RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570732.1

NOMO3-205, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 2

Gene NOMO3, Length 643 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-205ENST00000570732 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.5■■□□□ 1.51
NOMO3-205ENST00000570732 FBLN2P98095 1184 aa24.49■■□□□ 1.51
NOMO3-205ENST00000570732 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.41■■□□□ 1.5
NOMO3-205ENST00000570732 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.39■■□□□ 1.49
NOMO3-205ENST00000570732 IQGAP2Q13576 1575 aa24.38■■□□□ 1.49
NOMO3-205ENST00000570732 NUP160Q12769 1436 aa24.38■■□□□ 1.49
NOMO3-205ENST00000570732 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.38■■□□□ 1.49
NOMO3-205ENST00000570732 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.35■■□□□ 1.49
NOMO3-205ENST00000570732 CEP170Q5SW79 1584 aa24.33■■□□□ 1.48
NOMO3-205ENST00000570732 ARAP1Q96P48 1450 aa24.32■■□□□ 1.48
NOMO3-205ENST00000570732 CHD1O14646 1710 aa24.28■■□□□ 1.48
NOMO3-205ENST00000570732 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.28■■□□□ 1.48
NOMO3-205ENST00000570732 SAMD9Q5K651 1589 aa24.25■■□□□ 1.47
NOMO3-205ENST00000570732 P3H3Q8IVL6 736 aa24.22■■□□□ 1.47
NOMO3-205ENST00000570732 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.2■■□□□ 1.46
NOMO3-205ENST00000570732 APLP2Q06481 763 aa24.2■■□□□ 1.46
NOMO3-205ENST00000570732 JPH4Q96JJ6 628 aa24.2■■□□□ 1.46
NOMO3-205ENST00000570732 FMN1Q68DA7 1419 aa24.19■■□□□ 1.46
NOMO3-205ENST00000570732 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.17■■□□□ 1.46
NOMO3-205ENST00000570732 KIAA0556O60303 1618 aa24.13■■□□□ 1.45
NOMO3-205ENST00000570732 DISP1Q96F81 1524 aa24.12■■□□□ 1.45
NOMO3-205ENST00000570732 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.07■■□□□ 1.44
NOMO3-205ENST00000570732 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.07■■□□□ 1.44
NOMO3-205ENST00000570732 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.06■■□□□ 1.44
NOMO3-205ENST00000570732 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
NOMO3-205ENST00000570732 OSCARQ8IYS5 282 aa24.05■■□□□ 1.44
NOMO3-205ENST00000570732 SHROOM2Q13796 1616 aa24.04■■□□□ 1.44
NOMO3-205ENST00000570732 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
NOMO3-205ENST00000570732 MAP3K1Q13233 1512 aa24■■□□□ 1.43
NOMO3-205ENST00000570732 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
NOMO3-205ENST00000570732 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
NOMO3-205ENST00000570732 HECW1Q76N89 1606 aa23.92■■□□□ 1.42
NOMO3-205ENST00000570732 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
NOMO3-205ENST00000570732 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
NOMO3-205ENST00000570732 PTPRGP23470 1445 aa23.91■■□□□ 1.42
NOMO3-205ENST00000570732 TIAM1Q13009 1591 aa23.91■■□□□ 1.42
NOMO3-205ENST00000570732 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.9■■□□□ 1.42
NOMO3-205ENST00000570732 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.86■■□□□ 1.41
NOMO3-205ENST00000570732 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.86■■□□□ 1.41
NOMO3-205ENST00000570732 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
NOMO3-205ENST00000570732 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.81■■□□□ 1.4
NOMO3-205ENST00000570732 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.81■■□□□ 1.4
NOMO3-205ENST00000570732 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
NOMO3-205ENST00000570732 ABCA8O94911 1581 aa23.79■■□□□ 1.4
NOMO3-205ENST00000570732 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.79■■□□□ 1.4
NOMO3-205ENST00000570732 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
NOMO3-205ENST00000570732 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.77■■□□□ 1.4
NOMO3-205ENST00000570732 UACAQ9BZF9 1416 aa23.76■■□□□ 1.39
NOMO3-205ENST00000570732 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
NOMO3-205ENST00000570732 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.74■■□□□ 1.39
NOMO3-205ENST00000570732 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
NOMO3-205ENST00000570732 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
NOMO3-205ENST00000570732 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.71■■□□□ 1.39
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NOMO3-205ENST00000570732 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
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NOMO3-205ENST00000570732 ABCC2Q92887 1545 aa23.68■■□□□ 1.38
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NOMO3-205ENST00000570732 ATP10BO94823 1461 aa23.63■■□□□ 1.37
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NOMO3-205ENST00000570732 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.59■■□□□ 1.37
NOMO3-205ENST00000570732 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
NOMO3-205ENST00000570732 ARHGEF11O15085 1522 aa23.57■■□□□ 1.36
NOMO3-205ENST00000570732 NCOA2Q15596 1464 aa23.56■■□□□ 1.36
NOMO3-205ENST00000570732 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
NOMO3-205ENST00000570732 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.54■■□□□ 1.36
NOMO3-205ENST00000570732 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.54■■□□□ 1.36
NOMO3-205ENST00000570732 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.52■■□□□ 1.36
NOMO3-205ENST00000570732 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.49■■□□□ 1.35
NOMO3-205ENST00000570732 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.48■■□□□ 1.35
NOMO3-205ENST00000570732 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
NOMO3-205ENST00000570732 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
NOMO3-205ENST00000570732 KIF14Q15058 1648 aa23.44■■□□□ 1.34
NOMO3-205ENST00000570732 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.44■■□□□ 1.34
NOMO3-205ENST00000570732 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
NOMO3-205ENST00000570732 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.44■■□□□ 1.34
NOMO3-205ENST00000570732 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.44■■□□□ 1.34
NOMO3-205ENST00000570732 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.44■■□□□ 1.34
NOMO3-205ENST00000570732 MIA2Q96PC5 1412 aa23.42■■□□□ 1.34
NOMO3-205ENST00000570732 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NOMO3-205ENST00000570732 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.37■■□□□ 1.33
NOMO3-205ENST00000570732 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.34■■□□□ 1.33
NOMO3-205ENST00000570732 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.34■■□□□ 1.33
NOMO3-205ENST00000570732 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.34■■□□□ 1.33
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NOMO3-205ENST00000570732 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
NOMO3-205ENST00000570732 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.32■■□□□ 1.32
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NOMO3-205ENST00000570732 ASXL2Q76L83 1435 aa23.3■■□□□ 1.32
NOMO3-205ENST00000570732 ITGAEP38570 1179 aa23.26■■□□□ 1.31
NOMO3-205ENST00000570732 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
NOMO3-205ENST00000570732 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.21■■□□□ 1.31
NOMO3-205ENST00000570732 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.2■■□□□ 1.3
NOMO3-205ENST00000570732 MAPKBP1O60336 1514 aa23.2■■□□□ 1.3
NOMO3-205ENST00000570732 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
NOMO3-205ENST00000570732 PREX2Q70Z35 1606 aa23.19■■□□□ 1.3
NOMO3-205ENST00000570732 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.19■■□□□ 1.3
NOMO3-205ENST00000570732 PLCH2O75038 1416 aa23.17■■□□□ 1.3
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