RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560401.5

EFTUD1P1-204, humanhuman

BASIC

Gene EFTUD1P1, Length 1,798 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD1P1-204ENST00000560401 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
EFTUD1P1-204ENST00000560401 ADAMTS12P58397 1594 aa28.38■■■□□ 2.13
EFTUD1P1-204ENST00000560401 SYNJ2O15056 1496 aa28.28■■■□□ 2.12
EFTUD1P1-204ENST00000560401 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
EFTUD1P1-204ENST00000560401 ARAP1Q96P48 1450 aa28.25■■■□□ 2.11
EFTUD1P1-204ENST00000560401 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
EFTUD1P1-204ENST00000560401 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
EFTUD1P1-204ENST00000560401 GRIN2AQ12879 1464 aa28.23■■■□□ 2.11
EFTUD1P1-204ENST00000560401 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
EFTUD1P1-204ENST00000560401 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
EFTUD1P1-204ENST00000560401 FBLN2P98095 1184 aa28.19■■■□□ 2.1
EFTUD1P1-204ENST00000560401 APLP2Q06481 763 aa28.16■■■□□ 2.1
EFTUD1P1-204ENST00000560401 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.1■■■□□ 2.09
EFTUD1P1-204ENST00000560401 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.1■■■□□ 2.09
EFTUD1P1-204ENST00000560401 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.09■■■□□ 2.09
EFTUD1P1-204ENST00000560401 NUP160Q12769 1436 aa28.09■■■□□ 2.09
EFTUD1P1-204ENST00000560401 CEP170Q5SW79 1584 aa28.02■■■□□ 2.08
EFTUD1P1-204ENST00000560401 IQGAP2Q13576 1575 aa28■■■□□ 2.07
EFTUD1P1-204ENST00000560401 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.97■■■□□ 2.07
EFTUD1P1-204ENST00000560401 P3H3Q8IVL6 736 aa27.96■■■□□ 2.07
EFTUD1P1-204ENST00000560401 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.93■■■□□ 2.06
EFTUD1P1-204ENST00000560401 JPH4Q96JJ6 628 aa27.92■■■□□ 2.06
EFTUD1P1-204ENST00000560401 CHD1O14646 1710 aa27.91■■■□□ 2.06
EFTUD1P1-204ENST00000560401 SAMD9Q5K651 1589 aa27.9■■■□□ 2.06
EFTUD1P1-204ENST00000560401 MAP3K1Q13233 1512 aa27.9■■■□□ 2.06
EFTUD1P1-204ENST00000560401 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.87■■■□□ 2.05
EFTUD1P1-204ENST00000560401 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
EFTUD1P1-204ENST00000560401 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
EFTUD1P1-204ENST00000560401 DISP1Q96F81 1524 aa27.82■■■□□ 2.04
EFTUD1P1-204ENST00000560401 TIAM1Q13009 1591 aa27.8■■■□□ 2.04
EFTUD1P1-204ENST00000560401 FMN1Q68DA7 1419 aa27.77■■■□□ 2.04
EFTUD1P1-204ENST00000560401 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.76■■■□□ 2.03
EFTUD1P1-204ENST00000560401 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
EFTUD1P1-204ENST00000560401 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.73■■■□□ 2.03
EFTUD1P1-204ENST00000560401 KIAA0556O60303 1618 aa27.72■■■□□ 2.03
EFTUD1P1-204ENST00000560401 OSCARQ8IYS5 282 aa27.71■■■□□ 2.03
EFTUD1P1-204ENST00000560401 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.71■■■□□ 2.03
EFTUD1P1-204ENST00000560401 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.69■■■□□ 2.02
EFTUD1P1-204ENST00000560401 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
EFTUD1P1-204ENST00000560401 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
EFTUD1P1-204ENST00000560401 SHROOM2Q13796 1616 aa27.66■■■□□ 2.02
EFTUD1P1-204ENST00000560401 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.63■■■□□ 2.01
EFTUD1P1-204ENST00000560401 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.62■■■□□ 2.01
EFTUD1P1-204ENST00000560401 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.62■■■□□ 2.01
EFTUD1P1-204ENST00000560401 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.61■■■□□ 2.01
EFTUD1P1-204ENST00000560401 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
EFTUD1P1-204ENST00000560401 PTPRGP23470 1445 aa27.51■■■□□ 2
EFTUD1P1-204ENST00000560401 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
EFTUD1P1-204ENST00000560401 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
EFTUD1P1-204ENST00000560401 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
EFTUD1P1-204ENST00000560401 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.48■■□□□ 1.99
EFTUD1P1-204ENST00000560401 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.44■■□□□ 1.98
EFTUD1P1-204ENST00000560401 HECW1Q76N89 1606 aa27.42■■□□□ 1.98
EFTUD1P1-204ENST00000560401 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.41■■□□□ 1.98
EFTUD1P1-204ENST00000560401 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
EFTUD1P1-204ENST00000560401 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
EFTUD1P1-204ENST00000560401 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.39■■□□□ 1.98
EFTUD1P1-204ENST00000560401 ABCA8O94911 1581 aa27.39■■□□□ 1.97
EFTUD1P1-204ENST00000560401 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.37■■□□□ 1.97
EFTUD1P1-204ENST00000560401 UACAQ9BZF9 1416 aa27.35■■□□□ 1.97
EFTUD1P1-204ENST00000560401 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.34■■□□□ 1.97
EFTUD1P1-204ENST00000560401 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
EFTUD1P1-204ENST00000560401 ARID3CA6NKF2 412 aa27.31■■□□□ 1.96
EFTUD1P1-204ENST00000560401 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
EFTUD1P1-204ENST00000560401 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.28■■□□□ 1.96
EFTUD1P1-204ENST00000560401 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
EFTUD1P1-204ENST00000560401 ATP10BO94823 1461 aa27.26■■□□□ 1.95
EFTUD1P1-204ENST00000560401 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.24■■□□□ 1.95
EFTUD1P1-204ENST00000560401 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.24■■□□□ 1.95
EFTUD1P1-204ENST00000560401 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.23■■□□□ 1.95
EFTUD1P1-204ENST00000560401 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.23■■□□□ 1.95
EFTUD1P1-204ENST00000560401 ABCC2Q92887 1545 aa27.21■■□□□ 1.95
EFTUD1P1-204ENST00000560401 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.19■■□□□ 1.94
EFTUD1P1-204ENST00000560401 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
EFTUD1P1-204ENST00000560401 MAPKBP1O60336 1514 aa27.16■■□□□ 1.94
EFTUD1P1-204ENST00000560401 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.16■■□□□ 1.94
EFTUD1P1-204ENST00000560401 ITGAEP38570 1179 aa27.16■■□□□ 1.94
EFTUD1P1-204ENST00000560401 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.15■■□□□ 1.94
EFTUD1P1-204ENST00000560401 ARHGEF11O15085 1522 aa27.13■■□□□ 1.93
EFTUD1P1-204ENST00000560401 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
EFTUD1P1-204ENST00000560401 NCOA2Q15596 1464 aa27.12■■□□□ 1.93
EFTUD1P1-204ENST00000560401 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
EFTUD1P1-204ENST00000560401 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.1■■□□□ 1.93
EFTUD1P1-204ENST00000560401 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
EFTUD1P1-204ENST00000560401 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
EFTUD1P1-204ENST00000560401 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.04■■□□□ 1.92
EFTUD1P1-204ENST00000560401 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.03■■□□□ 1.92
EFTUD1P1-204ENST00000560401 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
EFTUD1P1-204ENST00000560401 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.97■■□□□ 1.91
EFTUD1P1-204ENST00000560401 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.97■■□□□ 1.91
EFTUD1P1-204ENST00000560401 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.97■■□□□ 1.91
EFTUD1P1-204ENST00000560401 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.97■■□□□ 1.91
EFTUD1P1-204ENST00000560401 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.97■■□□□ 1.91
EFTUD1P1-204ENST00000560401 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
EFTUD1P1-204ENST00000560401 HFM1A2PYH4 1435 aa26.94■■□□□ 1.9
EFTUD1P1-204ENST00000560401 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
EFTUD1P1-204ENST00000560401 MIA2Q96PC5 1412 aa26.92■■□□□ 1.9
EFTUD1P1-204ENST00000560401 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
EFTUD1P1-204ENST00000560401 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.91■■□□□ 1.9
EFTUD1P1-204ENST00000560401 NEUROD1Q13562 356 aa26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms