RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567316.1

CTU2-209, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-209ENST00000567316 GOLGA3Q08378 1498 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU2-209ENST00000567316 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU2-209ENST00000567316 ARHGEF11O15085 1522 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU2-209ENST00000567316 NUP160Q12769 1436 aa25.21■■□□□ 1.63
CTU2-209ENST00000567316 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.21■■□□□ 1.63
CTU2-209ENST00000567316 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU2-209ENST00000567316 CEP170Q5SW79 1584 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU2-209ENST00000567316 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
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CTU2-209ENST00000567316 SHROOM2Q13796 1616 aa25.05■■□□□ 1.6
CTU2-209ENST00000567316 ARAP1Q96P48 1450 aa25.04■■□□□ 1.6
CTU2-209ENST00000567316 IQGAP2Q13576 1575 aa25.02■■□□□ 1.6
CTU2-209ENST00000567316 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.01■■□□□ 1.59
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CTU2-209ENST00000567316 JPH4Q96JJ6 628 aa24.92■■□□□ 1.58
CTU2-209ENST00000567316 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.91■■□□□ 1.58
CTU2-209ENST00000567316 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.88■■□□□ 1.57
CTU2-209ENST00000567316 CEP162Q5TB80 1403 aa24.86■■□□□ 1.57
CTU2-209ENST00000567316 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
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CTU2-209ENST00000567316 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.81■■□□□ 1.56
CTU2-209ENST00000567316 CLIP1P30622 1438 aa24.8■■□□□ 1.56
CTU2-209ENST00000567316 KIAA0556O60303 1618 aa24.79■■□□□ 1.56
CTU2-209ENST00000567316 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.78■■□□□ 1.56
CTU2-209ENST00000567316 DISP1Q96F81 1524 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-209ENST00000567316 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.69■■□□□ 1.54
CTU2-209ENST00000567316 P3H3Q8IVL6 736 aa24.67■■□□□ 1.54
CTU2-209ENST00000567316 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.65■■□□□ 1.54
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CTU2-209ENST00000567316 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.52■■□□□ 1.52
CTU2-209ENST00000567316 FMN1Q68DA7 1419 aa24.52■■□□□ 1.52
CTU2-209ENST00000567316 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.52■■□□□ 1.52
CTU2-209ENST00000567316 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CTU2-209ENST00000567316 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.51■■□□□ 1.51
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CTU2-209ENST00000567316 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
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CTU2-209ENST00000567316 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.45■■□□□ 1.5
CTU2-209ENST00000567316 MAPKBP1O60336 1514 aa24.42■■□□□ 1.5
CTU2-209ENST00000567316 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.42■■□□□ 1.5
CTU2-209ENST00000567316 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.42■■□□□ 1.5
CTU2-209ENST00000567316 UACAQ9BZF9 1416 aa24.42■■□□□ 1.5
CTU2-209ENST00000567316 HECW1Q76N89 1606 aa24.42■■□□□ 1.5
CTU2-209ENST00000567316 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.41■■□□□ 1.5
CTU2-209ENST00000567316 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.5
CTU2-209ENST00000567316 ABCC2Q92887 1545 aa24.38■■□□□ 1.49
CTU2-209ENST00000567316 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.35■■□□□ 1.49
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CTU2-209ENST00000567316 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.32■■□□□ 1.48
CTU2-209ENST00000567316 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.31■■□□□ 1.48
CTU2-209ENST00000567316 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CTU2-209ENST00000567316 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.29■■□□□ 1.48
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CTU2-209ENST00000567316 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.26■■□□□ 1.47
CTU2-209ENST00000567316 MAP3K1Q13233 1512 aa24.25■■□□□ 1.47
CTU2-209ENST00000567316 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
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CTU2-209ENST00000567316 ATP10BO94823 1461 aa24.22■■□□□ 1.47
CTU2-209ENST00000567316 ASXL2Q76L83 1435 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-209ENST00000567316 ARID3CA6NKF2 412 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-209ENST00000567316 APLP2Q06481 763 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-209ENST00000567316 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.17■■□□□ 1.46
CTU2-209ENST00000567316 GLI2P10070 1586 aa24.15■■□□□ 1.46
CTU2-209ENST00000567316 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.14■■□□□ 1.45
CTU2-209ENST00000567316 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
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CTU2-209ENST00000567316 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-209ENST00000567316 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.09■■□□□ 1.45
CTU2-209ENST00000567316 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CTU2-209ENST00000567316 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.07■■□□□ 1.44
CTU2-209ENST00000567316 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
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CTU2-209ENST00000567316 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.03■■□□□ 1.44
CTU2-209ENST00000567316 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CTU2-209ENST00000567316 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CTU2-209ENST00000567316 KIF14Q15058 1648 aa24.02■■□□□ 1.44
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CTU2-209ENST00000567316 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.01■■□□□ 1.43
CTU2-209ENST00000567316 TSPOAP1O95153 1857 aa24■■□□□ 1.43
CTU2-209ENST00000567316 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CTU2-209ENST00000567316 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.95■■□□□ 1.42
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CTU2-209ENST00000567316 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.91■■□□□ 1.42
CTU2-209ENST00000567316 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.91■■□□□ 1.42
CTU2-209ENST00000567316 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
CTU2-209ENST00000567316 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.89■■□□□ 1.42
CTU2-209ENST00000567316 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.89■■□□□ 1.42
CTU2-209ENST00000567316 KCNH8Q96L42 1107 aa23.89■■□□□ 1.41
CTU2-209ENST00000567316 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.88■■□□□ 1.41
CTU2-209ENST00000567316 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.87■■□□□ 1.41
CTU2-209ENST00000567316 CD109Q6YHK3 1445 aa23.85■■□□□ 1.41
CTU2-209ENST00000567316 KDM6BO15054 1643 aa23.84■■□□□ 1.41
CTU2-209ENST00000567316 PREX2Q70Z35 1606 aa23.84■■□□□ 1.41
CTU2-209ENST00000567316 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.82■■□□□ 1.4
CTU2-209ENST00000567316 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.78■■□□□ 1.4
CTU2-209ENST00000567316 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
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