RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551632.1

DTX3-208, Transcript of deltex E3 ubiquitin ligase 3, human

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene DTX3, Length 1,840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DTX3-208	ENST00000551632	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
DTX3-208	ENST00000551632	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.42	■■■□□ 2.78
DTX3-208	ENST00000551632	FBLN2	P98095	1184 aa		32.41	■■■□□ 2.78
DTX3-208	ENST00000551632	CHD1	O14646	1710 aa		32.4	■■■□□ 2.78
DTX3-208	ENST00000551632	CEP170	Q5SW79	1584 aa		32.39	■■■□□ 2.78
DTX3-208	ENST00000551632	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32.38	■■■□□ 2.77
DTX3-208	ENST00000551632	ARAP1	Q96P48	1450 aa		32.38	■■■□□ 2.77
DTX3-208	ENST00000551632	NUP160	Q12769	1436 aa		32.34	■■■□□ 2.77
DTX3-208	ENST00000551632	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		32.34	■■■□□ 2.77
DTX3-208	ENST00000551632	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.33	■■■□□ 2.77
DTX3-208	ENST00000551632	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.29	■■■□□ 2.76
DTX3-208	ENST00000551632	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.28	■■■□□ 2.76
DTX3-208	ENST00000551632	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.22	■■■□□ 2.75
DTX3-208	ENST00000551632	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.17	■■■□□ 2.74
DTX3-208	ENST00000551632	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.16	■■■□□ 2.74
DTX3-208	ENST00000551632	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.08	■■■□□ 2.73
DTX3-208	ENST00000551632	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.07	■■■□□ 2.72
DTX3-208	ENST00000551632	JPH4	Q96JJ6	628 aa		32.02	■■■□□ 2.72
DTX3-208	ENST00000551632	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
DTX3-208	ENST00000551632	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32	■■■□□ 2.71
DTX3-208	ENST00000551632	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32	■■■□□ 2.71
DTX3-208	ENST00000551632	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.98	■■■□□ 2.71
DTX3-208	ENST00000551632	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
DTX3-208	ENST00000551632	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		31.92	■■■□□ 2.7
DTX3-208	ENST00000551632	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.91	■■■□□ 2.7
DTX3-208	ENST00000551632	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		31.9	■■■□□ 2.7
DTX3-208	ENST00000551632	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
DTX3-208	ENST00000551632	APLP2	Q06481	763 aa		31.87	■■■□□ 2.69
DTX3-208	ENST00000551632	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.8	■■■□□ 2.68
DTX3-208	ENST00000551632	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		31.8	■■■□□ 2.68
DTX3-208	ENST00000551632	MAP3K1	Q13233	1512 aa		31.79	■■■□□ 2.68
DTX3-208	ENST00000551632	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.79	■■■□□ 2.68
DTX3-208	ENST00000551632	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		31.76	■■■□□ 2.68
DTX3-208	ENST00000551632	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
DTX3-208	ENST00000551632	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.75	■■■□□ 2.67
DTX3-208	ENST00000551632	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		31.74	■■■□□ 2.67
DTX3-208	ENST00000551632	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
DTX3-208	ENST00000551632	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		31.72	■■■□□ 2.67
DTX3-208	ENST00000551632	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
DTX3-208	ENST00000551632	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		31.66	■■■□□ 2.66
DTX3-208	ENST00000551632	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
DTX3-208	ENST00000551632	PTPRG	P23470	1445 aa		31.63	■■■□□ 2.65
DTX3-208	ENST00000551632	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.63	■■■□□ 2.65
DTX3-208	ENST00000551632	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		31.63	■■■□□ 2.65
DTX3-208	ENST00000551632	ABCA8	O94911	1581 aa		31.63	■■■□□ 2.65
DTX3-208	ENST00000551632	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
DTX3-208	ENST00000551632	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
DTX3-208	ENST00000551632	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
DTX3-208	ENST00000551632	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		31.55	■■■□□ 2.64
DTX3-208	ENST00000551632	ARID3C	A6NKF2	412 aa		31.48	■■■□□ 2.63
DTX3-208	ENST00000551632	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		31.48	■■■□□ 2.63
DTX3-208	ENST00000551632	UACA	Q9BZF9	1416 aa		31.46	■■■□□ 2.63
DTX3-208	ENST00000551632	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.45	■■■□□ 2.63
DTX3-208	ENST00000551632	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.45	■■■□□ 2.63
DTX3-208	ENST00000551632	ABCC2	Q92887	1545 aa		31.41	■■■□□ 2.62
DTX3-208	ENST00000551632	ATP10B	O94823	1461 aa		31.37	■■■□□ 2.61
DTX3-208	ENST00000551632	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.36	■■■□□ 2.61
DTX3-208	ENST00000551632	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		31.34	■■■□□ 2.61
DTX3-208	ENST00000551632	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
DTX3-208	ENST00000551632	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
DTX3-208	ENST00000551632	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.32	■■■□□ 2.6
DTX3-208	ENST00000551632	ARHGEF11	O15085	1522 aa		31.3	■■■□□ 2.6
DTX3-208	ENST00000551632	NCOA2	Q15596	1464 aa		31.29	■■■□□ 2.6
DTX3-208	ENST00000551632	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.28	■■■□□ 2.6
DTX3-208	ENST00000551632	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
DTX3-208	ENST00000551632	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		31.27	■■■□□ 2.6
DTX3-208	ENST00000551632	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.25	■■■□□ 2.59
DTX3-208	ENST00000551632	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	31.23	■■■□□ 2.59
DTX3-208	ENST00000551632	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		31.21	■■■□□ 2.59
DTX3-208	ENST00000551632	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		31.19	■■■□□ 2.58
DTX3-208	ENST00000551632	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		31.19	■■■□□ 2.58
DTX3-208	ENST00000551632	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		31.19	■■■□□ 2.58
DTX3-208	ENST00000551632	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.17	■■■□□ 2.58
DTX3-208	ENST00000551632	KIF14	Q15058	1648 aa		31.17	■■■□□ 2.58
DTX3-208	ENST00000551632	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.16	■■■□□ 2.58
DTX3-208	ENST00000551632	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		31.15	■■■□□ 2.58
DTX3-208	ENST00000551632	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		31.11	■■■□□ 2.57
DTX3-208	ENST00000551632	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		31.03	■■■□□ 2.56
DTX3-208	ENST00000551632	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		31.01	■■■□□ 2.56
DTX3-208	ENST00000551632	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		31.01	■■■□□ 2.56
DTX3-208	ENST00000551632	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	30.99	■■■□□ 2.55
DTX3-208	ENST00000551632	MIA2	Q96PC5	1412 aa		30.99	■■■□□ 2.55
DTX3-208	ENST00000551632	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		30.98	■■■□□ 2.55
DTX3-208	ENST00000551632	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	30.98	■■■□□ 2.55
DTX3-208	ENST00000551632	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	30.96	■■■□□ 2.55
DTX3-208	ENST00000551632	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	30.95	■■■□□ 2.55
DTX3-208	ENST00000551632	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		30.94	■■■□□ 2.54
DTX3-208	ENST00000551632	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	30.93	■■■□□ 2.54
DTX3-208	ENST00000551632	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		30.93	■■■□□ 2.54
DTX3-208	ENST00000551632	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		30.92	■■■□□ 2.54
DTX3-208	ENST00000551632	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	30.89	■■■□□ 2.53
DTX3-208	ENST00000551632	ASXL2	Q76L83	1435 aa		30.89	■■■□□ 2.53
DTX3-208	ENST00000551632	PREX2	Q70Z35	1606 aa		30.87	■■■□□ 2.53
DTX3-208	ENST00000551632	ITGAE	P38570	1179 aa		30.87	■■■□□ 2.53
DTX3-208	ENST00000551632	KCNH8	Q96L42	1107 aa		30.87	■■■□□ 2.53
DTX3-208	ENST00000551632	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		30.85	■■■□□ 2.53
DTX3-208	ENST00000551632	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		30.84	■■■□□ 2.53
DTX3-208	ENST00000551632	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	30.83	■■■□□ 2.53
DTX3-208	ENST00000551632	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		30.8	■■■□□ 2.52
DTX3-208	ENST00000551632	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	30.78	■■■□□ 2.52

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