RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527677.1

TSTA3-207, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-207ENST00000527677 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.25■■□□□ 1.95
TSTA3-207ENST00000527677 IQGAP2Q13576 1575 aa27.24■■□□□ 1.95
TSTA3-207ENST00000527677 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
TSTA3-207ENST00000527677 SHROOM2Q13796 1616 aa27.19■■□□□ 1.94
TSTA3-207ENST00000527677 JPH4Q96JJ6 628 aa27.16■■□□□ 1.94
TSTA3-207ENST00000527677 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.13■■□□□ 1.93
TSTA3-207ENST00000527677 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.13■■□□□ 1.93
TSTA3-207ENST00000527677 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.08■■□□□ 1.93
TSTA3-207ENST00000527677 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.08■■□□□ 1.93
TSTA3-207ENST00000527677 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
TSTA3-207ENST00000527677 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.05■■□□□ 1.92
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TSTA3-207ENST00000527677 ARHGEF11O15085 1522 aa27■■□□□ 1.91
TSTA3-207ENST00000527677 DISP1Q96F81 1524 aa26.97■■□□□ 1.91
TSTA3-207ENST00000527677 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.97■■□□□ 1.91
TSTA3-207ENST00000527677 SAMD9Q5K651 1589 aa26.96■■□□□ 1.91
TSTA3-207ENST00000527677 KIAA0556O60303 1618 aa26.95■■□□□ 1.91
TSTA3-207ENST00000527677 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.92■■□□□ 1.9
TSTA3-207ENST00000527677 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.92■■□□□ 1.9
TSTA3-207ENST00000527677 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.92■■□□□ 1.9
TSTA3-207ENST00000527677 CLIP1P30622 1438 aa26.89■■□□□ 1.89
TSTA3-207ENST00000527677 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.88■■□□□ 1.89
TSTA3-207ENST00000527677 CEP162Q5TB80 1403 aa26.86■■□□□ 1.89
TSTA3-207ENST00000527677 PTPRGP23470 1445 aa26.84■■□□□ 1.89
TSTA3-207ENST00000527677 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.84■■□□□ 1.89
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TSTA3-207ENST00000527677 ARAP1Q96P48 1450 aa26.81■■□□□ 1.88
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TSTA3-207ENST00000527677 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.69■■□□□ 1.86
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TSTA3-207ENST00000527677 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.67■■□□□ 1.86
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TSTA3-207ENST00000527677 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.54■■□□□ 1.84
TSTA3-207ENST00000527677 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.54■■□□□ 1.84
TSTA3-207ENST00000527677 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
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TSTA3-207ENST00000527677 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.5■■□□□ 1.83
TSTA3-207ENST00000527677 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
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TSTA3-207ENST00000527677 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.45■■□□□ 1.82
TSTA3-207ENST00000527677 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
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TSTA3-207ENST00000527677 MAPKBP1O60336 1514 aa26.39■■□□□ 1.81
TSTA3-207ENST00000527677 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
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TSTA3-207ENST00000527677 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.27■■□□□ 1.8
TSTA3-207ENST00000527677 ARID3CA6NKF2 412 aa26.26■■□□□ 1.79
TSTA3-207ENST00000527677 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.24■■□□□ 1.79
TSTA3-207ENST00000527677 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.23■■□□□ 1.79
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TSTA3-207ENST00000527677 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.17■■□□□ 1.78
TSTA3-207ENST00000527677 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.15■■□□□ 1.78
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TSTA3-207ENST00000527677 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.12■■□□□ 1.77
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TSTA3-207ENST00000527677 DIP2BQ9P265 1576 aa26.1■■□□□ 1.77
TSTA3-207ENST00000527677 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.08■■□□□ 1.77
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TSTA3-207ENST00000527677 CD109Q6YHK3 1445 aa25.96■■□□□ 1.75
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TSTA3-207ENST00000527677 NCOA2Q15596 1464 aa25.95■■□□□ 1.74
TSTA3-207ENST00000527677 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.93■■□□□ 1.74
TSTA3-207ENST00000527677 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.92■■□□□ 1.74
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TSTA3-207ENST00000527677 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.87■■□□□ 1.73
TSTA3-207ENST00000527677 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
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TSTA3-207ENST00000527677 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.85■■□□□ 1.73
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TSTA3-207ENST00000527677 NEO1Q92859 1461 aa25.83■■□□□ 1.73
TSTA3-207ENST00000527677 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.81■■□□□ 1.72
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