RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512821.5

CD164-210, Transcript of CD164 molecule, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CD164, Length 964 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164-210ENST00000512821 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.56■■□□□ 1.36
CD164-210ENST00000512821 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.54■■□□□ 1.36
CD164-210ENST00000512821 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.52■■□□□ 1.36
CD164-210ENST00000512821 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.5■■□□□ 1.35
CD164-210ENST00000512821 SHROOM2Q13796 1616 aa23.48■■□□□ 1.35
CD164-210ENST00000512821 GOLGA3Q08378 1498 aa23.47■■□□□ 1.35
CD164-210ENST00000512821 IQGAP2Q13576 1575 aa23.45■■□□□ 1.34
CD164-210ENST00000512821 JPH4Q96JJ6 628 aa23.45■■□□□ 1.34
CD164-210ENST00000512821 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.44■■□□□ 1.34
CD164-210ENST00000512821 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.44■■□□□ 1.34
CD164-210ENST00000512821 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.44■■□□□ 1.34
CD164-210ENST00000512821 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CD164-210ENST00000512821 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CD164-210ENST00000512821 ARHGEF11O15085 1522 aa23.42■■□□□ 1.34
CD164-210ENST00000512821 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CD164-210ENST00000512821 DISP1Q96F81 1524 aa23.35■■□□□ 1.33
CD164-210ENST00000512821 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.33■■□□□ 1.33
CD164-210ENST00000512821 P3H3Q8IVL6 736 aa23.32■■□□□ 1.32
CD164-210ENST00000512821 ARAP1Q96P48 1450 aa23.31■■□□□ 1.32
CD164-210ENST00000512821 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CD164-210ENST00000512821 KIAA0556O60303 1618 aa23.26■■□□□ 1.31
CD164-210ENST00000512821 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.25■■□□□ 1.31
CD164-210ENST00000512821 SAMD9Q5K651 1589 aa23.23■■□□□ 1.31
CD164-210ENST00000512821 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.22■■□□□ 1.31
CD164-210ENST00000512821 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.18■■□□□ 1.3
CD164-210ENST00000512821 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.18■■□□□ 1.3
CD164-210ENST00000512821 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.15■■□□□ 1.3
CD164-210ENST00000512821 CEP162Q5TB80 1403 aa23.12■■□□□ 1.29
CD164-210ENST00000512821 PTPRGP23470 1445 aa23.11■■□□□ 1.29
CD164-210ENST00000512821 CLIP1P30622 1438 aa23.1■■□□□ 1.29
CD164-210ENST00000512821 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.07■■□□□ 1.28
CD164-210ENST00000512821 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.06■■□□□ 1.28
CD164-210ENST00000512821 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.06■■□□□ 1.28
CD164-210ENST00000512821 ARID3CA6NKF2 412 aa23.01■■□□□ 1.27
CD164-210ENST00000512821 ABCA8O94911 1581 aa23■■□□□ 1.27
CD164-210ENST00000512821 UACAQ9BZF9 1416 aa22.96■■□□□ 1.27
CD164-210ENST00000512821 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.94■■□□□ 1.26
CD164-210ENST00000512821 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.93■■□□□ 1.26
CD164-210ENST00000512821 ABCC2Q92887 1545 aa22.92■■□□□ 1.26
CD164-210ENST00000512821 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CD164-210ENST00000512821 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CD164-210ENST00000512821 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.88■■□□□ 1.25
CD164-210ENST00000512821 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CD164-210ENST00000512821 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CD164-210ENST00000512821 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CD164-210ENST00000512821 ATP10BO94823 1461 aa22.84■■□□□ 1.25
CD164-210ENST00000512821 FMN1Q68DA7 1419 aa22.82■■□□□ 1.24
CD164-210ENST00000512821 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.82■■□□□ 1.24
CD164-210ENST00000512821 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.79■■□□□ 1.24
CD164-210ENST00000512821 HECW1Q76N89 1606 aa22.75■■□□□ 1.23
CD164-210ENST00000512821 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.75■■□□□ 1.23
CD164-210ENST00000512821 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CD164-210ENST00000512821 ASXL2Q76L83 1435 aa22.72■■□□□ 1.23
CD164-210ENST00000512821 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.72■■□□□ 1.23
CD164-210ENST00000512821 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
CD164-210ENST00000512821 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.7■■□□□ 1.22
CD164-210ENST00000512821 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CD164-210ENST00000512821 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CD164-210ENST00000512821 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.68■■□□□ 1.22
CD164-210ENST00000512821 MAPKBP1O60336 1514 aa22.67■■□□□ 1.22
CD164-210ENST00000512821 KCNH8Q96L42 1107 aa22.64■■□□□ 1.21
CD164-210ENST00000512821 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.61■■□□□ 1.21
CD164-210ENST00000512821 DIP2BQ9P265 1576 aa22.6■■□□□ 1.21
CD164-210ENST00000512821 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.59■■□□□ 1.21
CD164-210ENST00000512821 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CD164-210ENST00000512821 KIF14Q15058 1648 aa22.59■■□□□ 1.21
CD164-210ENST00000512821 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CD164-210ENST00000512821 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.57■■□□□ 1.2
CD164-210ENST00000512821 TIAM1Q13009 1591 aa22.57■■□□□ 1.2
CD164-210ENST00000512821 TSPOAP1O95153 1857 aa22.57■■□□□ 1.2
CD164-210ENST00000512821 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CD164-210ENST00000512821 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.55■■□□□ 1.2
CD164-210ENST00000512821 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.55■■□□□ 1.2
CD164-210ENST00000512821 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.54■■□□□ 1.2
CD164-210ENST00000512821 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.5■■□□□ 1.19
CD164-210ENST00000512821 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CD164-210ENST00000512821 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CD164-210ENST00000512821 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.192e-6■■□□□ 12.7
CD164-210ENST00000512821 GLI2P10070 1586 aa22.46■■□□□ 1.19
CD164-210ENST00000512821 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.46■■□□□ 1.19
CD164-210ENST00000512821 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.46■■□□□ 1.19
CD164-210ENST00000512821 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.45■■□□□ 1.18
CD164-210ENST00000512821 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.43■■□□□ 1.18
CD164-210ENST00000512821 MAP3K1Q13233 1512 aa22.42■■□□□ 1.18
CD164-210ENST00000512821 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CD164-210ENST00000512821 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.4■■□□□ 1.18
CD164-210ENST00000512821 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.38■■□□□ 1.17
CD164-210ENST00000512821 CD109Q6YHK3 1445 aa22.37■■□□□ 1.17
CD164-210ENST00000512821 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.37■■□□□ 1.17
CD164-210ENST00000512821 NCOA2Q15596 1464 aa22.35■■□□□ 1.17
CD164-210ENST00000512821 APLP2Q06481 763 aa22.34■■□□□ 1.17
CD164-210ENST00000512821 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CD164-210ENST00000512821 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.34■■□□□ 1.17
CD164-210ENST00000512821 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CD164-210ENST00000512821 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.29■■□□□ 1.16
CD164-210ENST00000512821 PREX2Q70Z35 1606 aa22.28■■□□□ 1.16
CD164-210ENST00000512821 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CD164-210ENST00000512821 PLCH2O75038 1416 aa22.27■■□□□ 1.16
CD164-210ENST00000512821 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CD164-210ENST00000512821 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms