RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556356.1

LRP1-211, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene LRP1, Length 5,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-211ENST00000556356 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
LRP1-211ENST00000556356 NEFMP07197 916 aa21.19■□□□□ 0.98
LRP1-211ENST00000556356 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
LRP1-211ENST00000556356 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
LRP1-211ENST00000556356 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.15■□□□□ 0.98
LRP1-211ENST00000556356 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
LRP1-211ENST00000556356 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.09■□□□□ 0.97
LRP1-211ENST00000556356 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP1-211ENST00000556356 NCAPD3P42695 1498 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP1-211ENST00000556356 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
LRP1-211ENST00000556356 SLC24A1O60721 1099 aa21.06■□□□□ 0.96
LRP1-211ENST00000556356 MYT1Q01538 1121 aa21.05■□□□□ 0.96
LRP1-211ENST00000556356 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
LRP1-211ENST00000556356 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.96■□□□□ 0.95
LRP1-211ENST00000556356 FMN1Q68DA7 1419 aa20.93■□□□□ 0.94
LRP1-211ENST00000556356 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.93■□□□□ 0.94
LRP1-211ENST00000556356 JPH4Q96JJ6 628 aa20.9■□□□□ 0.94
LRP1-211ENST00000556356 RGL3Q3MIN7 710 aa20.89■□□□□ 0.93
LRP1-211ENST00000556356 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.87■□□□□ 0.93
LRP1-211ENST00000556356 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
LRP1-211ENST00000556356 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
LRP1-211ENST00000556356 C14orf37Q86TY3 774 aa20.86■□□□□ 0.93
LRP1-211ENST00000556356 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
LRP1-211ENST00000556356 OSCARQ8IYS5 282 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP1-211ENST00000556356 KANK1Q14678 1352 aa20.83■□□□□ 0.93
LRP1-211ENST00000556356 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.83■□□□□ 0.92
LRP1-211ENST00000556356 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.82■□□□□ 0.92
LRP1-211ENST00000556356 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.81■□□□□ 0.92
LRP1-211ENST00000556356 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.8■□□□□ 0.92
LRP1-211ENST00000556356 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
LRP1-211ENST00000556356 MLECQ14165 292 aa20.8■□□□□ 0.92
LRP1-211ENST00000556356 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.92
LRP1-211ENST00000556356 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
LRP1-211ENST00000556356 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.77■□□□□ 0.92
LRP1-211ENST00000556356 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.75■□□□□ 0.91
LRP1-211ENST00000556356 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.72■□□□□ 0.91
LRP1-211ENST00000556356 PTPRGP23470 1445 aa20.7■□□□□ 0.9
LRP1-211ENST00000556356 GGT6Q6P531 493 aa20.7■□□□□ 0.9
LRP1-211ENST00000556356 HMGXB3Q12766 1538 aa20.7■□□□□ 0.9
LRP1-211ENST00000556356 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
LRP1-211ENST00000556356 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
LRP1-211ENST00000556356 TMC1Q8TDI8 760 aa20.68■□□□□ 0.9
LRP1-211ENST00000556356 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.68■□□□□ 0.9
LRP1-211ENST00000556356 CDCA8Q53HL2 280 aa20.67■□□□□ 0.9
LRP1-211ENST00000556356 CFTRP13569 1480 aa20.67■□□□□ 0.9
LRP1-211ENST00000556356 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.9
LRP1-211ENST00000556356 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.64■□□□□ 0.89
LRP1-211ENST00000556356 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.64■□□□□ 0.89
LRP1-211ENST00000556356 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.64■□□□□ 0.89
LRP1-211ENST00000556356 NESP48681 1621 aa20.63■□□□□ 0.89
LRP1-211ENST00000556356 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.63■□□□□ 0.89
LRP1-211ENST00000556356 POGKQ9P215 609 aa20.63■□□□□ 0.89
LRP1-211ENST00000556356 IGF1RP08069 1367 aa20.63■□□□□ 0.89
LRP1-211ENST00000556356 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.892e-6■■■□□ 17.6
LRP1-211ENST00000556356 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
LRP1-211ENST00000556356 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP1-211ENST00000556356 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP1-211ENST00000556356 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP1-211ENST00000556356 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.59■□□□□ 0.89
LRP1-211ENST00000556356 PLEKHG5O94827 1062 aa20.59■□□□□ 0.89
LRP1-211ENST00000556356 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
LRP1-211ENST00000556356 BCL11AQ9H165 835 aa20.57■□□□□ 0.88
LRP1-211ENST00000556356 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.57■□□□□ 0.88
LRP1-211ENST00000556356 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
LRP1-211ENST00000556356 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
LRP1-211ENST00000556356 GRIN2BQ13224 1484 aa20.55■□□□□ 0.88
LRP1-211ENST00000556356 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.55■□□□□ 0.88
LRP1-211ENST00000556356 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.55■□□□□ 0.88
LRP1-211ENST00000556356 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
LRP1-211ENST00000556356 MRS2Q9HD23 443 aa20.54■□□□□ 0.88
LRP1-211ENST00000556356 IFT140Q96RY7 1462 aa20.52■□□□□ 0.88
LRP1-211ENST00000556356 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
LRP1-211ENST00000556356 PKD2Q13563 968 aa20.51■□□□□ 0.87
LRP1-211ENST00000556356 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.51■□□□□ 0.87
LRP1-211ENST00000556356 KIF3BO15066 747 aa20.51■□□□□ 0.87
LRP1-211ENST00000556356 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.49■□□□□ 0.87
LRP1-211ENST00000556356 NUP155O75694 1391 aa20.48■□□□□ 0.87
LRP1-211ENST00000556356 A0A0G2JS52 829 aa20.48■□□□□ 0.87
LRP1-211ENST00000556356 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.46■□□□□ 0.87
LRP1-211ENST00000556356 CFAP53Q96M91 514 aa20.46■□□□□ 0.87
LRP1-211ENST00000556356 TOPBP1Q92547 1522 aa20.43■□□□□ 0.86
LRP1-211ENST00000556356 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.43■□□□□ 0.86
LRP1-211ENST00000556356 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP1-211ENST00000556356 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.41■□□□□ 0.86
LRP1-211ENST00000556356 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
LRP1-211ENST00000556356 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP1-211ENST00000556356 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP1-211ENST00000556356 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
LRP1-211ENST00000556356 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
LRP1-211ENST00000556356 TMF1P82094 1093 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP1-211ENST00000556356 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP1-211ENST00000556356 FOXD1Q16676 465 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP1-211ENST00000556356 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
LRP1-211ENST00000556356 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP1-211ENST00000556356 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP1-211ENST00000556356 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
LRP1-211ENST00000556356 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.32■□□□□ 0.84
LRP1-211ENST00000556356 SYNJ1O43426 1573 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP1-211ENST00000556356 STK26Q9P289 416 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP1-211ENST00000556356 EID1Q9Y6B2 187 aa20.31■□□□□ 0.84
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