RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519254.2

CLN8-204, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-204ENST00000519254 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN8-204ENST00000519254 CHD1O14646 1710 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN8-204ENST00000519254 CLIP1P30622 1438 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN8-204ENST00000519254 CEP170Q5SW79 1584 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN8-204ENST00000519254 IQGAP2Q13576 1575 aa22.88■■□□□ 1.25
CLN8-204ENST00000519254 NUP160Q12769 1436 aa22.87■■□□□ 1.25
CLN8-204ENST00000519254 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.86■■□□□ 1.25
CLN8-204ENST00000519254 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.81■■□□□ 1.24
CLN8-204ENST00000519254 P3H3Q8IVL6 736 aa22.78■■□□□ 1.24
CLN8-204ENST00000519254 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.77■■□□□ 1.24
CLN8-204ENST00000519254 ARAP1Q96P48 1450 aa22.76■■□□□ 1.23
CLN8-204ENST00000519254 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.76■■□□□ 1.23
CLN8-204ENST00000519254 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.73■■□□□ 1.23
CLN8-204ENST00000519254 SAMD9Q5K651 1589 aa22.73■■□□□ 1.23
CLN8-204ENST00000519254 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.72■■□□□ 1.23
CLN8-204ENST00000519254 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CLN8-204ENST00000519254 JPH4Q96JJ6 628 aa22.7■■□□□ 1.22
CLN8-204ENST00000519254 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.68■■□□□ 1.22
CLN8-204ENST00000519254 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.67■■□□□ 1.22
CLN8-204ENST00000519254 DISP1Q96F81 1524 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-204ENST00000519254 KIAA0556O60303 1618 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-204ENST00000519254 OSCARQ8IYS5 282 aa22.65■■□□□ 1.22
CLN8-204ENST00000519254 SHROOM2Q13796 1616 aa22.62■■□□□ 1.21
CLN8-204ENST00000519254 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CLN8-204ENST00000519254 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CLN8-204ENST00000519254 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.6■■□□□ 1.21
CLN8-204ENST00000519254 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CLN8-204ENST00000519254 FMN1Q68DA7 1419 aa22.55■■□□□ 1.2
CLN8-204ENST00000519254 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CLN8-204ENST00000519254 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-204ENST00000519254 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CLN8-204ENST00000519254 APLP2Q06481 763 aa22.47■■□□□ 1.19
CLN8-204ENST00000519254 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.46■■□□□ 1.19
CLN8-204ENST00000519254 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.46■■□□□ 1.19
CLN8-204ENST00000519254 PTPRGP23470 1445 aa22.42■■□□□ 1.18
CLN8-204ENST00000519254 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.4■■□□□ 1.18
CLN8-204ENST00000519254 HECW1Q76N89 1606 aa22.39■■□□□ 1.18
CLN8-204ENST00000519254 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.39■■□□□ 1.18
CLN8-204ENST00000519254 ARID3CA6NKF2 412 aa22.37■■□□□ 1.17
CLN8-204ENST00000519254 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.35■■□□□ 1.17
CLN8-204ENST00000519254 TIAM1Q13009 1591 aa22.34■■□□□ 1.17
CLN8-204ENST00000519254 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.33■■□□□ 1.17
CLN8-204ENST00000519254 ABCA8O94911 1581 aa22.33■■□□□ 1.17
CLN8-204ENST00000519254 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CLN8-204ENST00000519254 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CLN8-204ENST00000519254 ARHGEF11O15085 1522 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-204ENST00000519254 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CLN8-204ENST00000519254 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CLN8-204ENST00000519254 MAP3K1Q13233 1512 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-204ENST00000519254 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.28■■□□□ 1.16
CLN8-204ENST00000519254 UACAQ9BZF9 1416 aa22.28■■□□□ 1.16
CLN8-204ENST00000519254 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CLN8-204ENST00000519254 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CLN8-204ENST00000519254 HRCP23327 699 aa22.25■■□□□ 1.15
CLN8-204ENST00000519254 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.23■■□□□ 1.15
CLN8-204ENST00000519254 ABCC2Q92887 1545 aa22.23■■□□□ 1.15
CLN8-204ENST00000519254 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.22■■□□□ 1.15
CLN8-204ENST00000519254 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.22■■□□□ 1.15
CLN8-204ENST00000519254 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.22■■□□□ 1.15
CLN8-204ENST00000519254 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.19■■□□□ 1.14
CLN8-204ENST00000519254 ATP10BO94823 1461 aa22.17■■□□□ 1.14
CLN8-204ENST00000519254 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.17■■□□□ 1.14
CLN8-204ENST00000519254 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN8-204ENST00000519254 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN8-204ENST00000519254 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.14■■□□□ 1.14
CLN8-204ENST00000519254 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CLN8-204ENST00000519254 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CLN8-204ENST00000519254 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-204ENST00000519254 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN8-204ENST00000519254 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CLN8-204ENST00000519254 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN8-204ENST00000519254 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CLN8-204ENST00000519254 NCOA2Q15596 1464 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN8-204ENST00000519254 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN8-204ENST00000519254 KIF14Q15058 1648 aa22■■□□□ 1.11
CLN8-204ENST00000519254 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
CLN8-204ENST00000519254 KCNH8Q96L42 1107 aa21.94■■□□□ 1.1
CLN8-204ENST00000519254 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CLN8-204ENST00000519254 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-204ENST00000519254 ASXL2Q76L83 1435 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-204ENST00000519254 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-204ENST00000519254 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.91■■□□□ 1.1
CLN8-204ENST00000519254 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.88■■□□□ 1.09
CLN8-204ENST00000519254 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-204ENST00000519254 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CLN8-204ENST00000519254 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.86■■□□□ 1.09
CLN8-204ENST00000519254 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.095e-6■□□□□ 9.5
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CLN8-204ENST00000519254 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.84■■□□□ 1.09
CLN8-204ENST00000519254 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.84■■□□□ 1.09
CLN8-204ENST00000519254 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CLN8-204ENST00000519254 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.82■■□□□ 1.08
CLN8-204ENST00000519254 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.82■■□□□ 1.08
CLN8-204ENST00000519254 MAPKBP1O60336 1514 aa21.81■■□□□ 1.08
CLN8-204ENST00000519254 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CLN8-204ENST00000519254 MIA2Q96PC5 1412 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-204ENST00000519254 ITGAEP38570 1179 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-204ENST00000519254 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CLN8-204ENST00000519254 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN8-204ENST00000519254 PREX2Q70Z35 1606 aa21.77■■□□□ 1.07
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