RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544057.1

PHOX2A-202, Transcript of paired like homeobox 2A, humanhuman

TSL 3

Gene PHOX2A, Length 605 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2A-202ENST00000544057 SHROOM2Q13796 1616 aa49.16■■■■■ 5.46
PHOX2A-202ENST00000544057 JPH4Q96JJ6 628 aa49.13■■■■■ 5.46
PHOX2A-202ENST00000544057 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.11■■■■■ 5.45
PHOX2A-202ENST00000544057 CSRNP3Q8WYN3 585 aa49.1■■■■■ 5.45
PHOX2A-202ENST00000544057 ARAP1Q96P48 1450 aa49.1■■■■■ 5.45
PHOX2A-202ENST00000544057 PRXQ9BXM0 1461 aa49.04■■■■■ 5.44
PHOX2A-202ENST00000544057 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP48.97■■■■■ 5.43
PHOX2A-202ENST00000544057 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.9■■■■■ 5.42
PHOX2A-202ENST00000544057 IQGAP2Q13576 1575 aa48.85■■■■■ 5.41
PHOX2A-202ENST00000544057 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48.84■■■■■ 5.41
PHOX2A-202ENST00000544057 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.7■■■■■ 5.39
PHOX2A-202ENST00000544057 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.69■■■■■ 5.39
PHOX2A-202ENST00000544057 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.61■■■■■ 5.37
PHOX2A-202ENST00000544057 KIF21BO75037 1637 aa48.58■■■■■ 5.37
PHOX2A-202ENST00000544057 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.49■■■■■ 5.35
PHOX2A-202ENST00000544057 DISP1Q96F81 1524 aa48.48■■■■■ 5.35
PHOX2A-202ENST00000544057 PTPRGP23470 1445 aa48.44■■■■■ 5.35
PHOX2A-202ENST00000544057 GOLGA3Q08378 1498 aa48.43■■■■■ 5.34
PHOX2A-202ENST00000544057 KIAA0556O60303 1618 aa48.36■■■■■ 5.33
PHOX2A-202ENST00000544057 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP48.26■■■■■ 5.32
PHOX2A-202ENST00000544057 UBTFP17480 764 aaKnown RBP48.24■■■■■ 5.31
PHOX2A-202ENST00000544057 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP48.22■■■■■ 5.31
PHOX2A-202ENST00000544057 ADCY10Q96PN6 1610 aa48.15■■■■■ 5.3
PHOX2A-202ENST00000544057 EHMT2Q96KQ7 1210 aa48.13■■■■■ 5.3
PHOX2A-202ENST00000544057 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.11■■■■■ 5.29
PHOX2A-202ENST00000544057 UACAQ9BZF9 1416 aa48.11■■■■■ 5.29
PHOX2A-202ENST00000544057 SAMD9Q5K651 1589 aa48.08■■■■■ 5.29
PHOX2A-202ENST00000544057 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.07■■■■■ 5.29
PHOX2A-202ENST00000544057 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP48■■■■■ 5.27
PHOX2A-202ENST00000544057 P3H3Q8IVL6 736 aa48■■■■■ 5.27
PHOX2A-202ENST00000544057 ABCC2Q92887 1545 aa47.99■■■■■ 5.27
PHOX2A-202ENST00000544057 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.96■■■■■ 5.27
PHOX2A-202ENST00000544057 MAPKBP1O60336 1514 aa47.91■■■■■ 5.26
PHOX2A-202ENST00000544057 PLB1Q6P1J6 1458 aa47.86■■■■■ 5.25
PHOX2A-202ENST00000544057 ABCA8O94911 1581 aa47.83■■■■■ 5.25
PHOX2A-202ENST00000544057 KDM5BQ9UGL1 1544 aa47.81■■■■■ 5.24
PHOX2A-202ENST00000544057 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.78■■■■■ 5.24
PHOX2A-202ENST00000544057 ABCC10Q5T3U5 1492 aa47.68■■■■■ 5.22
PHOX2A-202ENST00000544057 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP47.67■■■■■ 5.22
PHOX2A-202ENST00000544057 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.65■■■■■ 5.22
PHOX2A-202ENST00000544057 ASXL2Q76L83 1435 aa47.64■■■■■ 5.22
PHOX2A-202ENST00000544057 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.62■■■■■ 5.21
PHOX2A-202ENST00000544057 FAM69CQ0P6D2 419 aa47.6■■■■■ 5.21
PHOX2A-202ENST00000544057 KIF13AQ9H1H9 1805 aa47.6■■■■■ 5.21
PHOX2A-202ENST00000544057 FMN1Q68DA7 1419 aa47.55■■■■■ 5.2
PHOX2A-202ENST00000544057 DIP2BQ9P265 1576 aa47.54■■■■■ 5.2
PHOX2A-202ENST00000544057 ATP10BO94823 1461 aa47.46■■■■■ 5.19
PHOX2A-202ENST00000544057 CLIP1P30622 1438 aa47.45■■■■■ 5.19
PHOX2A-202ENST00000544057 WDR7Q9Y4E6 1490 aa47.43■■■■■ 5.18
PHOX2A-202ENST00000544057 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.42■■■■■ 5.18
PHOX2A-202ENST00000544057 ARID3CA6NKF2 412 aa47.39■■■■■ 5.18
PHOX2A-202ENST00000544057 GLI2P10070 1586 aa47.38■■■■■ 5.18
PHOX2A-202ENST00000544057 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP47.35■■■■■ 5.17
PHOX2A-202ENST00000544057 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP47.35■■■■■ 5.17
PHOX2A-202ENST00000544057 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP47.35■■■■■ 5.17
PHOX2A-202ENST00000544057 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa47.32■■■■■ 5.17
PHOX2A-202ENST00000544057 HECW1Q76N89 1606 aa47.24■■■■■ 5.15
PHOX2A-202ENST00000544057 KCNH8Q96L42 1107 aa47.23■■■■■ 5.15
PHOX2A-202ENST00000544057 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP47.23■■■■■ 5.15
PHOX2A-202ENST00000544057 CEP162Q5TB80 1403 aa47.22■■■■■ 5.15
PHOX2A-202ENST00000544057 PLEKHD1A6NEE1 506 aa47.19■■■■■ 5.14
PHOX2A-202ENST00000544057 TSPOAP1O95153 1857 aa47.16■■■■■ 5.14
PHOX2A-202ENST00000544057 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa47.13■■■■■ 5.14
PHOX2A-202ENST00000544057 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa47.11■■■■■ 5.13
PHOX2A-202ENST00000544057 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP47.08■■■■■ 5.13
PHOX2A-202ENST00000544057 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP47.05■■■■■ 5.12
PHOX2A-202ENST00000544057 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.05■■■■■ 5.12
PHOX2A-202ENST00000544057 FYCO1Q9BQS8 1478 aa47.02■■■■■ 5.12
PHOX2A-202ENST00000544057 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP47.02■■■■■ 5.12
PHOX2A-202ENST00000544057 CD109Q6YHK3 1445 aa47.01■■■■■ 5.12
PHOX2A-202ENST00000544057 TEX14Q8IWB6 1497 aa47■■■■■ 5.11
PHOX2A-202ENST00000544057 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.97■■■■■ 5.11
PHOX2A-202ENST00000544057 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP46.97■■■■■ 5.11
PHOX2A-202ENST00000544057 ABCA9Q8IUA7 1624 aa46.93■■■■■ 5.1
PHOX2A-202ENST00000544057 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa46.91■■■■■ 5.1
PHOX2A-202ENST00000544057 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa46.88■■■■■ 5.09
PHOX2A-202ENST00000544057 KDM6BO15054 1643 aa46.79■■■■■ 5.08
PHOX2A-202ENST00000544057 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.79■■■■■ 5.08
PHOX2A-202ENST00000544057 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP46.73■■■■■ 5.07
PHOX2A-202ENST00000544057 PHLDB1Q86UU1 1377 aa46.69■■■■■ 5.06
PHOX2A-202ENST00000544057 VPS8Q8N3P4 1428 aa46.69■■■■■ 5.06
PHOX2A-202ENST00000544057 KIF14Q15058 1648 aa46.65■■■■■ 5.06
PHOX2A-202ENST00000544057 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.61■■■■■ 5.05
PHOX2A-202ENST00000544057 NEO1Q92859 1461 aa46.6■■■■■ 5.05
PHOX2A-202ENST00000544057 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP46.53■■■■■ 5.04
PHOX2A-202ENST00000544057 PLCH2O75038 1416 aa46.53■■■■■ 5.04
PHOX2A-202ENST00000544057 ARAP3Q8WWN8 1544 aa46.51■■■■■ 5.04
PHOX2A-202ENST00000544057 MTUS2Q5JR59 1369 aa46.49■■■■■ 5.03
PHOX2A-202ENST00000544057 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.49■■■■■ 5.03
PHOX2A-202ENST00000544057 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.48■■■■■ 5.03
PHOX2A-202ENST00000544057 FANCAO15360 1455 aa46.47■■■■■ 5.03
PHOX2A-202ENST00000544057 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa46.41■■■■■ 5.02
PHOX2A-202ENST00000544057 AKNAQ7Z591 1439 aa46.4■■■■■ 5.02
PHOX2A-202ENST00000544057 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa46.36■■■■■ 5.01
PHOX2A-202ENST00000544057 TIAM1Q13009 1591 aa46.35■■■■■ 5.01
PHOX2A-202ENST00000544057 MAP3K1Q13233 1512 aa46.33■■■■■ 5.01
PHOX2A-202ENST00000544057 ARHGAP5Q13017 1502 aa46.29■■■■■ 5
PHOX2A-202ENST00000544057 APLP2Q06481 763 aa46.28■■■■■ 5
PHOX2A-202ENST00000544057 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP46.25■■■■■ 5
PHOX2A-202ENST00000544057 PREX2Q70Z35 1606 aa46.25■■■■■ 4.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms