RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.69■■■□□ 2.02
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 SHROOM2Q13796 1616 aa27.65■■■□□ 2.02
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.02■■□□□ 1.92
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.77■■□□□ 1.88
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.47■■□□□ 1.83
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.47■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.47■■□□□ 1.83
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.42■■□□□ 1.82
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.42■■□□□ 1.82
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.33■■□□□ 1.81
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.29■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.29■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIF14Q15058 1648 aa26.25■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CD109Q6YHK3 1445 aa26.25■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-211ENST00000533653 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.24■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KCNH8Q96L42 1107 aa26.23■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KDM6BO15054 1643 aa26.21■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.2■■□□□ 1.78
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.18■■□□□ 1.78
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.16■■□□□ 1.78
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.14■■□□□ 1.78
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NEO1Q92859 1461 aa26.12■■□□□ 1.77
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.12■■□□□ 1.77
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.11■■□□□ 1.77
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TIAM1Q13009 1591 aa26.1■■□□□ 1.77
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 PREX2Q70Z35 1606 aa26.05■■□□□ 1.76
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