RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557130.1

UBE2CP1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 1, humanhuman

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Gene UBE2CP1, Length 554 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP1-201ENST00000557130 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
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UBE2CP1-201ENST00000557130 MAP3K1Q13233 1512 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2CP1-201ENST00000557130 FGD5Q6ZNL6 1462 aa11.43□□□□□ -0.58
UBE2CP1-201ENST00000557130 FANCD2Q9BXW9 1451 aa11.43□□□□□ -0.58
UBE2CP1-201ENST00000557130 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.43□□□□□ -0.58
UBE2CP1-201ENST00000557130 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
UBE2CP1-201ENST00000557130 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
UBE2CP1-201ENST00000557130 DNMBPQ6XZF7 1577 aa11.37□□□□□ -0.59
UBE2CP1-201ENST00000557130 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.37□□□□□ -0.59
UBE2CP1-201ENST00000557130 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2CP1-201ENST00000557130 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2CP1-201ENST00000557130 TOPBP1Q92547 1522 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2CP1-201ENST00000557130 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2CP1-201ENST00000557130 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
UBE2CP1-201ENST00000557130 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
UBE2CP1-201ENST00000557130 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
UBE2CP1-201ENST00000557130 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
UBE2CP1-201ENST00000557130 PDS5BQ9NTI5 1447 aa11.3□□□□□ -0.6
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UBE2CP1-201ENST00000557130 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2CP1-201ENST00000557130 TIAM1Q13009 1591 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2CP1-201ENST00000557130 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2CP1-201ENST00000557130 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2CP1-201ENST00000557130 CUL7Q14999 1698 aa11.27□□□□□ -0.6
UBE2CP1-201ENST00000557130 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.61
UBE2CP1-201ENST00000557130 SLC4A2P04920 1241 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2CP1-201ENST00000557130 FOXD4L1Q9NU39 408 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2CP1-201ENST00000557130 NESP48681 1621 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2CP1-201ENST00000557130 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2CP1-201ENST00000557130 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
UBE2CP1-201ENST00000557130 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.23□□□□□ -0.61
UBE2CP1-201ENST00000557130 FMN1Q68DA7 1419 aa11.23□□□□□ -0.61
UBE2CP1-201ENST00000557130 NEUROD1Q13562 356 aa11.22□□□□□ -0.61
UBE2CP1-201ENST00000557130 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.22□□□□□ -0.61
UBE2CP1-201ENST00000557130 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.22□□□□□ -0.61
UBE2CP1-201ENST00000557130 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.2□□□□□ -0.62
UBE2CP1-201ENST00000557130 P3H3Q8IVL6 736 aa11.2□□□□□ -0.62
UBE2CP1-201ENST00000557130 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
UBE2CP1-201ENST00000557130 MIER1Q8N108 512 aa11.19□□□□□ -0.62
UBE2CP1-201ENST00000557130 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.18□□□□□ -0.62
UBE2CP1-201ENST00000557130 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
UBE2CP1-201ENST00000557130 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa11.18□□□□□ -0.62
UBE2CP1-201ENST00000557130 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.17□□□□□ -0.62
UBE2CP1-201ENST00000557130 WDR97A6NE52 1622 aa11.17□□□□□ -0.62
UBE2CP1-201ENST00000557130 ITGAEP38570 1179 aa11.17□□□□□ -0.62
UBE2CP1-201ENST00000557130 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
UBE2CP1-201ENST00000557130 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.17□□□□□ -0.62
UBE2CP1-201ENST00000557130 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.17□□□□□ -0.62
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UBE2CP1-201ENST00000557130 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.16□□□□□ -0.62
UBE2CP1-201ENST00000557130 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
UBE2CP1-201ENST00000557130 SAMD9Q5K651 1589 aa11.12□□□□□ -0.63
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UBE2CP1-201ENST00000557130 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa11.11□□□□□ -0.63
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UBE2CP1-201ENST00000557130 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2CP1-201ENST00000557130 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
UBE2CP1-201ENST00000557130 GRIN2BQ13224 1484 aa11.09□□□□□ -0.63
UBE2CP1-201ENST00000557130 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.09□□□□□ -0.63
UBE2CP1-201ENST00000557130 MAPKBP1O60336 1514 aa11.08□□□□□ -0.64
UBE2CP1-201ENST00000557130 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.06□□□□□ -0.64
UBE2CP1-201ENST00000557130 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.06□□□□□ -0.64
UBE2CP1-201ENST00000557130 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.06□□□□□ -0.64
UBE2CP1-201ENST00000557130 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
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UBE2CP1-201ENST00000557130 IFT140Q96RY7 1462 aa11.04□□□□□ -0.64
UBE2CP1-201ENST00000557130 HFM1A2PYH4 1435 aa11.03□□□□□ -0.64
UBE2CP1-201ENST00000557130 NCOA2Q15596 1464 aa11.03□□□□□ -0.64
UBE2CP1-201ENST00000557130 SIN3AQ96ST3 1273 aa11.02□□□□□ -0.65
UBE2CP1-201ENST00000557130 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.02□□□□□ -0.65
UBE2CP1-201ENST00000557130 ARHGEF11O15085 1522 aa11.01□□□□□ -0.65
UBE2CP1-201ENST00000557130 DCAF8L1A6NGE4 600 aa11.01□□□□□ -0.65
UBE2CP1-201ENST00000557130 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
UBE2CP1-201ENST00000557130 UACAQ9BZF9 1416 aa11.01□□□□□ -0.65
UBE2CP1-201ENST00000557130 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
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UBE2CP1-201ENST00000557130 PTPRKQ15262 1439 aa10.98□□□□□ -0.65
UBE2CP1-201ENST00000557130 ADAMTS12P58397 1594 aa10.98□□□□□ -0.65
UBE2CP1-201ENST00000557130 PBRM1Q86U86 1689 aa10.98□□□□□ -0.65
UBE2CP1-201ENST00000557130 HECW1Q76N89 1606 aa10.96□□□□□ -0.65
UBE2CP1-201ENST00000557130 WDR62O43379 1518 aa10.96□□□□□ -0.65
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UBE2CP1-201ENST00000557130 AKNAQ7Z591 1439 aa10.96□□□□□ -0.65
UBE2CP1-201ENST00000557130 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
UBE2CP1-201ENST00000557130 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10.95□□□□□ -0.66
UBE2CP1-201ENST00000557130 PTPN23Q9H3S7 1636 aa10.95□□□□□ -0.66
UBE2CP1-201ENST00000557130 TONSLQ96HA7 1378 aa10.93□□□□□ -0.66
UBE2CP1-201ENST00000557130 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
UBE2CP1-201ENST00000557130 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa10.91□□□□□ -0.66
UBE2CP1-201ENST00000557130 CCER2I3L3R5 266 aa10.91□□□□□ -0.66
UBE2CP1-201ENST00000557130 ROCK1Q13464 1354 aa10.9□□□□□ -0.66
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
UBE2CP1-201ENST00000557130 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
UBE2CP1-201ENST00000557130 GRIN2AQ12879 1464 aa10.89□□□□□ -0.67
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