RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGEF11O15085 1522 aa34.96■■■■□ 3.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRXQ9BXM0 1461 aa34.91■■■■□ 3.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.83■■■■□ 3.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 SHROOM2Q13796 1616 aa34.83■■■■□ 3.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 JPH4Q96JJ6 628 aa34.78■■■■□ 3.16
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.74■■■■□ 3.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARAP1Q96P48 1450 aa34.7■■■■□ 3.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 IQGAP2Q13576 1575 aa34.69■■■■□ 3.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.68■■■■□ 3.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.66■■■■□ 3.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIF21BO75037 1637 aa34.64■■■■□ 3.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.57■■■■□ 3.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.49■■■■□ 3.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 GOLGA3Q08378 1498 aa34.45■■■■□ 3.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.45■■■■□ 3.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 DISP1Q96F81 1524 aa34.44■■■■□ 3.1
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA0556O60303 1618 aa34.36■■■■□ 3.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.33■■■■□ 3.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPRGP23470 1445 aa34.3■■■■□ 3.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 P3H3Q8IVL6 736 aa34.22■■■■□ 3.07
CCNDBP1-208ENST00000566515 SAMD9Q5K651 1589 aa34.21■■■■□ 3.07
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.15■■■■□ 3.06
CCNDBP1-208ENST00000566515 UACAQ9BZF9 1416 aa34.08■■■■□ 3.05
CCNDBP1-208ENST00000566515 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.07■■■■□ 3.04
CCNDBP1-208ENST00000566515 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.05■■■■□ 3.04
CCNDBP1-208ENST00000566515 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.03■■■■□ 3.04
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.03■■■■□ 3.04
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABCC2Q92887 1545 aa34.01■■■■□ 3.03
CCNDBP1-208ENST00000566515 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34■■■■□ 3.03
CCNDBP1-208ENST00000566515 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34■■■■□ 3.03
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.99■■■■□ 3.03
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABCA8O94911 1581 aa33.97■■■■□ 3.03
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLIP1P30622 1438 aa33.86■■■■□ 3.01
CCNDBP1-208ENST00000566515 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.86■■■■□ 3.01
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.85■■■■□ 3.01
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAPKBP1O60336 1514 aa33.84■■■■□ 3.01
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARID3CA6NKF2 412 aa33.79■■■■□ 3
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP162Q5TB80 1403 aa33.77■■■■□ 3
CCNDBP1-208ENST00000566515 FMN1Q68DA7 1419 aa33.76■■■■□ 3
CCNDBP1-208ENST00000566515 ASXL2Q76L83 1435 aa33.73■■■□□ 2.99
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP10BO94823 1461 aa33.71■■■□□ 2.99
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.68■■■□□ 2.98
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.67■■■□□ 2.98
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
CCNDBP1-208ENST00000566515 DIP2BQ9P265 1576 aa33.64■■■□□ 2.98
CCNDBP1-208ENST00000566515 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.62■■■□□ 2.97
CCNDBP1-208ENST00000566515 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
CCNDBP1-208ENST00000566515 HECW1Q76N89 1606 aa33.59■■■□□ 2.97
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.59■■■□□ 2.97
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.97
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.54■■■□□ 2.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.52■■■□□ 2.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNH8Q96L42 1107 aa33.51■■■□□ 2.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 GLI2P10070 1586 aa33.47■■■□□ 2.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.47■■■□□ 2.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 TSPOAP1O95153 1857 aa33.44■■■□□ 2.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.43■■■□□ 2.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.37■■■□□ 2.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.37■■■□□ 2.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.33■■■□□ 2.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.3■■■□□ 2.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 CD109Q6YHK3 1445 aa33.27■■■□□ 2.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.27■■■□□ 2.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.23■■■□□ 2.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.22■■■□□ 2.91
CCNDBP1-208ENST00000566515 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.2■■■□□ 2.911e-13■□□□□ 8.8
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIF14Q15058 1648 aa33.18■■■□□ 2.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.17■■■□□ 2.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.14■■■□□ 2.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 TIAM1Q13009 1591 aa33.09■■■□□ 2.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.08■■■□□ 2.89
CCNDBP1-208ENST00000566515 KDM6BO15054 1643 aa33.05■■■□□ 2.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.02■■■□□ 2.88
CCNDBP1-208ENST00000566515 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33■■■□□ 2.87
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLCH2O75038 1416 aa32.98■■■□□ 2.87
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAP3K1Q13233 1512 aa32.98■■■□□ 2.87
CCNDBP1-208ENST00000566515 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
CCNDBP1-208ENST00000566515 APLP2Q06481 763 aa32.95■■■□□ 2.87
CCNDBP1-208ENST00000566515 FANCAO15360 1455 aa32.95■■■□□ 2.87
CCNDBP1-208ENST00000566515 NEO1Q92859 1461 aa32.94■■■□□ 2.86
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.93■■■□□ 2.86
CCNDBP1-208ENST00000566515 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.91■■■□□ 2.86
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.91■■■□□ 2.86
CCNDBP1-208ENST00000566515 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.9■■■□□ 2.86
CCNDBP1-208ENST00000566515 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.89■■■□□ 2.86
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.89■■■□□ 2.86
CCNDBP1-208ENST00000566515 PREX2Q70Z35 1606 aa32.89■■■□□ 2.86
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