RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562441.5

INO80E-205, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 1,412 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-205ENST00000562441 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30■■■□□ 2.39
INO80E-205ENST00000562441 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.99■■■□□ 2.39
INO80E-205ENST00000562441 ARHGEF11O15085 1522 aa29.97■■■□□ 2.39
INO80E-205ENST00000562441 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.96■■■□□ 2.39
INO80E-205ENST00000562441 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.96■■■□□ 2.39
INO80E-205ENST00000562441 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.96■■■□□ 2.39
INO80E-205ENST00000562441 IQGAP2Q13576 1575 aa29.94■■■□□ 2.38
INO80E-205ENST00000562441 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.9■■■□□ 2.38
INO80E-205ENST00000562441 GOLGA3Q08378 1498 aa29.82■■■□□ 2.36
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INO80E-205ENST00000562441 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
INO80E-205ENST00000562441 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.78■■■□□ 2.36
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INO80E-205ENST00000562441 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.73■■■□□ 2.35
INO80E-205ENST00000562441 DISP1Q96F81 1524 aa29.72■■■□□ 2.35
INO80E-205ENST00000562441 KIAA0556O60303 1618 aa29.67■■■□□ 2.34
INO80E-205ENST00000562441 SAMD9Q5K651 1589 aa29.62■■■□□ 2.33
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INO80E-205ENST00000562441 PTPRGP23470 1445 aa29.44■■■□□ 2.3
INO80E-205ENST00000562441 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.43■■■□□ 2.3
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INO80E-205ENST00000562441 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.39■■■□□ 2.3
INO80E-205ENST00000562441 P3H3Q8IVL6 736 aa29.38■■■□□ 2.29
INO80E-205ENST00000562441 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
INO80E-205ENST00000562441 ABCA8O94911 1581 aa29.31■■■□□ 2.28
INO80E-205ENST00000562441 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.31■■■□□ 2.28
INO80E-205ENST00000562441 ABCC2Q92887 1545 aa29.29■■■□□ 2.28
INO80E-205ENST00000562441 CLIP1P30622 1438 aa29.29■■■□□ 2.28
INO80E-205ENST00000562441 UACAQ9BZF9 1416 aa29.29■■■□□ 2.28
INO80E-205ENST00000562441 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.28■■■□□ 2.28
INO80E-205ENST00000562441 CEP162Q5TB80 1403 aa29.28■■■□□ 2.28
INO80E-205ENST00000562441 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.22■■■□□ 2.27
INO80E-205ENST00000562441 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.16■■■□□ 2.26
INO80E-205ENST00000562441 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
INO80E-205ENST00000562441 FMN1Q68DA7 1419 aa29.14■■■□□ 2.26
INO80E-205ENST00000562441 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
INO80E-205ENST00000562441 MAPKBP1O60336 1514 aa29.1■■■□□ 2.25
INO80E-205ENST00000562441 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
INO80E-205ENST00000562441 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.05■■■□□ 2.24
INO80E-205ENST00000562441 HECW1Q76N89 1606 aa29.04■■■□□ 2.24
INO80E-205ENST00000562441 ATP10BO94823 1461 aa29.03■■■□□ 2.24
INO80E-205ENST00000562441 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
INO80E-205ENST00000562441 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29■■■□□ 2.23
INO80E-205ENST00000562441 ASXL2Q76L83 1435 aa28.97■■■□□ 2.23
INO80E-205ENST00000562441 ARID3CA6NKF2 412 aa28.97■■■□□ 2.23
INO80E-205ENST00000562441 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
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INO80E-205ENST00000562441 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.83■■■□□ 2.2
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INO80E-205ENST00000562441 KIF14Q15058 1648 aa28.68■■■□□ 2.18
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INO80E-205ENST00000562441 KCNH8Q96L42 1107 aa28.67■■■□□ 2.18
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INO80E-205ENST00000562441 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.64■■■□□ 2.18
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INO80E-205ENST00000562441 MAP3K1Q13233 1512 aa28.6■■■□□ 2.17
INO80E-205ENST00000562441 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.57■■■□□ 2.16
INO80E-205ENST00000562441 CD109Q6YHK3 1445 aa28.54■■■□□ 2.16
INO80E-205ENST00000562441 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.51■■■□□ 2.15
INO80E-205ENST00000562441 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.5■■■□□ 2.15
INO80E-205ENST00000562441 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.49■■■□□ 2.15
INO80E-205ENST00000562441 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.46■■■□□ 2.15
INO80E-205ENST00000562441 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
INO80E-205ENST00000562441 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.44■■■□□ 2.14
INO80E-205ENST00000562441 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
INO80E-205ENST00000562441 PREX2Q70Z35 1606 aa28.43■■■□□ 2.14
INO80E-205ENST00000562441 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.42■■■□□ 2.14
INO80E-205ENST00000562441 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.4■■■□□ 2.14
INO80E-205ENST00000562441 PLCH2O75038 1416 aa28.4■■■□□ 2.14
INO80E-205ENST00000562441 NCOA2Q15596 1464 aa28.38■■■□□ 2.13
INO80E-205ENST00000562441 FANCAO15360 1455 aa28.35■■■□□ 2.13
INO80E-205ENST00000562441 APLP2Q06481 763 aa28.35■■■□□ 2.13
INO80E-205ENST00000562441 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
INO80E-205ENST00000562441 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.34■■■□□ 2.13
INO80E-205ENST00000562441 NEO1Q92859 1461 aa28.34■■■□□ 2.13
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