RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512731.5

MMP23B-210, Transcript of matrix metallopeptidase 23B, humanhuman

TSL 2

Gene MMP23B, Length 1,531 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP23B-210ENST00000512731 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.56■■■■■ 4.4
MMP23B-210ENST00000512731 SHROOM2Q13796 1616 aa42.53■■■■■ 4.4
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MMP23B-210ENST00000512731 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.45■■■■■ 4.39
MMP23B-210ENST00000512731 JPH4Q96JJ6 628 aa42.35■■■■■ 4.37
MMP23B-210ENST00000512731 IQGAP2Q13576 1575 aa42.33■■■■■ 4.37
MMP23B-210ENST00000512731 ARAP1Q96P48 1450 aa42.32■■■■■ 4.37
MMP23B-210ENST00000512731 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.31■■■■■ 4.36
MMP23B-210ENST00000512731 KIF21BO75037 1637 aa42.3■■■■■ 4.36
MMP23B-210ENST00000512731 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.28■■■■■ 4.36
MMP23B-210ENST00000512731 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
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MMP23B-210ENST00000512731 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.12■■■■■ 4.33
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MMP23B-210ENST00000512731 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.02■■■■■ 4.32
MMP23B-210ENST00000512731 DISP1Q96F81 1524 aa42.01■■■■■ 4.32
MMP23B-210ENST00000512731 KIAA0556O60303 1618 aa41.94■■■■■ 4.31
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MMP23B-210ENST00000512731 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.64■■■■■ 4.26
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MMP23B-210ENST00000512731 P3H3Q8IVL6 736 aa41.54■■■■■ 4.24
MMP23B-210ENST00000512731 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.53■■■■■ 4.24
MMP23B-210ENST00000512731 ABCC2Q92887 1545 aa41.51■■■■■ 4.24
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MMP23B-210ENST00000512731 ABCA8O94911 1581 aa41.45■■■■■ 4.23
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MMP23B-210ENST00000512731 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.34■■■■■ 4.21
MMP23B-210ENST00000512731 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.29■■■■■ 4.2
MMP23B-210ENST00000512731 CLIP1P30622 1438 aa41.28■■■■■ 4.2
MMP23B-210ENST00000512731 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.28■■■■■ 4.2
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MMP23B-210ENST00000512731 DIP2BQ9P265 1576 aa41.06■■■■■ 4.16
MMP23B-210ENST00000512731 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.03■■■■■ 4.16
MMP23B-210ENST00000512731 HECW1Q76N89 1606 aa41.01■■■■■ 4.16
MMP23B-210ENST00000512731 ARID3CA6NKF2 412 aa41■■■■■ 4.15
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MMP23B-210ENST00000512731 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.19■■■■■ 4.02
MMP23B-210ENST00000512731 FANCAO15360 1455 aa40.18■■■■■ 4.02
MMP23B-210ENST00000512731 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.17■■■■■ 4.02
MMP23B-210ENST00000512731 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.17■■■■■ 4.02
MMP23B-210ENST00000512731 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
MMP23B-210ENST00000512731 PREX2Q70Z35 1606 aa40.14■■■■■ 4.02
MMP23B-210ENST00000512731 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.1■■■■■ 4.01
MMP23B-210ENST00000512731 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
MMP23B-210ENST00000512731 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.09■■■■■ 4.01
MMP23B-210ENST00000512731 APLP2Q06481 763 aa40.08■■■■■ 4.01
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