RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551219.5

PTPRR-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRR, Length 2,966 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-211ENST00000551219 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
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PTPRR-211ENST00000551219 ARAP1Q96P48 1450 aa9.78□□□□□ -0.84
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PTPRR-211ENST00000551219 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-211ENST00000551219 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRR-211ENST00000551219 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-211ENST00000551219 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-211ENST00000551219 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.5□□□□□ -0.89
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PTPRR-211ENST00000551219 ITGAEP38570 1179 aa9.49□□□□□ -0.89
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PTPRR-211ENST00000551219 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRR-211ENST00000551219 CCER2I3L3R5 266 aa9.48□□□□□ -0.89
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PTPRR-211ENST00000551219 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.41□□□□□ -0.9
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PTPRR-211ENST00000551219 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRR-211ENST00000551219 FANCD2Q9BXW9 1451 aa9.39□□□□□ -0.91
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PTPRR-211ENST00000551219 P3H3Q8IVL6 736 aa9.33□□□□□ -0.92
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PTPRR-211ENST00000551219 AKNAQ7Z591 1439 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-211ENST00000551219 GRIN2BQ13224 1484 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-211ENST00000551219 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-211ENST00000551219 NCOA2Q15596 1464 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRR-211ENST00000551219 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-211ENST00000551219 PKD2Q13563 968 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-211ENST00000551219 ARHGEF11O15085 1522 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRR-211ENST00000551219 HECW1Q76N89 1606 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-211ENST00000551219 ERICH6BQ5W0A0 696 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-211ENST00000551219 PTPRKQ15262 1439 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-211ENST00000551219 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRR-211ENST00000551219 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
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