RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570360.1

ITGAE-202, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 2

Gene ITGAE, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-202ENST00000570360 IQGAP2Q13576 1575 aa27.9■■■□□ 2.06
ITGAE-202ENST00000570360 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.9■■■□□ 2.06
ITGAE-202ENST00000570360 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.86■■■□□ 2.05
ITGAE-202ENST00000570360 SHROOM2Q13796 1616 aa27.85■■■□□ 2.05
ITGAE-202ENST00000570360 OSCARQ8IYS5 282 aa27.84■■■□□ 2.05
ITGAE-202ENST00000570360 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
ITGAE-202ENST00000570360 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.81■■■□□ 2.04
ITGAE-202ENST00000570360 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.76■■■□□ 2.03
ITGAE-202ENST00000570360 SAMD9Q5K651 1589 aa27.7■■■□□ 2.03
ITGAE-202ENST00000570360 KIAA0556O60303 1618 aa27.66■■■□□ 2.02
ITGAE-202ENST00000570360 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.65■■■□□ 2.02
ITGAE-202ENST00000570360 JPH4Q96JJ6 628 aa27.65■■■□□ 2.02
ITGAE-202ENST00000570360 DISP1Q96F81 1524 aa27.65■■■□□ 2.02
ITGAE-202ENST00000570360 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.64■■■□□ 2.02
ITGAE-202ENST00000570360 CEP162Q5TB80 1403 aa27.62■■■□□ 2.01
ITGAE-202ENST00000570360 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
ITGAE-202ENST00000570360 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.58■■■□□ 2.01
ITGAE-202ENST00000570360 CLIP1P30622 1438 aa27.57■■■□□ 2
ITGAE-202ENST00000570360 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
ITGAE-202ENST00000570360 ARHGEF11O15085 1522 aa27.54■■■□□ 2
ITGAE-202ENST00000570360 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.53■■■□□ 2
ITGAE-202ENST00000570360 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.53■■■□□ 2
ITGAE-202ENST00000570360 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.53■■■□□ 2
ITGAE-202ENST00000570360 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.52■■■□□ 2
ITGAE-202ENST00000570360 ARAP1Q96P48 1450 aa27.47■■□□□ 1.99
ITGAE-202ENST00000570360 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.47■■□□□ 1.99
ITGAE-202ENST00000570360 P3H3Q8IVL6 736 aa27.42■■□□□ 1.98
ITGAE-202ENST00000570360 PTPRGP23470 1445 aa27.33■■□□□ 1.96
ITGAE-202ENST00000570360 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.31■■□□□ 1.96
ITGAE-202ENST00000570360 ABCA8O94911 1581 aa27.3■■□□□ 1.96
ITGAE-202ENST00000570360 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
ITGAE-202ENST00000570360 FMN1Q68DA7 1419 aa27.29■■□□□ 1.96
ITGAE-202ENST00000570360 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.29■■□□□ 1.96
ITGAE-202ENST00000570360 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.25■■□□□ 1.95
ITGAE-202ENST00000570360 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
ITGAE-202ENST00000570360 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.24■■□□□ 1.95
ITGAE-202ENST00000570360 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.24■■□□□ 1.95
ITGAE-202ENST00000570360 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.23■■□□□ 1.95
ITGAE-202ENST00000570360 ABCC2Q92887 1545 aa27.21■■□□□ 1.95
ITGAE-202ENST00000570360 HECW1Q76N89 1606 aa27.19■■□□□ 1.94
ITGAE-202ENST00000570360 UACAQ9BZF9 1416 aa27.19■■□□□ 1.94
ITGAE-202ENST00000570360 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.19■■□□□ 1.94
ITGAE-202ENST00000570360 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.19■■□□□ 1.94
ITGAE-202ENST00000570360 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.18■■□□□ 1.94
ITGAE-202ENST00000570360 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
ITGAE-202ENST00000570360 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.1■■□□□ 1.93
ITGAE-202ENST00000570360 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
ITGAE-202ENST00000570360 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.08■■□□□ 1.92
ITGAE-202ENST00000570360 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
