RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 GRIN2AQ12879 1464 aa30.51■■■□□ 2.48
SPNS1-210ENST00000568388 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.48■■■□□ 2.47
SPNS1-210ENST00000568388 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.44■■■□□ 2.46
SPNS1-210ENST00000568388 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
SPNS1-210ENST00000568388 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.39■■■□□ 2.46
SPNS1-210ENST00000568388 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.37■■■□□ 2.45
SPNS1-210ENST00000568388 NUP160Q12769 1436 aa30.37■■■□□ 2.45
SPNS1-210ENST00000568388 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.36■■■□□ 2.45
SPNS1-210ENST00000568388 ARAP1Q96P48 1450 aa30.33■■■□□ 2.45
SPNS1-210ENST00000568388 CEP170Q5SW79 1584 aa30.32■■■□□ 2.45
SPNS1-210ENST00000568388 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.28■■■□□ 2.44
SPNS1-210ENST00000568388 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.24■■■□□ 2.43
SPNS1-210ENST00000568388 IQGAP2Q13576 1575 aa30.21■■■□□ 2.43
SPNS1-210ENST00000568388 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.1■■■□□ 2.41
SPNS1-210ENST00000568388 CEP162Q5TB80 1403 aa30.08■■■□□ 2.41
SPNS1-210ENST00000568388 SHROOM2Q13796 1616 aa30.07■■■□□ 2.4
SPNS1-210ENST00000568388 JPH4Q96JJ6 628 aa30.06■■■□□ 2.4
SPNS1-210ENST00000568388 CLIP1P30622 1438 aa30.03■■■□□ 2.4
SPNS1-210ENST00000568388 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.01■■■□□ 2.39
SPNS1-210ENST00000568388 SAMD9Q5K651 1589 aa30■■■□□ 2.39
SPNS1-210ENST00000568388 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.98■■■□□ 2.39
SPNS1-210ENST00000568388 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.97■■■□□ 2.39
SPNS1-210ENST00000568388 DISP1Q96F81 1524 aa29.94■■■□□ 2.38
SPNS1-210ENST00000568388 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.91■■■□□ 2.38
SPNS1-210ENST00000568388 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
SPNS1-210ENST00000568388 KIAA0556O60303 1618 aa29.91■■■□□ 2.38
SPNS1-210ENST00000568388 P3H3Q8IVL6 736 aa29.81■■■□□ 2.36
SPNS1-210ENST00000568388 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.79■■■□□ 2.36
SPNS1-210ENST00000568388 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
SPNS1-210ENST00000568388 FMN1Q68DA7 1419 aa29.71■■■□□ 2.35
SPNS1-210ENST00000568388 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.69■■■□□ 2.34
SPNS1-210ENST00000568388 PTPRGP23470 1445 aa29.67■■■□□ 2.34
SPNS1-210ENST00000568388 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.58■■■□□ 2.33
SPNS1-210ENST00000568388 ABCA8O94911 1581 aa29.55■■■□□ 2.32
SPNS1-210ENST00000568388 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.54■■■□□ 2.32
SPNS1-210ENST00000568388 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
SPNS1-210ENST00000568388 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.54■■■□□ 2.32
SPNS1-210ENST00000568388 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
SPNS1-210ENST00000568388 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.51■■■□□ 2.31
SPNS1-210ENST00000568388 UACAQ9BZF9 1416 aa29.5■■■□□ 2.31
SPNS1-210ENST00000568388 HECW1Q76N89 1606 aa29.48■■■□□ 2.31
SPNS1-210ENST00000568388 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.47■■■□□ 2.31
SPNS1-210ENST00000568388 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.45■■■□□ 2.31
SPNS1-210ENST00000568388 ABCC2Q92887 1545 aa29.44■■■□□ 2.3
SPNS1-210ENST00000568388 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
SPNS1-210ENST00000568388 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.42■■■□□ 2.3
SPNS1-210ENST00000568388 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.41■■■□□ 2.3
SPNS1-210ENST00000568388 MAP3K1Q13233 1512 aa29.4■■■□□ 2.3
SPNS1-210ENST00000568388 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.37■■■□□ 2.29
