RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-205ENST00000563559 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
RRN3-205ENST00000563559 CUL7Q14999 1698 aa26.91■■□□□ 1.9
RRN3-205ENST00000563559 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.9■■□□□ 1.9
RRN3-205ENST00000563559 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.89■■□□□ 1.9
RRN3-205ENST00000563559 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.88■■□□□ 1.89
RRN3-205ENST00000563559 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
RRN3-205ENST00000563559 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.84■■□□□ 1.89
RRN3-205ENST00000563559 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.83■■□□□ 1.89
RRN3-205ENST00000563559 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.82■■□□□ 1.88
RRN3-205ENST00000563559 ITGAEP38570 1179 aa26.82■■□□□ 1.88
RRN3-205ENST00000563559 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.882e-7■■■■■ 30
RRN3-205ENST00000563559 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
RRN3-205ENST00000563559 NESP48681 1621 aa26.8■■□□□ 1.88
RRN3-205ENST00000563559 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.79■■□□□ 1.88
RRN3-205ENST00000563559 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.79■■□□□ 1.88
RRN3-205ENST00000563559 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.78■■□□□ 1.88
RRN3-205ENST00000563559 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.78■■□□□ 1.88
RRN3-205ENST00000563559 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.75■■□□□ 1.87
RRN3-205ENST00000563559 WDR97A6NE52 1622 aa26.73■■□□□ 1.87
RRN3-205ENST00000563559 P3H3Q8IVL6 736 aa26.72■■□□□ 1.87
RRN3-205ENST00000563559 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
RRN3-205ENST00000563559 FMN1Q68DA7 1419 aa26.72■■□□□ 1.87
RRN3-205ENST00000563559 MAPKBP1O60336 1514 aa26.7■■□□□ 1.87
RRN3-205ENST00000563559 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
RRN3-205ENST00000563559 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
RRN3-205ENST00000563559 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
RRN3-205ENST00000563559 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.65■■□□□ 1.86
RRN3-205ENST00000563559 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.65■■□□□ 1.86
RRN3-205ENST00000563559 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.6■■□□□ 1.85
RRN3-205ENST00000563559 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.59■■□□□ 1.85
RRN3-205ENST00000563559 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.58■■□□□ 1.85
RRN3-205ENST00000563559 SAMD9Q5K651 1589 aa26.57■■□□□ 1.84
RRN3-205ENST00000563559 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
RRN3-205ENST00000563559 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.52■■□□□ 1.84
RRN3-205ENST00000563559 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
RRN3-205ENST00000563559 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.5■■□□□ 1.83
RRN3-205ENST00000563559 GRIN2BQ13224 1484 aa26.44■■□□□ 1.82
RRN3-205ENST00000563559 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.43■■□□□ 1.82
RRN3-205ENST00000563559 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
RRN3-205ENST00000563559 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.39■■□□□ 1.82
RRN3-205ENST00000563559 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.39■■□□□ 1.81
RRN3-205ENST00000563559 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
RRN3-205ENST00000563559 HFM1A2PYH4 1435 aa26.38■■□□□ 1.81
RRN3-205ENST00000563559 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.38■■□□□ 1.81
RRN3-205ENST00000563559 NCOA2Q15596 1464 aa26.37■■□□□ 1.81
RRN3-205ENST00000563559 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.36■■□□□ 1.81
RRN3-205ENST00000563559 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.35■■□□□ 1.81
RRN3-205ENST00000563559 UACAQ9BZF9 1416 aa26.32■■□□□ 1.8
RRN3-205ENST00000563559 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
RRN3-205ENST00000563559 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.3■■□□□ 1.8
RRN3-205ENST00000563559 PBRM1Q86U86 1689 aa26.29■■□□□ 1.8
RRN3-205ENST00000563559 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.28■■□□□ 1.8
RRN3-205ENST00000563559 PTPRKQ15262 1439 aa26.27■■□□□ 1.8
RRN3-205ENST00000563559 ARHGEF11O15085 1522 aa26.27■■□□□ 1.8
RRN3-205ENST00000563559 HECW1Q76N89 1606 aa26.25■■□□□ 1.79
RRN3-205ENST00000563559 IQGAP2Q13576 1575 aa26.25■■□□□ 1.79
RRN3-205ENST00000563559 NAIPQ13075 1403 aa26.24■■□□□ 1.79
RRN3-205ENST00000563559 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.24■■□□□ 1.79
RRN3-205ENST00000563559 TONSLQ96HA7 1378 aa26.22■■□□□ 1.79
RRN3-205ENST00000563559 ADAMTS12P58397 1594 aa26.22■■□□□ 1.79
RRN3-205ENST00000563559 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.21■■□□□ 1.79
RRN3-205ENST00000563559 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
RRN3-205ENST00000563559 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
RRN3-205ENST00000563559 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.16■■□□□ 1.78
RRN3-205ENST00000563559 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
RRN3-205ENST00000563559 AKNAQ7Z591 1439 aa26.13■■□□□ 1.77
RRN3-205ENST00000563559 MIA2Q96PC5 1412 aa26.12■■□□□ 1.77
RRN3-205ENST00000563559 IFT140Q96RY7 1462 aa26.09■■□□□ 1.77
RRN3-205ENST00000563559 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.09■■□□□ 1.77
RRN3-205ENST00000563559 WDR62O43379 1518 aa26.08■■□□□ 1.77
RRN3-205ENST00000563559 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
RRN3-205ENST00000563559 CCER2I3L3R5 266 aa26.05■■□□□ 1.76
RRN3-205ENST00000563559 KCNH8Q96L42 1107 aa26.03■■□□□ 1.76
RRN3-205ENST00000563559 ANP32CO43423 234 aa26.02■■□□□ 1.76
RRN3-205ENST00000563559 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.01■■□□□ 1.75
RRN3-205ENST00000563559 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
RRN3-205ENST00000563559 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.99■■□□□ 1.75
RRN3-205ENST00000563559 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
RRN3-205ENST00000563559 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.94■■□□□ 1.74
RRN3-205ENST00000563559 KIAA0556O60303 1618 aa25.94■■□□□ 1.74
RRN3-205ENST00000563559 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.94■■□□□ 1.74
RRN3-205ENST00000563559 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
RRN3-205ENST00000563559 ROCK1Q13464 1354 aa25.92■■□□□ 1.74
RRN3-205ENST00000563559 TRIM52Q96A61 297 aa25.91■■□□□ 1.74
RRN3-205ENST00000563559 DISP1Q96F81 1524 aa25.91■■□□□ 1.74
RRN3-205ENST00000563559 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
RRN3-205ENST00000563559 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
RRN3-205ENST00000563559 GRIN2AQ12879 1464 aa25.88■■□□□ 1.73
RRN3-205ENST00000563559 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.87■■□□□ 1.73
RRN3-205ENST00000563559 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.86■■□□□ 1.73
RRN3-205ENST00000563559 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
RRN3-205ENST00000563559 DAPK1P53355 1430 aa25.85■■□□□ 1.73
RRN3-205ENST00000563559 KDM6BO15054 1643 aa25.85■■□□□ 1.73
RRN3-205ENST00000563559 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
RRN3-205ENST00000563559 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
RRN3-205ENST00000563559 MYT1Q01538 1121 aa25.82■■□□□ 1.72
RRN3-205ENST00000563559 ARID3CA6NKF2 412 aa25.8■■□□□ 1.72
RRN3-205ENST00000563559 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
RRN3-205ENST00000563559 ABCC5O15440 1437 aa25.78■■□□□ 1.72
RRN3-205ENST00000563559 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
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