RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566954.1

BX255925.1-201, humanhuman

BASIC

Gene BX255925.1, Length 1,854 nt, Biotype sense overlapping.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BX255925.1-201ENST00000566954 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
BX255925.1-201ENST00000566954 SYNJ2O15056 1496 aa39.19■■■■□ 3.86
BX255925.1-201ENST00000566954 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.16■■■■□ 3.86
BX255925.1-201ENST00000566954 FBLN2P98095 1184 aa39.12■■■■□ 3.85
BX255925.1-201ENST00000566954 GRIN2AQ12879 1464 aa39.12■■■■□ 3.85
BX255925.1-201ENST00000566954 ARAP1Q96P48 1450 aa39.11■■■■□ 3.85
BX255925.1-201ENST00000566954 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
BX255925.1-201ENST00000566954 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.02■■■■□ 3.84
BX255925.1-201ENST00000566954 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.01■■■■□ 3.83
BX255925.1-201ENST00000566954 APLP2Q06481 763 aa38.94■■■■□ 3.82
BX255925.1-201ENST00000566954 NUP160Q12769 1436 aa38.87■■■■□ 3.81
BX255925.1-201ENST00000566954 CEP170Q5SW79 1584 aa38.86■■■■□ 3.81
BX255925.1-201ENST00000566954 CHD1O14646 1710 aa38.86■■■■□ 3.81
BX255925.1-201ENST00000566954 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.85■■■■□ 3.81
BX255925.1-201ENST00000566954 IQGAP2Q13576 1575 aa38.83■■■■□ 3.81
BX255925.1-201ENST00000566954 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.81■■■■□ 3.8
BX255925.1-201ENST00000566954 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.76■■■■□ 3.79
BX255925.1-201ENST00000566954 P3H3Q8IVL6 736 aa38.66■■■■□ 3.78
BX255925.1-201ENST00000566954 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.64■■■■□ 3.78
BX255925.1-201ENST00000566954 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP38.62■■■■□ 3.77
BX255925.1-201ENST00000566954 SAMD9Q5K651 1589 aa38.62■■■■□ 3.77
BX255925.1-201ENST00000566954 JPH4Q96JJ6 628 aa38.59■■■■□ 3.77
BX255925.1-201ENST00000566954 MAP3K1Q13233 1512 aa38.58■■■■□ 3.77
BX255925.1-201ENST00000566954 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.58■■■■□ 3.77
BX255925.1-201ENST00000566954 DISP1Q96F81 1524 aa38.49■■■■□ 3.75
BX255925.1-201ENST00000566954 TIAM1Q13009 1591 aa38.46■■■■□ 3.75
BX255925.1-201ENST00000566954 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.44■■■■□ 3.74
BX255925.1-201ENST00000566954 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
BX255925.1-201ENST00000566954 KIAA0556O60303 1618 aa38.43■■■■□ 3.74
BX255925.1-201ENST00000566954 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
BX255925.1-201ENST00000566954 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.4■■■■□ 3.74
BX255925.1-201ENST00000566954 OSCARQ8IYS5 282 aa38.4■■■■□ 3.74
BX255925.1-201ENST00000566954 FMN1Q68DA7 1419 aa38.39■■■■□ 3.74
BX255925.1-201ENST00000566954 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.39■■■■□ 3.74
BX255925.1-201ENST00000566954 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.38■■■■□ 3.73
BX255925.1-201ENST00000566954 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
BX255925.1-201ENST00000566954 SHROOM2Q13796 1616 aa38.36■■■■□ 3.73
BX255925.1-201ENST00000566954 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.35■■■■□ 3.73
BX255925.1-201ENST00000566954 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.25■■■■□ 3.71
BX255925.1-201ENST00000566954 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.25■■■■□ 3.71
BX255925.1-201ENST00000566954 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.2■■■■□ 3.71
BX255925.1-201ENST00000566954 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.2■■■■□ 3.71
BX255925.1-201ENST00000566954 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP38.18■■■■□ 3.7
BX255925.1-201ENST00000566954 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.15■■■■□ 3.7
BX255925.1-201ENST00000566954 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
BX255925.1-201ENST00000566954 PTPRGP23470 1445 aa38.08■■■■□ 3.69
BX255925.1-201ENST00000566954 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.07■■■■□ 3.68
BX255925.1-201ENST00000566954 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.02■■■■□ 3.68
BX255925.1-201ENST00000566954 HECW1Q76N89 1606 aa37.99■■■■□ 3.67
BX255925.1-201ENST00000566954 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.99■■■■□ 3.67
