RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567180.2

SCX-201, Transcript of scleraxis bHLH transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCX, Length 999 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCX-201ENST00000567180 PRXQ9BXM0 1461 aa43.89■■■■■ 4.62
SCX-201ENST00000567180 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.85■■■■■ 4.61
SCX-201ENST00000567180 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.85■■■■■ 4.61
SCX-201ENST00000567180 SHROOM2Q13796 1616 aa43.81■■■■■ 4.6
SCX-201ENST00000567180 JPH4Q96JJ6 628 aa43.7■■■■■ 4.59
SCX-201ENST00000567180 IQGAP2Q13576 1575 aa43.7■■■■■ 4.59
SCX-201ENST00000567180 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.69■■■■■ 4.58
SCX-201ENST00000567180 KIF21BO75037 1637 aa43.66■■■■■ 4.58
SCX-201ENST00000567180 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.61■■■■■ 4.57
SCX-201ENST00000567180 ARAP1Q96P48 1450 aa43.57■■■■■ 4.56
SCX-201ENST00000567180 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.52■■■■■ 4.56
SCX-201ENST00000567180 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.48■■■■■ 4.55
SCX-201ENST00000567180 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.46■■■■■ 4.55
SCX-201ENST00000567180 GOLGA3Q08378 1498 aa43.42■■■■■ 4.54
SCX-201ENST00000567180 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.42■■■■■ 4.54
SCX-201ENST00000567180 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
SCX-201ENST00000567180 DISP1Q96F81 1524 aa43.25■■■■■ 4.51
SCX-201ENST00000567180 KIAA0556O60303 1618 aa43.25■■■■■ 4.51
SCX-201ENST00000567180 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.22■■■■■ 4.51
SCX-201ENST00000567180 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.22■■■■■ 4.51
SCX-201ENST00000567180 PTPRGP23470 1445 aa43.15■■■■■ 4.5
SCX-201ENST00000567180 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.05■■■■■ 4.48
SCX-201ENST00000567180 SAMD9Q5K651 1589 aa43.05■■■■■ 4.48
SCX-201ENST00000567180 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.01■■■■■ 4.48
SCX-201ENST00000567180 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
SCX-201ENST00000567180 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.9■■■■■ 4.46
SCX-201ENST00000567180 P3H3Q8IVL6 736 aa42.89■■■■■ 4.46
SCX-201ENST00000567180 UACAQ9BZF9 1416 aa42.88■■■■■ 4.45
SCX-201ENST00000567180 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.87■■■■■ 4.45
SCX-201ENST00000567180 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.82■■■■■ 4.45
SCX-201ENST00000567180 ABCC2Q92887 1545 aa42.81■■■■■ 4.44
SCX-201ENST00000567180 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.77■■■■■ 4.44
SCX-201ENST00000567180 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.72■■■■■ 4.43
SCX-201ENST00000567180 ABCA8O94911 1581 aa42.72■■■■■ 4.43
SCX-201ENST00000567180 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.7■■■■■ 4.43
SCX-201ENST00000567180 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.63■■■■■ 4.41
SCX-201ENST00000567180 MAPKBP1O60336 1514 aa42.62■■■■■ 4.41
SCX-201ENST00000567180 CLIP1P30622 1438 aa42.61■■■■■ 4.41
SCX-201ENST00000567180 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.6■■■■■ 4.41
SCX-201ENST00000567180 FMN1Q68DA7 1419 aa42.59■■■■■ 4.41
SCX-201ENST00000567180 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.57■■■■■ 4.41
SCX-201ENST00000567180 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
SCX-201ENST00000567180 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.55■■■■■ 4.4
SCX-201ENST00000567180 CEP162Q5TB80 1403 aa42.47■■■■■ 4.39
SCX-201ENST00000567180 ASXL2Q76L83 1435 aa42.4■■■■■ 4.38
SCX-201ENST00000567180 HECW1Q76N89 1606 aa42.38■■■■■ 4.37
SCX-201ENST00000567180 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
SCX-201ENST00000567180 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.35■■■■■ 4.37
SCX-201ENST00000567180 ATP10BO94823 1461 aa42.33■■■■■ 4.37
SCX-201ENST00000567180 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.32■■■■■ 4.37
