RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.5□□□□□ -0.09
CS-205ENST00000546891 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.49□□□□□ -0.09
CS-205ENST00000546891 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CS-205ENST00000546891 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CS-205ENST00000546891 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.48□□□□□ -0.09
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CS-205ENST00000546891 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.47□□□□□ -0.09
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CS-205ENST00000546891 FMN1Q68DA7 1419 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-205ENST00000546891 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.44□□□□□ -0.1
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CS-205ENST00000546891 MAPKBP1O60336 1514 aa14.2□□□□□ -0.14
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CS-205ENST00000546891 NEUROD1Q13562 356 aa14.14□□□□□ -0.15
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CS-205ENST00000546891 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CS-205ENST00000546891 AKNAQ7Z591 1439 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-205ENST00000546891 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
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CS-205ENST00000546891 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-205ENST00000546891 MIA2Q96PC5 1412 aa14.1□□□□□ -0.15
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CS-205ENST00000546891 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-205ENST00000546891 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CS-205ENST00000546891 GRIN2AQ12879 1464 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-205ENST00000546891 KIAA0556O60303 1618 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-205ENST00000546891 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
CS-205ENST00000546891 NAIPQ13075 1403 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-205ENST00000546891 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
CS-205ENST00000546891 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.03□□□□□ -0.16
CS-205ENST00000546891 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.03□□□□□ -0.16
CS-205ENST00000546891 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.02□□□□□ -0.17
CS-205ENST00000546891 DISP1Q96F81 1524 aa14□□□□□ -0.17
CS-205ENST00000546891 SYNJ2O15056 1496 aa14□□□□□ -0.17
CS-205ENST00000546891 PTPRKQ15262 1439 aa14□□□□□ -0.17
CS-205ENST00000546891 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
CS-205ENST00000546891 TONSLQ96HA7 1378 aa13.99□□□□□ -0.17
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CS-205ENST00000546891 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
CS-205ENST00000546891 ROCK1Q13464 1354 aa13.97□□□□□ -0.17
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CS-205ENST00000546891 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
CS-205ENST00000546891 SIN3AQ96ST3 1273 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-205ENST00000546891 NUP160Q12769 1436 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-205ENST00000546891 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
CS-205ENST00000546891 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
CS-205ENST00000546891 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
CS-205ENST00000546891 CEP170Q5SW79 1584 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-205ENST00000546891 ITSN2Q9NZM3 1697 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-205ENST00000546891 DAPK1P53355 1430 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-205ENST00000546891 ADCY10Q96PN6 1610 aa13.9□□□□□ -0.19
CS-205ENST00000546891 ABCC5O15440 1437 aa13.85□□□□□ -0.19
CS-205ENST00000546891 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-205ENST00000546891 CCER2I3L3R5 266 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-205ENST00000546891 ADGRL2O95490 1459 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-205ENST00000546891 TRIM52Q96A61 297 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-205ENST00000546891 ABCA8O94911 1581 aa13.82□□□□□ -0.2
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