ITGAE-202ENST00000570360 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.06■■□□□ 1.92
ITGAE-202ENST00000570360 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
ITGAE-202ENST00000570360 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.02■■□□□ 1.92
ITGAE-202ENST00000570360 ATP10BO94823 1461 aa27.01■■□□□ 1.91
ITGAE-202ENST00000570360 TIAM1Q13009 1591 aa26.99■■□□□ 1.91
ITGAE-202ENST00000570360 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
ITGAE-202ENST00000570360 MAP3K1Q13233 1512 aa26.95■■□□□ 1.91
ITGAE-202ENST00000570360 ARID3CA6NKF2 412 aa26.95■■□□□ 1.9
ITGAE-202ENST00000570360 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.9■■□□□ 1.9
ITGAE-202ENST00000570360 MAPKBP1O60336 1514 aa26.89■■□□□ 1.89
ITGAE-202ENST00000570360 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.82■■□□□ 1.88
ITGAE-202ENST00000570360 ASXL2Q76L83 1435 aa26.82■■□□□ 1.88
ITGAE-202ENST00000570360 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
ITGAE-202ENST00000570360 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.81■■□□□ 1.88
ITGAE-202ENST00000570360 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.8■■□□□ 1.88
ITGAE-202ENST00000570360 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
ITGAE-202ENST00000570360 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
ITGAE-202ENST00000570360 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
ITGAE-202ENST00000570360 KIF14Q15058 1648 aa26.77■■□□□ 1.88
ITGAE-202ENST00000570360 APLP2Q06481 763 aa26.76■■□□□ 1.87
ITGAE-202ENST00000570360 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
ITGAE-202ENST00000570360 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
ITGAE-202ENST00000570360 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.73■■□□□ 1.87
ITGAE-202ENST00000570360 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
ITGAE-202ENST00000570360 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.71■■□□□ 1.87
ITGAE-202ENST00000570360 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.7■■□□□ 1.87
ITGAE-202ENST00000570360 DIP2BQ9P265 1576 aa26.7■■□□□ 1.86
ITGAE-202ENST00000570360 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.67■■□□□ 1.86
ITGAE-202ENST00000570360 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.66■■□□□ 1.86
ITGAE-202ENST00000570360 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
ITGAE-202ENST00000570360 GLI2P10070 1586 aa26.64■■□□□ 1.86
ITGAE-202ENST00000570360 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.63■■□□□ 1.85
ITGAE-202ENST00000570360 NCOA2Q15596 1464 aa26.62■■□□□ 1.85
ITGAE-202ENST00000570360 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.62■■□□□ 1.85
ITGAE-202ENST00000570360 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.61■■□□□ 1.85
ITGAE-202ENST00000570360 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.6■■□□□ 1.85
ITGAE-202ENST00000570360 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
ITGAE-202ENST00000570360 KCNH8Q96L42 1107 aa26.58■■□□□ 1.85
ITGAE-202ENST00000570360 PREX2Q70Z35 1606 aa26.57■■□□□ 1.84
ITGAE-202ENST00000570360 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.57■■□□□ 1.84
ITGAE-202ENST00000570360 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.55■■□□□ 1.84
ITGAE-202ENST00000570360 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
ITGAE-202ENST00000570360 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.49■■□□□ 1.83
ITGAE-202ENST00000570360 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
ITGAE-202ENST00000570360 TSPOAP1O95153 1857 aa26.49■■□□□ 1.83
ITGAE-202ENST00000570360 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.47■■□□□ 1.83
ITGAE-202ENST00000570360 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.46■■□□□ 1.83
ITGAE-202ENST00000570360 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.46■■□□□ 1.83
ITGAE-202ENST00000570360 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.45■■□□□ 1.82
ITGAE-202ENST00000570360 CD109Q6YHK3 1445 aa26.43■■□□□ 1.82
ITGAE-202ENST00000570360 PLCH2O75038 1416 aa26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.4 ms