SCX-201ENST00000567180 ARID3CA6NKF2 412 aa42.31■■■■■ 4.36
SCX-201ENST00000567180 DIP2BQ9P265 1576 aa42.31■■■■■ 4.36
SCX-201ENST00000567180 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
SCX-201ENST00000567180 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
SCX-201ENST00000567180 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.28■■■■■ 4.36
SCX-201ENST00000567180 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
SCX-201ENST00000567180 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.24■■■■■ 4.35
SCX-201ENST00000567180 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
SCX-201ENST00000567180 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.22■■■■■ 4.35
SCX-201ENST00000567180 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.18■■■■■ 4.34
SCX-201ENST00000567180 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
SCX-201ENST00000567180 GLI2P10070 1586 aa42.16■■■■■ 4.34
SCX-201ENST00000567180 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.11■■■■■ 4.33
SCX-201ENST00000567180 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
SCX-201ENST00000567180 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.1■■■■■ 4.33
SCX-201ENST00000567180 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
SCX-201ENST00000567180 KCNH8Q96L42 1107 aa42.05■■■■■ 4.32
SCX-201ENST00000567180 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.05■■■■■ 4.32
SCX-201ENST00000567180 TSPOAP1O95153 1857 aa42■■■■■ 4.31
SCX-201ENST00000567180 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.98■■■■■ 4.31
SCX-201ENST00000567180 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.98■■■■■ 4.31
SCX-201ENST00000567180 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.97■■■■■ 4.31
SCX-201ENST00000567180 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.89■■■■■ 4.3
SCX-201ENST00000567180 CD109Q6YHK3 1445 aa41.85■■■■■ 4.29
SCX-201ENST00000567180 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.85■■■■■ 4.29
SCX-201ENST00000567180 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
SCX-201ENST00000567180 KIF14Q15058 1648 aa41.8■■■■■ 4.28
SCX-201ENST00000567180 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
SCX-201ENST00000567180 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.75■■■■■ 4.27
SCX-201ENST00000567180 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.73■■■■■ 4.27
SCX-201ENST00000567180 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.68■■■■■ 4.26
SCX-201ENST00000567180 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.68■■■■■ 4.26
SCX-201ENST00000567180 TIAM1Q13009 1591 aa41.65■■■■■ 4.26
SCX-201ENST00000567180 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.63■■■■■ 4.25
SCX-201ENST00000567180 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.62■■■■■ 4.25
SCX-201ENST00000567180 APLP2Q06481 763 aa41.62■■■■■ 4.25
SCX-201ENST00000567180 KDM6BO15054 1643 aa41.62■■■■■ 4.25
SCX-201ENST00000567180 MAP3K1Q13233 1512 aa41.6■■■■■ 4.25
SCX-201ENST00000567180 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.58■■■■■ 4.25
SCX-201ENST00000567180 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.54■■■■■ 4.24
SCX-201ENST00000567180 NEO1Q92859 1461 aa41.53■■■■■ 4.24
SCX-201ENST00000567180 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.5■■■■■ 4.23
SCX-201ENST00000567180 PLCH2O75038 1416 aa41.5■■■■■ 4.23
SCX-201ENST00000567180 FANCAO15360 1455 aa41.47■■■■■ 4.23
SCX-201ENST00000567180 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
SCX-201ENST00000567180 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.43■■■■■ 4.22
SCX-201ENST00000567180 PREX2Q70Z35 1606 aa41.42■■■■■ 4.22
SCX-201ENST00000567180 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.41■■■■■ 4.22
SCX-201ENST00000567180 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.4■■■■■ 4.22
SCX-201ENST00000567180 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.38■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms