RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539011.5

CIB2-202, Transcript of calcium and integrin binding family member 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CIB2, Length 1,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB2-202ENST00000539011 ARHGEF11O15085 1522 aa41.09■■■■■ 4.17
CIB2-202ENST00000539011 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.04■■■■■ 4.16
CIB2-202ENST00000539011 SHROOM2Q13796 1616 aa40.93■■■■■ 4.14
CIB2-202ENST00000539011 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.9■■■■■ 4.14
CIB2-202ENST00000539011 KIF21BO75037 1637 aa40.87■■■■■ 4.13
CIB2-202ENST00000539011 ARAP1Q96P48 1450 aa40.81■■■■■ 4.12
CIB2-202ENST00000539011 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.79■■■■■ 4.12
CIB2-202ENST00000539011 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.73■■■■■ 4.11
CIB2-202ENST00000539011 GOLGA3Q08378 1498 aa40.72■■■■■ 4.11
CIB2-202ENST00000539011 IQGAP2Q13576 1575 aa40.7■■■■■ 4.11
CIB2-202ENST00000539011 JPH4Q96JJ6 628 aa40.66■■■■■ 4.1
CIB2-202ENST00000539011 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
CIB2-202ENST00000539011 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.64■■■■■ 4.1
CIB2-202ENST00000539011 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
CIB2-202ENST00000539011 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.58■■■■■ 4.09
CIB2-202ENST00000539011 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.48■■■■■ 4.07
CIB2-202ENST00000539011 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.44■■■■■ 4.07
CIB2-202ENST00000539011 DISP1Q96F81 1524 aa40.42■■■■■ 4.06
CIB2-202ENST00000539011 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.41■■■■■ 4.06
CIB2-202ENST00000539011 KIAA0556O60303 1618 aa40.36■■■■■ 4.05
CIB2-202ENST00000539011 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.27■■■■■ 4.04
CIB2-202ENST00000539011 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
CIB2-202ENST00000539011 SAMD9Q5K651 1589 aa40.18■■■■■ 4.02
CIB2-202ENST00000539011 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
CIB2-202ENST00000539011 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.15■■■■■ 4.02
CIB2-202ENST00000539011 PTPRGP23470 1445 aa40.13■■■■■ 4.01
CIB2-202ENST00000539011 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.06■■■■■ 4
CIB2-202ENST00000539011 P3H3Q8IVL6 736 aa40.02■■■■■ 4
CIB2-202ENST00000539011 CLIP1P30622 1438 aa40.02■■■■■ 4
CIB2-202ENST00000539011 CEP162Q5TB80 1403 aa40.02■■■■■ 4
CIB2-202ENST00000539011 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.01■■■■■ 4
CIB2-202ENST00000539011 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.92■■■■□ 3.98
CIB2-202ENST00000539011 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.91■■■■□ 3.98
CIB2-202ENST00000539011 UACAQ9BZF9 1416 aa39.9■■■■□ 3.98
CIB2-202ENST00000539011 ABCC2Q92887 1545 aa39.9■■■■□ 3.98
CIB2-202ENST00000539011 ABCA8O94911 1581 aa39.88■■■■□ 3.97
CIB2-202ENST00000539011 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.85■■■■□ 3.97
CIB2-202ENST00000539011 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
CIB2-202ENST00000539011 FMN1Q68DA7 1419 aa39.73■■■■□ 3.95
CIB2-202ENST00000539011 MAPKBP1O60336 1514 aa39.72■■■■□ 3.95
CIB2-202ENST00000539011 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.72■■■■□ 3.95
CIB2-202ENST00000539011 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.7■■■■□ 3.95
CIB2-202ENST00000539011 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.67■■■■□ 3.94
CIB2-202ENST00000539011 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.65■■■■□ 3.94
CIB2-202ENST00000539011 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
CIB2-202ENST00000539011 ARID3CA6NKF2 412 aa39.57■■■■□ 3.93
CIB2-202ENST00000539011 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
CIB2-202ENST00000539011 DIP2BQ9P265 1576 aa39.56■■■■□ 3.92
CIB2-202ENST00000539011 ASXL2Q76L83 1435 aa39.55■■■■□ 3.92
CIB2-202ENST00000539011 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.51■■■■□ 3.91
