RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534617.5

BRMS1-209, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 905 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-209ENST00000534617 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
BRMS1-209ENST00000534617 JPH4Q96JJ6 628 aa23.97■■□□□ 1.43
BRMS1-209ENST00000534617 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.96■■□□□ 1.43
BRMS1-209ENST00000534617 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
BRMS1-209ENST00000534617 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.86■■□□□ 1.41
BRMS1-209ENST00000534617 IQGAP2Q13576 1575 aa23.85■■□□□ 1.41
BRMS1-209ENST00000534617 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.73■■□□□ 1.39
BRMS1-209ENST00000534617 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.72■■□□□ 1.39
BRMS1-209ENST00000534617 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.72■■□□□ 1.39
BRMS1-209ENST00000534617 PRXQ9BXM0 1461 aa23.69■■□□□ 1.38
BRMS1-209ENST00000534617 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.68■■□□□ 1.38
BRMS1-209ENST00000534617 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
BRMS1-209ENST00000534617 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.66■■□□□ 1.38
BRMS1-209ENST00000534617 DISP1Q96F81 1524 aa23.66■■□□□ 1.38
BRMS1-209ENST00000534617 PTPRGP23470 1445 aa23.66■■□□□ 1.38
BRMS1-209ENST00000534617 KIAA0556O60303 1618 aa23.62■■□□□ 1.37
BRMS1-209ENST00000534617 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
BRMS1-209ENST00000534617 MAPKBP1O60336 1514 aa23.59■■□□□ 1.37
BRMS1-209ENST00000534617 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.59■■□□□ 1.37
BRMS1-209ENST00000534617 EEA1Q15075 1411 aa23.59■■□□□ 1.37
BRMS1-209ENST00000534617 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.57■■□□□ 1.36
BRMS1-209ENST00000534617 GOLGA3Q08378 1498 aa23.52■■□□□ 1.36
BRMS1-209ENST00000534617 ABCC2Q92887 1545 aa23.52■■□□□ 1.36
BRMS1-209ENST00000534617 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.51■■□□□ 1.35
BRMS1-209ENST00000534617 DIP2BQ9P265 1576 aa23.51■■□□□ 1.35
BRMS1-209ENST00000534617 UACAQ9BZF9 1416 aa23.5■■□□□ 1.35
BRMS1-209ENST00000534617 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
BRMS1-209ENST00000534617 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.49■■□□□ 1.35
BRMS1-209ENST00000534617 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.47■■□□□ 1.35
BRMS1-209ENST00000534617 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.45■■□□□ 1.34
BRMS1-209ENST00000534617 KIF21BO75037 1637 aa23.41■■□□□ 1.34
BRMS1-209ENST00000534617 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
BRMS1-209ENST00000534617 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.4■■□□□ 1.34
BRMS1-209ENST00000534617 ASXL2Q76L83 1435 aa23.4■■□□□ 1.34
BRMS1-209ENST00000534617 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.39■■□□□ 1.34
BRMS1-209ENST00000534617 ABCA8O94911 1581 aa23.36■■□□□ 1.33
BRMS1-209ENST00000534617 SAMD9Q5K651 1589 aa23.36■■□□□ 1.33
BRMS1-209ENST00000534617 TSPOAP1O95153 1857 aa23.34■■□□□ 1.33
BRMS1-209ENST00000534617 P3H3Q8IVL6 736 aa23.33■■□□□ 1.33
BRMS1-209ENST00000534617 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
BRMS1-209ENST00000534617 GLI2P10070 1586 aa23.28■■□□□ 1.32
BRMS1-209ENST00000534617 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.26■■□□□ 1.31
BRMS1-209ENST00000534617 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
BRMS1-209ENST00000534617 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.24■■□□□ 1.31
BRMS1-209ENST00000534617 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.22■■□□□ 1.31
BRMS1-209ENST00000534617 KDM6BO15054 1643 aa23.22■■□□□ 1.31
BRMS1-209ENST00000534617 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.21■■□□□ 1.31
BRMS1-209ENST00000534617 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.21■■□□□ 1.31
BRMS1-209ENST00000534617 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
BRMS1-209ENST00000534617 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.2■■□□□ 1.3
