000573850 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
KIAA0556-209ENST00000573850 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.2■□□□□ 0.18
KIAA0556-209ENST00000573850 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.2■□□□□ 0.18
KIAA0556-209ENST00000573850 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
KIAA0556-209ENST00000573850 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.16■□□□□ 0.18
KIAA0556-209ENST00000573850 ERCC6Q03468 1493 aa16.16■□□□□ 0.18
KIAA0556-209ENST00000573850 SLC24A1O60721 1099 aa16.15■□□□□ 0.18
KIAA0556-209ENST00000573850 TIAM1Q13009 1591 aa16.13■□□□□ 0.17
KIAA0556-209ENST00000573850 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
KIAA0556-209ENST00000573850 ITGAEP38570 1179 aa16.13■□□□□ 0.17
KIAA0556-209ENST00000573850 PBRM1Q86U86 1689 aa16.12■□□□□ 0.17
KIAA0556-209ENST00000573850 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.12■□□□□ 0.17
KIAA0556-209ENST00000573850 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
KIAA0556-209ENST00000573850 WDR62O43379 1518 aa16.09■□□□□ 0.17
KIAA0556-209ENST00000573850 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.08■□□□□ 0.17
KIAA0556-209ENST00000573850 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
KIAA0556-209ENST00000573850 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.08■□□□□ 0.16
KIAA0556-209ENST00000573850 IFT140Q96RY7 1462 aa16.08■□□□□ 0.16
KIAA0556-209ENST00000573850 MAP3K1Q13233 1512 aa16.07■□□□□ 0.16
KIAA0556-209ENST00000573850 GRIN2BQ13224 1484 aa16.07■□□□□ 0.16
KIAA0556-209ENST00000573850 FMN1Q68DA7 1419 aa16.05■□□□□ 0.16
KIAA0556-209ENST00000573850 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.05■□□□□ 0.16
KIAA0556-209ENST00000573850 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.04■□□□□ 0.16
KIAA0556-209ENST00000573850 ADAMTS12P58397 1594 aa16.03■□□□□ 0.16
KIAA0556-209ENST00000573850 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.03■□□□□ 0.16
KIAA0556-209ENST00000573850 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
KIAA0556-209ENST00000573850 SAMD9Q5K651 1589 aa16.02■□□□□ 0.15
KIAA0556-209ENST00000573850 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.01■□□□□ 0.15
KIAA0556-209ENST00000573850 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
KIAA0556-209ENST00000573850 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.98■□□□□ 0.15
KIAA0556-209ENST00000573850 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
KIAA0556-209ENST00000573850 IQGAP2Q13576 1575 aa15.97■□□□□ 0.15
KIAA0556-209ENST00000573850 KCNH8Q96L42 1107 aa15.96■□□□□ 0.15
KIAA0556-209ENST00000573850 FBLN2P98095 1184 aa15.95■□□□□ 0.14
KIAA0556-209ENST00000573850 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.95■□□□□ 0.14
KIAA0556-209ENST00000573850 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
KIAA0556-209ENST00000573850 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
KIAA0556-209ENST00000573850 ARID3CA6NKF2 412 aa15.92■□□□□ 0.14
KIAA0556-209ENST00000573850 FKBP8Q14318 412 aa15.92■□□□□ 0.14
KIAA0556-209ENST00000573850 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
KIAA0556-209ENST00000573850 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.91■□□□□ 0.14
KIAA0556-209ENST00000573850 MSH5O43196 834 aa15.89■□□□□ 0.13
KIAA0556-209ENST00000573850 GRIN2AQ12879 1464 aa15.89■□□□□ 0.13
KIAA0556-209ENST00000573850 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.87■□□□□ 0.13
KIAA0556-209ENST00000573850 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.86■□□□□ 0.13
KIAA0556-209ENST00000573850 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.86■□□□□ 0.13
KIAA0556-209ENST00000573850 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
KIAA0556-209ENST00000573850 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.84■□□□□ 0.13
KIAA0556-209ENST00000573850 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.83■□□□□ 0.13
KIAA0556-209ENST00000573850 HECW1Q76N89 1606 aa15.83■□□□□ 0.12
KIAA0556-209ENST00000573850 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.83■□□□□ 0.12
KIAA0556-209ENST00000573850 NCOA2Q15596 1464 aa15.82■□□□□ 0.12
KIAA0556-209ENST00000573850 SYNJ2O15056 1496 aa15.82■□□□□ 0.12
KIAA0556-209ENST00000573850 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.81■□□□□ 0.12
KIAA0556-209ENST00000573850 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
KIAA0556-209ENST00000573850 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
KIAA0556-209ENST00000573850 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa15.8■□□□□ 0.12
KIAA0556-209ENST00000573850 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
KIAA0556-209ENST00000573850 DISP1Q96F81 1524 aa15.8■□□□□ 0.12
KIAA0556-209ENST00000573850 KIAA0556O60303 1618 aa15.8■□□□□ 0.12
KIAA0556-209ENST00000573850 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.79■□□□□ 0.12
KIAA0556-209ENST00000573850 CEP170Q5SW79 1584 aa15.79■□□□□ 0.12
KIAA0556-209ENST00000573850 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
KIAA0556-209ENST00000573850 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.77■□□□□ 0.12
KIAA0556-209ENST00000573850 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.11
KIAA0556-209ENST00000573850 JPH4Q96JJ6 628 aa15.74■□□□□ 0.11
KIAA0556-209ENST00000573850 PTPRKQ15262 1439 aa15.71■□□□□ 0.1
KIAA0556-209ENST00000573850 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.71■□□□□ 0.1
KIAA0556-209ENST00000573850 ERICH6Q7L0X2 663 aa15.7■□□□□ 0.1
KIAA0556-209ENST00000573850 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.7■□□□□ 0.1
KIAA0556-209ENST00000573850 NUP160Q12769 1436 aa15.7■□□□□ 0.1
KIAA0556-209ENST00000573850 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.7■□□□□ 0.1
KIAA0556-209ENST00000573850 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.69■□□□□ 0.1
KIAA0556-209ENST00000573850 MAPKBP1O60336 1514 aa15.69■□□□□ 0.1
KIAA0556-209ENST00000573850 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
KIAA0556-209ENST00000573850 ARHGEF11O15085 1522 aa15.68■□□□□ 0.1
KIAA0556-209ENST00000573850 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.67■□□□□ 0.1
KIAA0556-209ENST00000573850 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.67■□□□□ 0.1
KIAA0556-209ENST00000573850 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
KIAA0556-209ENST00000573850 TRIM52Q96A61 297 aa15.66■□□□□ 0.1
KIAA0556-209ENST00000573850 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.65■□□□□ 0.1
KIAA0556-209ENST00000573850 DEKP35659 375 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
KIAA0556-209ENST00000573850 NEFLP07196 543 aa15.64■□□□□ 0.09
KIAA0556-209ENST00000573850 HFM1A2PYH4 1435 aa15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms