RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555699.5

LGMN-211, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LGMN, Length 1,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-211ENST00000555699 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.76■■■□□ 2.03
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LGMN-211ENST00000555699 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.53■■□□□ 1.84
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LGMN-211ENST00000555699 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.44■■□□□ 1.82
LGMN-211ENST00000555699 CD109Q6YHK3 1445 aa26.44■■□□□ 1.82
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LGMN-211ENST00000555699 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.18■■□□□ 1.78
LGMN-211ENST00000555699 MAP3K1Q13233 1512 aa26.17■■□□□ 1.78
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LGMN-211ENST00000555699 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.16■■□□□ 1.78
LGMN-211ENST00000555699 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.16■■□□□ 1.78
LGMN-211ENST00000555699 PREX2Q70Z35 1606 aa26.14■■□□□ 1.78
LGMN-211ENST00000555699 AKNAQ7Z591 1439 aa26.14■■□□□ 1.77
LGMN-211ENST00000555699 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.13■■□□□ 1.77
LGMN-211ENST00000555699 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.12■■□□□ 1.77
LGMN-211ENST00000555699 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
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