BRMS1-209ENST00000534617 ARID3CA6NKF2 412 aa23.18■■□□□ 1.3
BRMS1-209ENST00000534617 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
BRMS1-209ENST00000534617 ATP10BO94823 1461 aa23.13■■□□□ 1.29
BRMS1-209ENST00000534617 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
BRMS1-209ENST00000534617 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.1■■□□□ 1.29
BRMS1-209ENST00000534617 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.09■■□□□ 1.29
BRMS1-209ENST00000534617 KCNH8Q96L42 1107 aa23.09■■□□□ 1.29
BRMS1-209ENST00000534617 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
BRMS1-209ENST00000534617 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
BRMS1-209ENST00000534617 CD109Q6YHK3 1445 aa23.03■■□□□ 1.28
BRMS1-209ENST00000534617 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.03■■□□□ 1.28
BRMS1-209ENST00000534617 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23■■□□□ 1.27
BRMS1-209ENST00000534617 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.98■■□□□ 1.27
BRMS1-209ENST00000534617 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
BRMS1-209ENST00000534617 FMN1Q68DA7 1419 aa22.96■■□□□ 1.27
BRMS1-209ENST00000534617 HECW1Q76N89 1606 aa22.95■■□□□ 1.26
BRMS1-209ENST00000534617 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
BRMS1-209ENST00000534617 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
BRMS1-209ENST00000534617 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
BRMS1-209ENST00000534617 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.88■■□□□ 1.25
BRMS1-209ENST00000534617 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
BRMS1-209ENST00000534617 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.83■■□□□ 1.25
BRMS1-209ENST00000534617 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
BRMS1-209ENST00000534617 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.81■■□□□ 1.24
BRMS1-209ENST00000534617 CLIP1P30622 1438 aa22.81■■□□□ 1.24
BRMS1-209ENST00000534617 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.8■■□□□ 1.24
BRMS1-209ENST00000534617 NEO1Q92859 1461 aa22.79■■□□□ 1.24
BRMS1-209ENST00000534617 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.76■■□□□ 1.23
BRMS1-209ENST00000534617 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.76■■□□□ 1.23
BRMS1-209ENST00000534617 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.75■■□□□ 1.23
BRMS1-209ENST00000534617 KIF14Q15058 1648 aa22.73■■□□□ 1.23
BRMS1-209ENST00000534617 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
BRMS1-209ENST00000534617 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.73■■□□□ 1.23
BRMS1-209ENST00000534617 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.72■■□□□ 1.23
BRMS1-209ENST00000534617 FANCAO15360 1455 aa22.72■■□□□ 1.23
BRMS1-209ENST00000534617 ADGRL1O94910 1474 aa22.72■■□□□ 1.23
BRMS1-209ENST00000534617 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.72■■□□□ 1.23
BRMS1-209ENST00000534617 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
BRMS1-209ENST00000534617 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.71■■□□□ 1.23
BRMS1-209ENST00000534617 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.69■■□□□ 1.22
BRMS1-209ENST00000534617 AKNAQ7Z591 1439 aa22.67■■□□□ 1.22
BRMS1-209ENST00000534617 RAPGEF3O95398 923 aa22.67■■□□□ 1.22
BRMS1-209ENST00000534617 CEP162Q5TB80 1403 aa22.65■■□□□ 1.22
BRMS1-209ENST00000534617 RICTORQ6R327 1708 aa22.64■■□□□ 1.21
BRMS1-209ENST00000534617 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
BRMS1-209ENST00000534617 PLCH2O75038 1416 aa22.64■■□□□ 1.21
BRMS1-209ENST00000534617 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.59■■□□□ 1.21
BRMS1-209ENST00000534617 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.58■■□□□ 1.21
BRMS1-209ENST00000534617 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.56■■□□□ 1.2
BRMS1-209ENST00000534617 PREX2Q70Z35 1606 aa22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 163 ms