RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513085.1

PCSK1-204, Transcript of proprotein convertase subtilisin/kexin type 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PCSK1, Length 1,481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1-204ENST00000513085 CLIP1P30622 1438 aa21.76■■□□□ 1.07
PCSK1-204ENST00000513085 FBLN2P98095 1184 aa21.7■■□□□ 1.06
PCSK1-204ENST00000513085 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.67■■□□□ 1.06
PCSK1-204ENST00000513085 IQGAP2Q13576 1575 aa21.66■■□□□ 1.06
PCSK1-204ENST00000513085 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.64■■□□□ 1.06
PCSK1-204ENST00000513085 NUP160Q12769 1436 aa21.64■■□□□ 1.05
PCSK1-204ENST00000513085 CHD1O14646 1710 aa21.63■■□□□ 1.05
PCSK1-204ENST00000513085 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PCSK1-204ENST00000513085 CEP170Q5SW79 1584 aa21.59■■□□□ 1.05
PCSK1-204ENST00000513085 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.59■■□□□ 1.05
PCSK1-204ENST00000513085 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.56■■□□□ 1.04
PCSK1-204ENST00000513085 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.55■■□□□ 1.04
PCSK1-204ENST00000513085 SAMD9Q5K651 1589 aa21.54■■□□□ 1.04
PCSK1-204ENST00000513085 ARAP1Q96P48 1450 aa21.52■■□□□ 1.04
PCSK1-204ENST00000513085 JPH4Q96JJ6 628 aa21.46■■□□□ 1.03
PCSK1-204ENST00000513085 FMN1Q68DA7 1419 aa21.46■■□□□ 1.03
PCSK1-204ENST00000513085 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.45■■□□□ 1.03
PCSK1-204ENST00000513085 APLP2Q06481 763 aa21.43■■□□□ 1.02
PCSK1-204ENST00000513085 P3H3Q8IVL6 736 aa21.42■■□□□ 1.02
PCSK1-204ENST00000513085 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.42■■□□□ 1.02
PCSK1-204ENST00000513085 KIAA0556O60303 1618 aa21.41■■□□□ 1.02
PCSK1-204ENST00000513085 DISP1Q96F81 1524 aa21.4■■□□□ 1.02
PCSK1-204ENST00000513085 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.39■■□□□ 1.02
PCSK1-204ENST00000513085 SHROOM2Q13796 1616 aa21.39■■□□□ 1.01
PCSK1-204ENST00000513085 OSCARQ8IYS5 282 aa21.38■■□□□ 1.01
PCSK1-204ENST00000513085 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.34■■□□□ 1.01
PCSK1-204ENST00000513085 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.33■■□□□ 1.01
PCSK1-204ENST00000513085 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
PCSK1-204ENST00000513085 MAP3K1Q13233 1512 aa21.3■■□□□ 1
PCSK1-204ENST00000513085 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
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PCSK1-204ENST00000513085 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.19■□□□□ 0.98
PCSK1-204ENST00000513085 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.19■□□□□ 0.98
PCSK1-204ENST00000513085 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
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PCSK1-204ENST00000513085 ABCA8O94911 1581 aa21.13■□□□□ 0.97
PCSK1-204ENST00000513085 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PCSK1-204ENST00000513085 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.1■□□□□ 0.97
PCSK1-204ENST00000513085 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.1■□□□□ 0.97
PCSK1-204ENST00000513085 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PCSK1-204ENST00000513085 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.09■□□□□ 0.97
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PCSK1-204ENST00000513085 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.09■□□□□ 0.97
PCSK1-204ENST00000513085 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.09■□□□□ 0.97
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PCSK1-204ENST00000513085 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.91■□□□□ 0.94
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PCSK1-204ENST00000513085 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
PCSK1-204ENST00000513085 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
PCSK1-204ENST00000513085 ASXL2Q76L83 1435 aa20.67■□□□□ 0.9
PCSK1-204ENST00000513085 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
PCSK1-204ENST00000513085 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.65■□□□□ 0.9
PCSK1-204ENST00000513085 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
PCSK1-204ENST00000513085 KCNH8Q96L42 1107 aa20.64■□□□□ 0.89
PCSK1-204ENST00000513085 MAPKBP1O60336 1514 aa20.63■□□□□ 0.89
PCSK1-204ENST00000513085 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.62■□□□□ 0.89
PCSK1-204ENST00000513085 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PCSK1-204ENST00000513085 PREX2Q70Z35 1606 aa20.61■□□□□ 0.89
PCSK1-204ENST00000513085 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.59■□□□□ 0.89
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