CIB2-202ENST00000539011 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.5■■■■□ 3.91
CIB2-202ENST00000539011 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.5■■■■□ 3.91
CIB2-202ENST00000539011 ATP10BO94823 1461 aa39.49■■■■□ 3.91
CIB2-202ENST00000539011 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.45■■■■□ 3.91
CIB2-202ENST00000539011 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.44■■■■□ 3.9
CIB2-202ENST00000539011 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.42■■■■□ 3.9
CIB2-202ENST00000539011 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.41■■■■□ 3.9
CIB2-202ENST00000539011 HECW1Q76N89 1606 aa39.39■■■■□ 3.9
CIB2-202ENST00000539011 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
CIB2-202ENST00000539011 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.38■■■■□ 3.89
CIB2-202ENST00000539011 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.35■■■■□ 3.89
CIB2-202ENST00000539011 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
CIB2-202ENST00000539011 TSPOAP1O95153 1857 aa39.31■■■■□ 3.88
CIB2-202ENST00000539011 GLI2P10070 1586 aa39.28■■■■□ 3.88
CIB2-202ENST00000539011 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
CIB2-202ENST00000539011 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
CIB2-202ENST00000539011 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.24■■■■□ 3.87
CIB2-202ENST00000539011 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
CIB2-202ENST00000539011 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.22■■■■□ 3.87
CIB2-202ENST00000539011 KCNH8Q96L42 1107 aa39.16■■■■□ 3.86
CIB2-202ENST00000539011 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
CIB2-202ENST00000539011 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.12■■■■□ 3.85
CIB2-202ENST00000539011 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.09■■■■□ 3.85
CIB2-202ENST00000539011 APLP2Q06481 763 aa39.09■■■■□ 3.85
CIB2-202ENST00000539011 MAP3K1Q13233 1512 aa39.08■■■■□ 3.85
CIB2-202ENST00000539011 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.06■■■■□ 3.84
CIB2-202ENST00000539011 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.03■■■■□ 3.84
CIB2-202ENST00000539011 TIAM1Q13009 1591 aa39.03■■■■□ 3.84
CIB2-202ENST00000539011 KIF14Q15058 1648 aa39■■■■□ 3.83
CIB2-202ENST00000539011 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.99■■■■□ 3.83
CIB2-202ENST00000539011 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.96■■■■□ 3.83
CIB2-202ENST00000539011 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.96■■■■□ 3.83
CIB2-202ENST00000539011 CD109Q6YHK3 1445 aa38.94■■■■□ 3.82
CIB2-202ENST00000539011 MTUS2Q5JR59 1369 aa38.93■■■■□ 3.82
CIB2-202ENST00000539011 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.89■■■■□ 3.82
CIB2-202ENST00000539011 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.89■■■■□ 3.82
CIB2-202ENST00000539011 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa38.84■■■■□ 3.81
CIB2-202ENST00000539011 KDM6BO15054 1643 aa38.82■■■■□ 3.81
CIB2-202ENST00000539011 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.81■■■■□ 3.8
CIB2-202ENST00000539011 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.76■■■■□ 3.8
CIB2-202ENST00000539011 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
CIB2-202ENST00000539011 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.66■■■■□ 3.78
CIB2-202ENST00000539011 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
CIB2-202ENST00000539011 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.65■■■■□ 3.78
CIB2-202ENST00000539011 NCOA2Q15596 1464 aa38.64■■■■□ 3.78
CIB2-202ENST00000539011 PREX2Q70Z35 1606 aa38.62■■■■□ 3.77
CIB2-202ENST00000539011 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
CIB2-202ENST00000539011 PLCH2O75038 1416 aa38.6■■■■□ 3.77
CIB2-202ENST00000539011 FANCAO15360 1455 aa38.6■■■■□ 3.77
CIB2-202ENST00000539011 NEO1Q92859 1461 aa38.59■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms