RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 CHD1O14646 1710 aa24.89■■□□□ 1.58
TRPS1-206ENST00000517323 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.88■■□□□ 1.57
TRPS1-206ENST00000517323 CLIP1P30622 1438 aa24.83■■□□□ 1.57
TRPS1-206ENST00000517323 CEP170Q5SW79 1584 aa24.83■■□□□ 1.57
TRPS1-206ENST00000517323 P3H3Q8IVL6 736 aa24.8■■□□□ 1.56
TRPS1-206ENST00000517323 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.72■■□□□ 1.55
TRPS1-206ENST00000517323 IQGAP2Q13576 1575 aa24.71■■□□□ 1.55
TRPS1-206ENST00000517323 NUP160Q12769 1436 aa24.69■■□□□ 1.54
TRPS1-206ENST00000517323 ARAP1Q96P48 1450 aa24.69■■□□□ 1.54
TRPS1-206ENST00000517323 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.66■■□□□ 1.54
TRPS1-206ENST00000517323 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.64■■□□□ 1.54
TRPS1-206ENST00000517323 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
TRPS1-206ENST00000517323 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
TRPS1-206ENST00000517323 SAMD9Q5K651 1589 aa24.57■■□□□ 1.52
TRPS1-206ENST00000517323 JPH4Q96JJ6 628 aa24.56■■□□□ 1.52
TRPS1-206ENST00000517323 DISP1Q96F81 1524 aa24.53■■□□□ 1.52
TRPS1-206ENST00000517323 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.53■■□□□ 1.52
TRPS1-206ENST00000517323 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.51■■□□□ 1.51
TRPS1-206ENST00000517323 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.51■■□□□ 1.51
TRPS1-206ENST00000517323 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.49■■□□□ 1.51
TRPS1-206ENST00000517323 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.49■■□□□ 1.51
TRPS1-206ENST00000517323 KIAA0556O60303 1618 aa24.48■■□□□ 1.51
TRPS1-206ENST00000517323 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TRPS1-206ENST00000517323 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
TRPS1-206ENST00000517323 OSCARQ8IYS5 282 aa24.43■■□□□ 1.5
TRPS1-206ENST00000517323 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TRPS1-206ENST00000517323 SHROOM2Q13796 1616 aa24.41■■□□□ 1.5
TRPS1-206ENST00000517323 ARID3CA6NKF2 412 aa24.39■■□□□ 1.5
TRPS1-206ENST00000517323 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.34■■□□□ 1.49
TRPS1-206ENST00000517323 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.32■■□□□ 1.48
TRPS1-206ENST00000517323 FMN1Q68DA7 1419 aa24.31■■□□□ 1.48
TRPS1-206ENST00000517323 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.29■■□□□ 1.48
TRPS1-206ENST00000517323 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TRPS1-206ENST00000517323 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.26■■□□□ 1.47
TRPS1-206ENST00000517323 APLP2Q06481 763 aa24.24■■□□□ 1.47
TRPS1-206ENST00000517323 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.23■■□□□ 1.47
TRPS1-206ENST00000517323 PTPRGP23470 1445 aa24.22■■□□□ 1.47
TRPS1-206ENST00000517323 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.2■■□□□ 1.46
TRPS1-206ENST00000517323 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TRPS1-206ENST00000517323 TIAM1Q13009 1591 aa24.17■■□□□ 1.46
TRPS1-206ENST00000517323 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TRPS1-206ENST00000517323 HECW1Q76N89 1606 aa24.15■■□□□ 1.46
TRPS1-206ENST00000517323 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.14■■□□□ 1.45
TRPS1-206ENST00000517323 ABCA8O94911 1581 aa24.13■■□□□ 1.45
TRPS1-206ENST00000517323 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
TRPS1-206ENST00000517323 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TRPS1-206ENST00000517323 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TRPS1-206ENST00000517323 ARHGEF11O15085 1522 aa24.09■■□□□ 1.45
TRPS1-206ENST00000517323 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.08■■□□□ 1.45
TRPS1-206ENST00000517323 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.06■■□□□ 1.44
TRPS1-206ENST00000517323 UACAQ9BZF9 1416 aa24.05■■□□□ 1.44
TRPS1-206ENST00000517323 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.03■■□□□ 1.44
TRPS1-206ENST00000517323 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.03■■□□□ 1.44
TRPS1-206ENST00000517323 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.03■■□□□ 1.44
TRPS1-206ENST00000517323 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.02■■□□□ 1.44
TRPS1-206ENST00000517323 MAP3K1Q13233 1512 aa24■■□□□ 1.43
TRPS1-206ENST00000517323 ATP10BO94823 1461 aa24■■□□□ 1.43
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24■■□□□ 1.43
TRPS1-206ENST00000517323 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.99■■□□□ 1.43
TRPS1-206ENST00000517323 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.99■■□□□ 1.43
TRPS1-206ENST00000517323 ABCC2Q92887 1545 aa23.99■■□□□ 1.43
TRPS1-206ENST00000517323 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.97■■□□□ 1.43
TRPS1-206ENST00000517323 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
TRPS1-206ENST00000517323 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
TRPS1-206ENST00000517323 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.91■■□□□ 1.42
TRPS1-206ENST00000517323 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.88■■□□□ 1.41
TRPS1-206ENST00000517323 KIF14Q15058 1648 aa23.88■■□□□ 1.41
TRPS1-206ENST00000517323 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.86■■□□□ 1.41
TRPS1-206ENST00000517323 NCOA2Q15596 1464 aa23.86■■□□□ 1.41
TRPS1-206ENST00000517323 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
TRPS1-206ENST00000517323 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.83■■□□□ 1.41
TRPS1-206ENST00000517323 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.82■■□□□ 1.4
TRPS1-206ENST00000517323 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
TRPS1-206ENST00000517323 KCNH8Q96L42 1107 aa23.81■■□□□ 1.4
TRPS1-206ENST00000517323 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
TRPS1-206ENST00000517323 ITGAEP38570 1179 aa23.74■■□□□ 1.39
TRPS1-206ENST00000517323 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
TRPS1-206ENST00000517323 ASXL2Q76L83 1435 aa23.7■■□□□ 1.38
TRPS1-206ENST00000517323 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.69■■□□□ 1.38
TRPS1-206ENST00000517323 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.69■■□□□ 1.38
TRPS1-206ENST00000517323 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
TRPS1-206ENST00000517323 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.69■■□□□ 1.38
TRPS1-206ENST00000517323 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
TRPS1-206ENST00000517323 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.68■■□□□ 1.38
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
TRPS1-206ENST00000517323 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.66■■□□□ 1.38
TRPS1-206ENST00000517323 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.66■■□□□ 1.38
TRPS1-206ENST00000517323 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.65■■□□□ 1.38
TRPS1-206ENST00000517323 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
TRPS1-206ENST00000517323 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TRPS1-206ENST00000517323 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.61■■□□□ 1.37
TRPS1-206ENST00000517323 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.58■■□□□ 1.37
TRPS1-206ENST00000517323 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.57■■□□□ 1.36
TRPS1-206ENST00000517323 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TRPS1-206ENST00000517323 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.55■■□□□ 1.36
TRPS1-206ENST00000517323 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.53■■□□□ 1.36
TRPS1-206ENST00000517323 PREX2Q70Z35 1606 aa23.52■■□□□ 1.36
TRPS1-206ENST00000517323 PTPRKQ15262 1439 aa23.5■■□□□ 1.35
TRPS1-206ENST00000517323 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.5■■□□□ 1.35
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