RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558550.1

EFTUD1P1-202, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD1P1, Length 418 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIF21BO75037 1637 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD1P1-202ENST00000558550 UBTFP17480 764 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD1P1-202ENST00000558550 JPH4Q96JJ6 628 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IQGAP2Q13576 1575 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GOLGA3Q08378 1498 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SHROOM2Q13796 1616 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ARHGEF11O15085 1522 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ERCC6L2Q5T890 1561 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD1P1-202ENST00000558550 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CYB5RLQ6IPT4 315 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ARAP1Q96P48 1450 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DISP1Q96F81 1524 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIAA0556O60303 1618 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD1P1-202ENST00000558550 P3H3Q8IVL6 736 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TNIKQ9UKE5 1360 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PTPRGP23470 1445 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SAMD9Q5K651 1589 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CLIP1P30622 1438 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CEP162Q5TB80 1403 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD1P1-202ENST00000558550 UACAQ9BZF9 1416 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PLB1Q6P1J6 1458 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ABCC2Q92887 1545 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ABCA8O94911 1581 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FMN1Q68DA7 1419 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD1P1-202ENST00000558550 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ARID3CA6NKF2 412 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HECW1Q76N89 1606 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ATP10BO94823 1461 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MAPKBP1O60336 1514 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ASXL2Q76L83 1435 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PLEKHD1A6NEE1 506 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KCNH8Q96L42 1107 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIF13AQ9H1H9 1805 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DIP2BQ9P265 1576 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 APLP2Q06481 763 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TSPOAP1O95153 1857 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GLI2P10070 1586 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TIAM1Q13009 1591 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIF14Q15058 1648 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ABCA9Q8IUA7 1624 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MAP3K1Q13233 1512 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CD109Q6YHK3 1445 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TTC37Q6PGP7 1564 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MYO5CQ9NQX4 1742 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TEX14Q8IWB6 1497 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CCNB3Q8WWL7 1395 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NCOA2Q15596 1464 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PLCH2O75038 1416 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PREX2Q70Z35 1606 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms