RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517992.1

SNTB1-202, Transcript of syntrophin beta 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNTB1, Length 2,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1-202ENST00000517992 MYT1Q01538 1121 aa37.22■■■■□ 3.55
SNTB1-202ENST00000517992 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.22■■■■□ 3.55
SNTB1-202ENST00000517992 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.22■■■■□ 3.552e-7■■■■■ 27.6
SNTB1-202ENST00000517992 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.22■■■■□ 3.55
SNTB1-202ENST00000517992 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
SNTB1-202ENST00000517992 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.16■■■■□ 3.54
SNTB1-202ENST00000517992 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
SNTB1-202ENST00000517992 CLSPNQ9HAW4 1339 aa37.15■■■■□ 3.54
SNTB1-202ENST00000517992 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
SNTB1-202ENST00000517992 IGF1RP08069 1367 aa37.14■■■■□ 3.54
SNTB1-202ENST00000517992 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
SNTB1-202ENST00000517992 PBRM1Q86U86 1689 aa37.05■■■■□ 3.52
SNTB1-202ENST00000517992 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
SNTB1-202ENST00000517992 MAP3K1Q13233 1512 aa37.03■■■■□ 3.52
SNTB1-202ENST00000517992 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.98■■■■□ 3.51
SNTB1-202ENST00000517992 NEUROD1Q13562 356 aa36.97■■■■□ 3.51
SNTB1-202ENST00000517992 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
SNTB1-202ENST00000517992 GRIN2BQ13224 1484 aa36.96■■■■□ 3.51
SNTB1-202ENST00000517992 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.89■■■■□ 3.5
SNTB1-202ENST00000517992 TIAM1Q13009 1591 aa36.89■■■■□ 3.5
SNTB1-202ENST00000517992 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.85■■■■□ 3.49
SNTB1-202ENST00000517992 CUL7Q14999 1698 aa36.85■■■■□ 3.49
SNTB1-202ENST00000517992 ADAMTS12P58397 1594 aa36.79■■■■□ 3.48
SNTB1-202ENST00000517992 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.76■■■■□ 3.47
SNTB1-202ENST00000517992 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.72■■■■□ 3.47
SNTB1-202ENST00000517992 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
SNTB1-202ENST00000517992 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.69■■■■□ 3.46
SNTB1-202ENST00000517992 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.66■■■■□ 3.46
SNTB1-202ENST00000517992 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
SNTB1-202ENST00000517992 SYNJ2O15056 1496 aa36.6■■■■□ 3.45
SNTB1-202ENST00000517992 FBLN2P98095 1184 aa36.6■■■■□ 3.45
SNTB1-202ENST00000517992 MIER1Q8N108 512 aa36.6■■■■□ 3.45
SNTB1-202ENST00000517992 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa36.57■■■■□ 3.45
SNTB1-202ENST00000517992 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
SNTB1-202ENST00000517992 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.55■■■■□ 3.44
SNTB1-202ENST00000517992 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.54■■■■□ 3.44
SNTB1-202ENST00000517992 GRIN2AQ12879 1464 aa36.53■■■■□ 3.44
SNTB1-202ENST00000517992 CHD1O14646 1710 aa36.51■■■■□ 3.43
SNTB1-202ENST00000517992 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.47■■■■□ 3.43
SNTB1-202ENST00000517992 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.47■■■■□ 3.43
SNTB1-202ENST00000517992 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.45■■■■□ 3.43
SNTB1-202ENST00000517992 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.41■■■■□ 3.42
SNTB1-202ENST00000517992 MAPKBP1O60336 1514 aa36.4■■■■□ 3.42
SNTB1-202ENST00000517992 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.4■■■■□ 3.42
SNTB1-202ENST00000517992 CEP170Q5SW79 1584 aa36.36■■■■□ 3.41
SNTB1-202ENST00000517992 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.36■■■■□ 3.41
SNTB1-202ENST00000517992 ITGAEP38570 1179 aa36.33■■■■□ 3.41
SNTB1-202ENST00000517992 FMN1Q68DA7 1419 aa36.32■■■■□ 3.4
SNTB1-202ENST00000517992 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
