RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527006.1

TSTA3-205, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 412 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-205ENST00000527006 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.1■■□□□ 1.29
TSTA3-205ENST00000527006 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.08■■□□□ 1.29
TSTA3-205ENST00000527006 CEP170Q5SW79 1584 aa23.03■■□□□ 1.28
TSTA3-205ENST00000527006 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.03■■□□□ 1.28
TSTA3-205ENST00000527006 IQGAP2Q13576 1575 aa23■■□□□ 1.27
TSTA3-205ENST00000527006 JPH4Q96JJ6 628 aa22.98■■□□□ 1.27
TSTA3-205ENST00000527006 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-205ENST00000527006 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-205ENST00000527006 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.91■■□□□ 1.26
TSTA3-205ENST00000527006 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-205ENST00000527006 CLIP1P30622 1438 aa22.87■■□□□ 1.25
TSTA3-205ENST00000527006 CEP162Q5TB80 1403 aa22.86■■□□□ 1.25
TSTA3-205ENST00000527006 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.85■■□□□ 1.25
TSTA3-205ENST00000527006 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
TSTA3-205ENST00000527006 SHROOM2Q13796 1616 aa22.82■■□□□ 1.24
TSTA3-205ENST00000527006 P3H3Q8IVL6 736 aa22.77■■□□□ 1.24
TSTA3-205ENST00000527006 SAMD9Q5K651 1589 aa22.76■■□□□ 1.23
TSTA3-205ENST00000527006 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.74■■□□□ 1.23
TSTA3-205ENST00000527006 DISP1Q96F81 1524 aa22.74■■□□□ 1.23
TSTA3-205ENST00000527006 KIAA0556O60303 1618 aa22.73■■□□□ 1.23
TSTA3-205ENST00000527006 FMN1Q68DA7 1419 aa22.69■■□□□ 1.22
TSTA3-205ENST00000527006 PTPRGP23470 1445 aa22.68■■□□□ 1.22
TSTA3-205ENST00000527006 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.67■■□□□ 1.22
TSTA3-205ENST00000527006 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
TSTA3-205ENST00000527006 ARHGEF11O15085 1522 aa22.63■■□□□ 1.21
TSTA3-205ENST00000527006 ARAP1Q96P48 1450 aa22.63■■□□□ 1.21
TSTA3-205ENST00000527006 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.6■■□□□ 1.21
TSTA3-205ENST00000527006 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.59■■□□□ 1.21
TSTA3-205ENST00000527006 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.57■■□□□ 1.2
TSTA3-205ENST00000527006 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TSTA3-205ENST00000527006 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.55■■□□□ 1.2
TSTA3-205ENST00000527006 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.55■■□□□ 1.2
TSTA3-205ENST00000527006 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.55■■□□□ 1.2
TSTA3-205ENST00000527006 APLP2Q06481 763 aa22.54■■□□□ 1.2
TSTA3-205ENST00000527006 UACAQ9BZF9 1416 aa22.52■■□□□ 1.2
TSTA3-205ENST00000527006 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.51■■□□□ 1.19
TSTA3-205ENST00000527006 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.5■■□□□ 1.19
TSTA3-205ENST00000527006 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.47■■□□□ 1.19
TSTA3-205ENST00000527006 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
TSTA3-205ENST00000527006 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.46■■□□□ 1.19
TSTA3-205ENST00000527006 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.46■■□□□ 1.19
TSTA3-205ENST00000527006 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.45■■□□□ 1.18
TSTA3-205ENST00000527006 ABCA8O94911 1581 aa22.45■■□□□ 1.18
TSTA3-205ENST00000527006 HECW1Q76N89 1606 aa22.44■■□□□ 1.18
TSTA3-205ENST00000527006 ABCC2Q92887 1545 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-205ENST00000527006 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-205ENST00000527006 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-205ENST00000527006 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-205ENST00000527006 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-205ENST00000527006 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-205ENST00000527006 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-205ENST00000527006 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-205ENST00000527006 MAP3K1Q13233 1512 aa22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-205ENST00000527006 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-205ENST00000527006 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-205ENST00000527006 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-205ENST00000527006 ARID3CA6NKF2 412 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-205ENST00000527006 ATP10BO94823 1461 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-205ENST00000527006 TIAM1Q13009 1591 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-205ENST00000527006 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-205ENST00000527006 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TSTA3-205ENST00000527006 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TSTA3-205ENST00000527006 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.2■■□□□ 1.15
TSTA3-205ENST00000527006 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.18■■□□□ 1.14
TSTA3-205ENST00000527006 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.18■■□□□ 1.14
TSTA3-205ENST00000527006 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TSTA3-205ENST00000527006 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TSTA3-205ENST00000527006 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.15■■□□□ 1.14
TSTA3-205ENST00000527006 ASXL2Q76L83 1435 aa22.14■■□□□ 1.14
TSTA3-205ENST00000527006 MAPKBP1O60336 1514 aa22.13■■□□□ 1.13
TSTA3-205ENST00000527006 KCNH8Q96L42 1107 aa22.13■■□□□ 1.13
TSTA3-205ENST00000527006 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.13■■□□□ 1.13
TSTA3-205ENST00000527006 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TSTA3-205ENST00000527006 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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TSTA3-205ENST00000527006 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.05■■□□□ 1.12
TSTA3-205ENST00000527006 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.02■■□□□ 1.12
TSTA3-205ENST00000527006 NCOA2Q15596 1464 aa22■■□□□ 1.11
TSTA3-205ENST00000527006 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-205ENST00000527006 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-205ENST00000527006 GLI2P10070 1586 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-205ENST00000527006 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-205ENST00000527006 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-205ENST00000527006 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-205ENST00000527006 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-205ENST00000527006 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-205ENST00000527006 CD109Q6YHK3 1445 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-205ENST00000527006 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-205ENST00000527006 PLCH2O75038 1416 aa21.89■■□□□ 1.1
TSTA3-205ENST00000527006 MIA2Q96PC5 1412 aa21.89■■□□□ 1.1
TSTA3-205ENST00000527006 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.89■■□□□ 1.1
TSTA3-205ENST00000527006 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.89■■□□□ 1.1
TSTA3-205ENST00000527006 DIP2BQ9P265 1576 aa21.89■■□□□ 1.09
TSTA3-205ENST00000527006 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
TSTA3-205ENST00000527006 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.87■■□□□ 1.09
TSTA3-205ENST00000527006 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.86■■□□□ 1.09
TSTA3-205ENST00000527006 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.86■■□□□ 1.09
TSTA3-205ENST00000527006 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TSTA3-205ENST00000527006 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.84■■□□□ 1.09
TSTA3-205ENST00000527006 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.83■■□□□ 1.09
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