BX255925.1-201ENST00000566954 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.97■■■■□ 3.67
BX255925.1-201ENST00000566954 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.93■■■■□ 3.66
BX255925.1-201ENST00000566954 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.92■■■■□ 3.66
BX255925.1-201ENST00000566954 ABCA8O94911 1581 aa37.91■■■■□ 3.66
BX255925.1-201ENST00000566954 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.9■■■■□ 3.66
BX255925.1-201ENST00000566954 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
BX255925.1-201ENST00000566954 ARID3CA6NKF2 412 aa37.88■■■■□ 3.65
BX255925.1-201ENST00000566954 UACAQ9BZF9 1416 aa37.84■■■■□ 3.65
BX255925.1-201ENST00000566954 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.83■■■■□ 3.65
BX255925.1-201ENST00000566954 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.83■■■■□ 3.65
BX255925.1-201ENST00000566954 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.65
BX255925.1-201ENST00000566954 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
BX255925.1-201ENST00000566954 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.74■■■■□ 3.63
BX255925.1-201ENST00000566954 ARHGEF11O15085 1522 aa37.72■■■■□ 3.63
BX255925.1-201ENST00000566954 ABCC2Q92887 1545 aa37.72■■■■□ 3.63
BX255925.1-201ENST00000566954 ATP10BO94823 1461 aa37.69■■■■□ 3.62
BX255925.1-201ENST00000566954 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.66■■■■□ 3.62
BX255925.1-201ENST00000566954 NCOA2Q15596 1464 aa37.66■■■■□ 3.62
BX255925.1-201ENST00000566954 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.66■■■■□ 3.62
BX255925.1-201ENST00000566954 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.65■■■■□ 3.62
BX255925.1-201ENST00000566954 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.64■■■■□ 3.62
BX255925.1-201ENST00000566954 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
BX255925.1-201ENST00000566954 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.58■■■■□ 3.61
BX255925.1-201ENST00000566954 CLSPNQ9HAW4 1339 aa37.56■■■■□ 3.6
BX255925.1-201ENST00000566954 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.55■■■■□ 3.6
BX255925.1-201ENST00000566954 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.55■■■■□ 3.6
BX255925.1-201ENST00000566954 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.55■■■■□ 3.6
BX255925.1-201ENST00000566954 ITGAEP38570 1179 aa37.54■■■■□ 3.6
BX255925.1-201ENST00000566954 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.54■■■■□ 3.6
BX255925.1-201ENST00000566954 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.52■■■■□ 3.6
BX255925.1-201ENST00000566954 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.52■■■■□ 3.6
BX255925.1-201ENST00000566954 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
BX255925.1-201ENST00000566954 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
BX255925.1-201ENST00000566954 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.44■■■■□ 3.58
BX255925.1-201ENST00000566954 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
BX255925.1-201ENST00000566954 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.43■■■■□ 3.58
BX255925.1-201ENST00000566954 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.4■■■■□ 3.58
BX255925.1-201ENST00000566954 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.4■■■■□ 3.58
BX255925.1-201ENST00000566954 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
BX255925.1-201ENST00000566954 MIA2Q96PC5 1412 aa37.34■■■■□ 3.57
BX255925.1-201ENST00000566954 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.31■■■■□ 3.56
BX255925.1-201ENST00000566954 KIF14Q15058 1648 aa37.31■■■■□ 3.56
BX255925.1-201ENST00000566954 KCNH8Q96L42 1107 aa37.21■■■■□ 3.55
BX255925.1-201ENST00000566954 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.19■■■■□ 3.54
BX255925.1-201ENST00000566954 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.18■■■■□ 3.54
BX255925.1-201ENST00000566954 HFM1A2PYH4 1435 aa37.18■■■■□ 3.54
BX255925.1-201ENST00000566954 ASXL2Q76L83 1435 aa37.18■■■■□ 3.54
BX255925.1-201ENST00000566954 PTPRKQ15262 1439 aa37.17■■■■□ 3.54
BX255925.1-201ENST00000566954 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
BX255925.1-201ENST00000566954 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.12■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms