RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547605.5

RBFOX1-210, Transcript of RNA binding fox-1 homolog 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBFOX1, Length 1,811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX1-210ENST00000547605 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.17■■■■□ 3.22
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RBFOX1-210ENST00000547605 CEP170Q5SW79 1584 aa35■■■■□ 3.19
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RBFOX1-210ENST00000547605 IQGAP2Q13576 1575 aa34.97■■■■□ 3.19
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RBFOX1-210ENST00000547605 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.69■■■■□ 3.14
RBFOX1-210ENST00000547605 OSCARQ8IYS5 282 aa34.64■■■■□ 3.14
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RBFOX1-210ENST00000547605 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.12
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RBFOX1-210ENST00000547605 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.21■■■■□ 3.07
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RBFOX1-210ENST00000547605 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.12■■■■□ 3.05
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RBFOX1-210ENST00000547605 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.9■■■■□ 3.02
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RBFOX1-210ENST00000547605 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.83■■■■□ 3.01
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RBFOX1-210ENST00000547605 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
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RBFOX1-210ENST00000547605 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33.3■■■□□ 2.92
RBFOX1-210ENST00000547605 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
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RBFOX1-210ENST00000547605 PREX2Q70Z35 1606 aa33.26■■■□□ 2.92
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