RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560937.1

MFGE8-214, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 801 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-214ENST00000560937 GOLGA3Q08378 1498 aa29.73■■■□□ 2.35
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MFGE8-214ENST00000560937 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
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MFGE8-214ENST00000560937 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.44■■■□□ 2.3
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MFGE8-214ENST00000560937 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.42■■■□□ 2.3
MFGE8-214ENST00000560937 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.42■■■□□ 2.3
MFGE8-214ENST00000560937 ARHGEF11O15085 1522 aa29.42■■■□□ 2.3
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MFGE8-214ENST00000560937 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.4■■■□□ 2.3
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MFGE8-214ENST00000560937 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.38■■■□□ 2.29
MFGE8-214ENST00000560937 KIAA0556O60303 1618 aa29.36■■■□□ 2.29
MFGE8-214ENST00000560937 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.35■■■□□ 2.29
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MFGE8-214ENST00000560937 P3H3Q8IVL6 736 aa29.21■■■□□ 2.27
MFGE8-214ENST00000560937 CEP162Q5TB80 1403 aa29.2■■■□□ 2.26
MFGE8-214ENST00000560937 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
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MFGE8-214ENST00000560937 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.17■■■□□ 2.26
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MFGE8-214ENST00000560937 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.97■■■□□ 2.23
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MFGE8-214ENST00000560937 ABCC2Q92887 1545 aa28.93■■■□□ 2.22
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MFGE8-214ENST00000560937 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.88■■■□□ 2.21
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MFGE8-214ENST00000560937 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.78■■■□□ 2.2
MFGE8-214ENST00000560937 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.77■■■□□ 2.2
MFGE8-214ENST00000560937 ARID3CA6NKF2 412 aa28.77■■■□□ 2.2
MFGE8-214ENST00000560937 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
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MFGE8-214ENST00000560937 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.47■■■□□ 2.15
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MFGE8-214ENST00000560937 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.11■■■□□ 2.09
MFGE8-214ENST00000560937 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.11■■■□□ 2.09
MFGE8-214ENST00000560937 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.09■■■□□ 2.09
MFGE8-214ENST00000560937 PLCH2O75038 1416 aa28.08■■■□□ 2.09
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