RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518547.5

MTSS1-205, Transcript of MTSS1, I-BAR domain containing, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MTSS1, Length 4,944 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1-205ENST00000518547 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.29■□□□□ 0.04
MTSS1-205ENST00000518547 CUX2O14529 1486 aa15.27■□□□□ 0.03
MTSS1-205ENST00000518547 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
MTSS1-205ENST00000518547 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.25■□□□□ 0.03
MTSS1-205ENST00000518547 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.24■□□□□ 0.03
MTSS1-205ENST00000518547 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
MTSS1-205ENST00000518547 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
MTSS1-205ENST00000518547 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.21■□□□□ 0.03
MTSS1-205ENST00000518547 CUX1P39880 1505 aa15.19■□□□□ 0.02
MTSS1-205ENST00000518547 PLEKHG5O94827 1062 aa15.19■□□□□ 0.02
MTSS1-205ENST00000518547 TONSLQ96HA7 1378 aa15.19■□□□□ 0.02
MTSS1-205ENST00000518547 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
MTSS1-205ENST00000518547 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
MTSS1-205ENST00000518547 CFTRP13569 1480 aa15.18■□□□□ 0.02
MTSS1-205ENST00000518547 TSPY4P0CV99 314 aa15.17■□□□□ 0.02
MTSS1-205ENST00000518547 TSPY10P0CW01 314 aa15.17■□□□□ 0.02
MTSS1-205ENST00000518547 HMGXB3Q12766 1538 aa15.17■□□□□ 0.02
MTSS1-205ENST00000518547 TOP2BQ02880 1626 aa15.16■□□□□ 0.02
MTSS1-205ENST00000518547 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.16■□□□□ 0.02
MTSS1-205ENST00000518547 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.16■□□□□ 0.02
MTSS1-205ENST00000518547 A0A0G2JS52 829 aa15.16■□□□□ 0.02
MTSS1-205ENST00000518547 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
MTSS1-205ENST00000518547 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.14■□□□□ 0.01
MTSS1-205ENST00000518547 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
MTSS1-205ENST00000518547 KCNH8Q96L42 1107 aa15.12■□□□□ 0.01
MTSS1-205ENST00000518547 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.12■□□□□ 0.01
MTSS1-205ENST00000518547 KIF21BO75037 1637 aa15.12■□□□□ 0.01
MTSS1-205ENST00000518547 NESP48681 1621 aa15.12■□□□□ 0.01
MTSS1-205ENST00000518547 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.11■□□□□ 0.01
MTSS1-205ENST00000518547 IGF1RP08069 1367 aa15.1■□□□□ 0.01
MTSS1-205ENST00000518547 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.09■□□□□ 0.01
MTSS1-205ENST00000518547 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.09■□□□□ 0.01
MTSS1-205ENST00000518547 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
MTSS1-205ENST00000518547 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.08■□□□□ 0
MTSS1-205ENST00000518547 PRXQ9BXM0 1461 aa15.06■□□□□ 0
MTSS1-205ENST00000518547 TMC1Q8TDI8 760 aa15.05■□□□□ 0
MTSS1-205ENST00000518547 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
MTSS1-205ENST00000518547 ARAP1Q96P48 1450 aa15.04■□□□□ -0
MTSS1-205ENST00000518547 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.04■□□□□ -0
MTSS1-205ENST00000518547 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.04■□□□□ -0
MTSS1-205ENST00000518547 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
MTSS1-205ENST00000518547 C14orf37Q86TY3 774 aa15.03■□□□□ -0
MTSS1-205ENST00000518547 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
MTSS1-205ENST00000518547 FKBP8Q14318 412 aa15.01□□□□□ -0.01
MTSS1-205ENST00000518547 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
MTSS1-205ENST00000518547 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.99□□□□□ -0.01
MTSS1-205ENST00000518547 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.98□□□□□ -0.01
MTSS1-205ENST00000518547 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
MTSS1-205ENST00000518547 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
MTSS1-205ENST00000518547 RGL3Q3MIN7 710 aa14.97□□□□□ -0.01
MTSS1-205ENST00000518547 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.96□□□□□ -0.01
MTSS1-205ENST00000518547 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
MTSS1-205ENST00000518547 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.96□□□□□ -0.02
MTSS1-205ENST00000518547 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.95□□□□□ -0.02
MTSS1-205ENST00000518547 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.95□□□□□ -0.02
MTSS1-205ENST00000518547 MRS2Q9HD23 443 aa14.95□□□□□ -0.02
MTSS1-205ENST00000518547 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.94□□□□□ -0.02
MTSS1-205ENST00000518547 MIER1Q8N108 512 aa14.94□□□□□ -0.02
MTSS1-205ENST00000518547 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
MTSS1-205ENST00000518547 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
MTSS1-205ENST00000518547 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
MTSS1-205ENST00000518547 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.89□□□□□ -0.03
MTSS1-205ENST00000518547 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
MTSS1-205ENST00000518547 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.88□□□□□ -0.03
MTSS1-205ENST00000518547 TOPBP1Q92547 1522 aa14.88□□□□□ -0.03
MTSS1-205ENST00000518547 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.88□□□□□ -0.03
MTSS1-205ENST00000518547 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.88□□□□□ -0.03
MTSS1-205ENST00000518547 ARXQ96QS3 562 aa14.85□□□□□ -0.03
MTSS1-205ENST00000518547 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
MTSS1-205ENST00000518547 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.84□□□□□ -0.03
MTSS1-205ENST00000518547 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
MTSS1-205ENST00000518547 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
MTSS1-205ENST00000518547 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.83□□□□□ -0.04
MTSS1-205ENST00000518547 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
MTSS1-205ENST00000518547 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
MTSS1-205ENST00000518547 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
MTSS1-205ENST00000518547 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.81□□□□□ -0.04
MTSS1-205ENST00000518547 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.8□□□□□ -0.04
MTSS1-205ENST00000518547 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.78□□□□□ -0.04
MTSS1-205ENST00000518547 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 22.7
MTSS1-205ENST00000518547 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.77□□□□□ -0.04
MTSS1-205ENST00000518547 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
MTSS1-205ENST00000518547 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.77□□□□□ -0.04
MTSS1-205ENST00000518547 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
MTSS1-205ENST00000518547 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.73□□□□□ -0.05
MTSS1-205ENST00000518547 NEUROD2Q15784 382 aa14.73□□□□□ -0.05
MTSS1-205ENST00000518547 ERCC6Q03468 1493 aa14.72□□□□□ -0.05
MTSS1-205ENST00000518547 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.72□□□□□ -0.05
MTSS1-205ENST00000518547 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.72□□□□□ -0.05
MTSS1-205ENST00000518547 MLECQ14165 292 aa14.71□□□□□ -0.05
MTSS1-205ENST00000518547 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
MTSS1-205ENST00000518547 POGKQ9P215 609 aa14.7□□□□□ -0.06
MTSS1-205ENST00000518547 FMN1Q68DA7 1419 aa14.69□□□□□ -0.06
MTSS1-205ENST00000518547 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.69□□□□□ -0.06
MTSS1-205ENST00000518547 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MTSS1-205ENST00000518547 CFAP53Q96M91 514 aa14.69□□□□□ -0.06
MTSS1-205ENST00000518547 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.68□□□□□ -0.06
MTSS1-205ENST00000518547 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
MTSS1-205ENST00000518547 NBR1Q14596 966 aa14.67□□□□□ -0.06
MTSS1-205ENST00000518547 TIAM1Q13009 1591 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.3 ms