SNTB1-202ENST00000517992 NUP160Q12769 1436 aa36.28■■■■□ 3.4
SNTB1-202ENST00000517992 SAMD9Q5K651 1589 aa36.27■■■■□ 3.4
SNTB1-202ENST00000517992 P3H3Q8IVL6 736 aa36.24■■■■□ 3.39
SNTB1-202ENST00000517992 IQGAP2Q13576 1575 aa36.2■■■■□ 3.38
SNTB1-202ENST00000517992 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.19■■■■□ 3.38
SNTB1-202ENST00000517992 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
SNTB1-202ENST00000517992 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.09■■■■□ 3.37
SNTB1-202ENST00000517992 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
SNTB1-202ENST00000517992 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.06■■■■□ 3.36
SNTB1-202ENST00000517992 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.03■■■■□ 3.36
SNTB1-202ENST00000517992 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.01■■■■□ 3.36
SNTB1-202ENST00000517992 OSCARQ8IYS5 282 aa36■■■■□ 3.35
SNTB1-202ENST00000517992 JPH4Q96JJ6 628 aa35.99■■■■□ 3.35
SNTB1-202ENST00000517992 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.99■■■■□ 3.35
SNTB1-202ENST00000517992 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.98■■■■□ 3.35
SNTB1-202ENST00000517992 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.96■■■■□ 3.35
SNTB1-202ENST00000517992 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
SNTB1-202ENST00000517992 DISP1Q96F81 1524 aa35.9■■■■□ 3.34
SNTB1-202ENST00000517992 SHROOM2Q13796 1616 aa35.9■■■■□ 3.34
SNTB1-202ENST00000517992 HFM1A2PYH4 1435 aa35.89■■■■□ 3.34
SNTB1-202ENST00000517992 NCOA2Q15596 1464 aa35.89■■■■□ 3.34
SNTB1-202ENST00000517992 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.89■■■■□ 3.34
SNTB1-202ENST00000517992 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.86■■■■□ 3.33
SNTB1-202ENST00000517992 KIAA0556O60303 1618 aa35.85■■■■□ 3.33
SNTB1-202ENST00000517992 ARHGEF11O15085 1522 aa35.85■■■■□ 3.33
SNTB1-202ENST00000517992 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
SNTB1-202ENST00000517992 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.84■■■■□ 3.33
SNTB1-202ENST00000517992 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.82■■■■□ 3.32
SNTB1-202ENST00000517992 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.8■■■■□ 3.32
SNTB1-202ENST00000517992 UACAQ9BZF9 1416 aa35.79■■■■□ 3.32
SNTB1-202ENST00000517992 HECW1Q76N89 1606 aa35.78■■■■□ 3.32
SNTB1-202ENST00000517992 PTPRKQ15262 1439 aa35.77■■■■□ 3.32
SNTB1-202ENST00000517992 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.74■■■■□ 3.31
SNTB1-202ENST00000517992 NAIPQ13075 1403 aa35.71■■■■□ 3.31
SNTB1-202ENST00000517992 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
SNTB1-202ENST00000517992 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
SNTB1-202ENST00000517992 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.69■■■■□ 3.3
SNTB1-202ENST00000517992 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.61■■■■□ 3.29
SNTB1-202ENST00000517992 AKNAQ7Z591 1439 aa35.61■■■■□ 3.29
SNTB1-202ENST00000517992 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
SNTB1-202ENST00000517992 TONSLQ96HA7 1378 aa35.58■■■■□ 3.29
SNTB1-202ENST00000517992 MIA2Q96PC5 1412 aa35.53■■■■□ 3.28
SNTB1-202ENST00000517992 PTPRGP23470 1445 aa35.51■■■■□ 3.27
SNTB1-202ENST00000517992 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.47■■■■□ 3.27
SNTB1-202ENST00000517992 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
SNTB1-202ENST00000517992 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
SNTB1-202ENST00000517992 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.42■■■■□ 3.26
SNTB1-202ENST00000517992 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.41■■■■□ 3.26
SNTB1-202ENST00000517992 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
SNTB1-202ENST00000517992 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.37■■■■□ 3.25
SNTB1-202ENST00000517992 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.37■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms