RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561122.1

ZNF280D-216, Transcript of zinc finger protein 280D, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF280D, Length 3,017 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF280D-216ENST00000561122 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.85■■□□□ 1.41
ZNF280D-216ENST00000561122 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.84■■□□□ 1.41
ZNF280D-216ENST00000561122 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
ZNF280D-216ENST00000561122 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.7■■□□□ 1.38
ZNF280D-216ENST00000561122 WDR97A6NE52 1622 aa23.69■■□□□ 1.38
ZNF280D-216ENST00000561122 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
ZNF280D-216ENST00000561122 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ZNF280D-216ENST00000561122 CUL7Q14999 1698 aa23.59■■□□□ 1.37
ZNF280D-216ENST00000561122 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
ZNF280D-216ENST00000561122 WDR62O43379 1518 aa23.57■■□□□ 1.36
ZNF280D-216ENST00000561122 IFT140Q96RY7 1462 aa23.56■■□□□ 1.36
ZNF280D-216ENST00000561122 GRIN2BQ13224 1484 aa23.55■■□□□ 1.36
ZNF280D-216ENST00000561122 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.55■■□□□ 1.36
ZNF280D-216ENST00000561122 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.54■■□□□ 1.36
ZNF280D-216ENST00000561122 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ZNF280D-216ENST00000561122 PBRM1Q86U86 1689 aa23.49■■□□□ 1.35
ZNF280D-216ENST00000561122 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.48■■□□□ 1.35
ZNF280D-216ENST00000561122 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
ZNF280D-216ENST00000561122 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.45■■□□□ 1.34
ZNF280D-216ENST00000561122 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ZNF280D-216ENST00000561122 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.43■■□□□ 1.34
ZNF280D-216ENST00000561122 TIAM1Q13009 1591 aa23.42■■□□□ 1.34
ZNF280D-216ENST00000561122 ADAMTS12P58397 1594 aa23.42■■□□□ 1.34
ZNF280D-216ENST00000561122 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.42■■□□□ 1.34
ZNF280D-216ENST00000561122 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.38■■□□□ 1.33
ZNF280D-216ENST00000561122 FMN1Q68DA7 1419 aa23.37■■□□□ 1.33
ZNF280D-216ENST00000561122 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.36■■□□□ 1.33
ZNF280D-216ENST00000561122 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.34■■□□□ 1.33
ZNF280D-216ENST00000561122 GRIN2AQ12879 1464 aa23.32■■□□□ 1.32
ZNF280D-216ENST00000561122 IQGAP2Q13576 1575 aa23.32■■□□□ 1.32
ZNF280D-216ENST00000561122 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ZNF280D-216ENST00000561122 JPH4Q96JJ6 628 aa23.3■■□□□ 1.32
ZNF280D-216ENST00000561122 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.29■■□□□ 1.32
ZNF280D-216ENST00000561122 SAMD9Q5K651 1589 aa23.26■■□□□ 1.31
ZNF280D-216ENST00000561122 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ZNF280D-216ENST00000561122 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.24■■□□□ 1.31
ZNF280D-216ENST00000561122 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.21■■□□□ 1.31
ZNF280D-216ENST00000561122 SYNJ2O15056 1496 aa23.21■■□□□ 1.31
ZNF280D-216ENST00000561122 CEP170Q5SW79 1584 aa23.18■■□□□ 1.3
ZNF280D-216ENST00000561122 DISP1Q96F81 1524 aa23.18■■□□□ 1.3
ZNF280D-216ENST00000561122 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
ZNF280D-216ENST00000561122 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.17■■□□□ 1.3
ZNF280D-216ENST00000561122 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.16■■□□□ 1.3
ZNF280D-216ENST00000561122 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
ZNF280D-216ENST00000561122 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.16■■□□□ 1.3
ZNF280D-216ENST00000561122 MAP3K1Q13233 1512 aa23.15■■□□□ 1.3
ZNF280D-216ENST00000561122 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.14■■□□□ 1.29
ZNF280D-216ENST00000561122 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.13■■□□□ 1.29
ZNF280D-216ENST00000561122 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
ZNF280D-216ENST00000561122 NCOA2Q15596 1464 aa23.12■■□□□ 1.29
ZNF280D-216ENST00000561122 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.11■■□□□ 1.29
ZNF280D-216ENST00000561122 NEUROD1Q13562 356 aa23.1■■□□□ 1.29
ZNF280D-216ENST00000561122 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ZNF280D-216ENST00000561122 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
ZNF280D-216ENST00000561122 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.09■■□□□ 1.29
ZNF280D-216ENST00000561122 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
ZNF280D-216ENST00000561122 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.08■■□□□ 1.29
ZNF280D-216ENST00000561122 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.06■■□□□ 1.28
ZNF280D-216ENST00000561122 KIAA0556O60303 1618 aa23.06■■□□□ 1.28
ZNF280D-216ENST00000561122 PTPRKQ15262 1439 aa23.05■■□□□ 1.28
ZNF280D-216ENST00000561122 NUP160Q12769 1436 aa23.02■■□□□ 1.27
ZNF280D-216ENST00000561122 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.27
ZNF280D-216ENST00000561122 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
ZNF280D-216ENST00000561122 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.01■■□□□ 1.27
ZNF280D-216ENST00000561122 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.99■■□□□ 1.27
ZNF280D-216ENST00000561122 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF280D-216ENST00000561122 HECW1Q76N89 1606 aa22.96■■□□□ 1.27
ZNF280D-216ENST00000561122 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ZNF280D-216ENST00000561122 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ZNF280D-216ENST00000561122 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.93■■□□□ 1.26
ZNF280D-216ENST00000561122 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.91■■□□□ 1.26
ZNF280D-216ENST00000561122 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
ZNF280D-216ENST00000561122 TRIM52Q96A61 297 aa22.9■■□□□ 1.26
ZNF280D-216ENST00000561122 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
ZNF280D-216ENST00000561122 PTPRGP23470 1445 aa22.89■■□□□ 1.26
ZNF280D-216ENST00000561122 KCNH8Q96L42 1107 aa22.88■■□□□ 1.25
ZNF280D-216ENST00000561122 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ZNF280D-216ENST00000561122 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.87■■□□□ 1.25
ZNF280D-216ENST00000561122 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.87■■□□□ 1.25
ZNF280D-216ENST00000561122 CHD1O14646 1710 aa22.87■■□□□ 1.25
ZNF280D-216ENST00000561122 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.87■■□□□ 1.25
ZNF280D-216ENST00000561122 FOXD1Q16676 465 aa22.87■■□□□ 1.25
ZNF280D-216ENST00000561122 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ZNF280D-216ENST00000561122 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.82■■□□□ 1.24
ZNF280D-216ENST00000561122 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ZNF280D-216ENST00000561122 MAPKBP1O60336 1514 aa22.79■■□□□ 1.24
ZNF280D-216ENST00000561122 ATP10BO94823 1461 aa22.78■■□□□ 1.24
ZNF280D-216ENST00000561122 NAIPQ13075 1403 aa22.77■■□□□ 1.24
ZNF280D-216ENST00000561122 ARHGEF11O15085 1522 aa22.76■■□□□ 1.23
ZNF280D-216ENST00000561122 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
ZNF280D-216ENST00000561122 KIF14Q15058 1648 aa22.74■■□□□ 1.23
ZNF280D-216ENST00000561122 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
ZNF280D-216ENST00000561122 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
ZNF280D-216ENST00000561122 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.72■■□□□ 1.23
ZNF280D-216ENST00000561122 HFM1A2PYH4 1435 aa22.7■■□□□ 1.22
ZNF280D-216ENST00000561122 KDM6BO15054 1643 aa22.67■■□□□ 1.22
ZNF280D-216ENST00000561122 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ZNF280D-216ENST00000561122 ABCC5O15440 1437 aa22.66■■□□□ 1.22
ZNF280D-216ENST00000561122 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ZNF280D-216ENST00000561122 MIER1Q8N108 512 aa22.65■■□□□ 1.22
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