SPNS1-210ENST00000568388 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
SPNS1-210ENST00000568388 APLP2Q06481 763 aa29.33■■■□□ 2.29
SPNS1-210ENST00000568388 MAPKBP1O60336 1514 aa29.33■■■□□ 2.29
SPNS1-210ENST00000568388 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.32■■■□□ 2.28
SPNS1-210ENST00000568388 TIAM1Q13009 1591 aa29.31■■■□□ 2.28
SPNS1-210ENST00000568388 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.3■■■□□ 2.28
SPNS1-210ENST00000568388 ATP10BO94823 1461 aa29.3■■■□□ 2.28
SPNS1-210ENST00000568388 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
SPNS1-210ENST00000568388 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
SPNS1-210ENST00000568388 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.24■■■□□ 2.27
SPNS1-210ENST00000568388 DIP2BQ9P265 1576 aa29.23■■■□□ 2.27
SPNS1-210ENST00000568388 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.23■■■□□ 2.27
SPNS1-210ENST00000568388 ARID3CA6NKF2 412 aa29.2■■■□□ 2.26
SPNS1-210ENST00000568388 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
SPNS1-210ENST00000568388 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
SPNS1-210ENST00000568388 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
SPNS1-210ENST00000568388 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.17■■■□□ 2.26
SPNS1-210ENST00000568388 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
SPNS1-210ENST00000568388 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.13■■■□□ 2.25
SPNS1-210ENST00000568388 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.13■■■□□ 2.25
SPNS1-210ENST00000568388 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.11■■■□□ 2.25
SPNS1-210ENST00000568388 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.11■■■□□ 2.25
SPNS1-210ENST00000568388 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.11■■■□□ 2.25
SPNS1-210ENST00000568388 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
SPNS1-210ENST00000568388 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
SPNS1-210ENST00000568388 ASXL2Q76L83 1435 aa29.02■■■□□ 2.24
SPNS1-210ENST00000568388 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
SPNS1-210ENST00000568388 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.01■■■□□ 2.23
SPNS1-210ENST00000568388 TSPOAP1O95153 1857 aa29.01■■■□□ 2.23
SPNS1-210ENST00000568388 KIF14Q15058 1648 aa28.95■■■□□ 2.23
SPNS1-210ENST00000568388 GLI2P10070 1586 aa28.93■■■□□ 2.22
SPNS1-210ENST00000568388 NCOA2Q15596 1464 aa28.93■■■□□ 2.22
SPNS1-210ENST00000568388 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
SPNS1-210ENST00000568388 KCNH8Q96L42 1107 aa28.88■■■□□ 2.21
SPNS1-210ENST00000568388 KDM6BO15054 1643 aa28.87■■■□□ 2.21
SPNS1-210ENST00000568388 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.213e-6■■□□□ 13.1
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SPNS1-210ENST00000568388 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.83■■■□□ 2.21
SPNS1-210ENST00000568388 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.82■■■□□ 2.2
SPNS1-210ENST00000568388 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.8■■■□□ 2.2
SPNS1-210ENST00000568388 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.8■■■□□ 2.2
SPNS1-210ENST00000568388 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.8■■■□□ 2.2
SPNS1-210ENST00000568388 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.79■■■□□ 2.2
SPNS1-210ENST00000568388 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.78■■■□□ 2.2
SPNS1-210ENST00000568388 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
SPNS1-210ENST00000568388 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.77■■■□□ 2.2
SPNS1-210ENST00000568388 PREX2Q70Z35 1606 aa28.73■■■□□ 2.19
SPNS1-210ENST00000568388 MIA2Q96PC5 1412 aa28.73■■■□□ 2.19
SPNS1-210ENST00000568388 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.73■■■□□ 2.19
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