RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507538.1

RASGEF1B-205, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 691 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-205ENST00000507538 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.05■■■□□ 2.4
RASGEF1B-205ENST00000507538 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.04■■■□□ 2.4
RASGEF1B-205ENST00000507538 SHROOM2Q13796 1616 aa30.01■■■□□ 2.39
RASGEF1B-205ENST00000507538 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
RASGEF1B-205ENST00000507538 ARAP1Q96P48 1450 aa29.98■■■□□ 2.39
RASGEF1B-205ENST00000507538 JPH4Q96JJ6 628 aa29.96■■■□□ 2.39
RASGEF1B-205ENST00000507538 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.92■■■□□ 2.38
RASGEF1B-205ENST00000507538 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
RASGEF1B-205ENST00000507538 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.89■■■□□ 2.38
RASGEF1B-205ENST00000507538 IQGAP2Q13576 1575 aa29.87■■■□□ 2.37
RASGEF1B-205ENST00000507538 KIF21BO75037 1637 aa29.78■■■□□ 2.36
RASGEF1B-205ENST00000507538 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.74■■■□□ 2.35
RASGEF1B-205ENST00000507538 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.74■■■□□ 2.35
RASGEF1B-205ENST00000507538 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.71■■■□□ 2.35
RASGEF1B-205ENST00000507538 DISP1Q96F81 1524 aa29.67■■■□□ 2.34
RASGEF1B-205ENST00000507538 GOLGA3Q08378 1498 aa29.63■■■□□ 2.33
RASGEF1B-205ENST00000507538 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.61■■■□□ 2.33
RASGEF1B-205ENST00000507538 KIAA0556O60303 1618 aa29.59■■■□□ 2.33
RASGEF1B-205ENST00000507538 PTPRGP23470 1445 aa29.57■■■□□ 2.32
RASGEF1B-205ENST00000507538 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.57■■■□□ 2.32
RASGEF1B-205ENST00000507538 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
RASGEF1B-205ENST00000507538 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.32
RASGEF1B-205ENST00000507538 SAMD9Q5K651 1589 aa29.44■■■□□ 2.3
RASGEF1B-205ENST00000507538 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
RASGEF1B-205ENST00000507538 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.42■■■□□ 2.3
RASGEF1B-205ENST00000507538 UACAQ9BZF9 1416 aa29.38■■■□□ 2.29
RASGEF1B-205ENST00000507538 P3H3Q8IVL6 736 aa29.38■■■□□ 2.29
RASGEF1B-205ENST00000507538 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.36■■■□□ 2.29
RASGEF1B-205ENST00000507538 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.35■■■□□ 2.29
RASGEF1B-205ENST00000507538 ABCC2Q92887 1545 aa29.33■■■□□ 2.29
RASGEF1B-205ENST00000507538 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.31■■■□□ 2.28
RASGEF1B-205ENST00000507538 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.3■■■□□ 2.28
RASGEF1B-205ENST00000507538 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.3■■■□□ 2.28
RASGEF1B-205ENST00000507538 ABCA8O94911 1581 aa29.26■■■□□ 2.28
RASGEF1B-205ENST00000507538 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.23■■■□□ 2.27
RASGEF1B-205ENST00000507538 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
RASGEF1B-205ENST00000507538 MAPKBP1O60336 1514 aa29.22■■■□□ 2.27
RASGEF1B-205ENST00000507538 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.2■■■□□ 2.27
RASGEF1B-205ENST00000507538 CLIP1P30622 1438 aa29.11■■■□□ 2.25
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
RASGEF1B-205ENST00000507538 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.11■■■□□ 2.25
RASGEF1B-205ENST00000507538 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.1■■■□□ 2.25
RASGEF1B-205ENST00000507538 ASXL2Q76L83 1435 aa29.1■■■□□ 2.25
RASGEF1B-205ENST00000507538 FMN1Q68DA7 1419 aa29.08■■■□□ 2.25
RASGEF1B-205ENST00000507538 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.08■■■□□ 2.25
RASGEF1B-205ENST00000507538 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
RASGEF1B-205ENST00000507538 ARID3CA6NKF2 412 aa29.03■■■□□ 2.24
RASGEF1B-205ENST00000507538 ATP10BO94823 1461 aa29.03■■■□□ 2.24
RASGEF1B-205ENST00000507538 CEP162Q5TB80 1403 aa29.02■■■□□ 2.24
RASGEF1B-205ENST00000507538 DIP2BQ9P265 1576 aa29.01■■■□□ 2.24
RASGEF1B-205ENST00000507538 FAM69CQ0P6D2 419 aa29■■■□□ 2.23
RASGEF1B-205ENST00000507538 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.98■■■□□ 2.23
RASGEF1B-205ENST00000507538 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.94■■■□□ 2.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 HECW1Q76N89 1606 aa28.91■■■□□ 2.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 GLI2P10070 1586 aa28.89■■■□□ 2.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.88■■■□□ 2.21
RASGEF1B-205ENST00000507538 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
RASGEF1B-205ENST00000507538 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
RASGEF1B-205ENST00000507538 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
RASGEF1B-205ENST00000507538 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.81■■■□□ 2.2
RASGEF1B-205ENST00000507538 KCNH8Q96L42 1107 aa28.81■■■□□ 2.2
RASGEF1B-205ENST00000507538 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.77■■■□□ 2.2
RASGEF1B-205ENST00000507538 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.74■■■□□ 2.19
RASGEF1B-205ENST00000507538 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.73■■■□□ 2.19
RASGEF1B-205ENST00000507538 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
RASGEF1B-205ENST00000507538 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.69■■■□□ 2.18
RASGEF1B-205ENST00000507538 CD109Q6YHK3 1445 aa28.68■■■□□ 2.18
RASGEF1B-205ENST00000507538 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.66■■■□□ 2.18
RASGEF1B-205ENST00000507538 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.66■■■□□ 2.18
RASGEF1B-205ENST00000507538 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.65■■■□□ 2.18
RASGEF1B-205ENST00000507538 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
RASGEF1B-205ENST00000507538 TSPOAP1O95153 1857 aa28.65■■■□□ 2.18
RASGEF1B-205ENST00000507538 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
RASGEF1B-205ENST00000507538 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.63■■■□□ 2.17
RASGEF1B-205ENST00000507538 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.63■■■□□ 2.17
RASGEF1B-205ENST00000507538 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.58■■■□□ 2.17
RASGEF1B-205ENST00000507538 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.54■■■□□ 2.16
RASGEF1B-205ENST00000507538 KIF14Q15058 1648 aa28.54■■■□□ 2.16
RASGEF1B-205ENST00000507538 KDM6BO15054 1643 aa28.5■■■□□ 2.15
RASGEF1B-205ENST00000507538 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.46■■■□□ 2.15
RASGEF1B-205ENST00000507538 NEO1Q92859 1461 aa28.44■■■□□ 2.14
RASGEF1B-205ENST00000507538 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
RASGEF1B-205ENST00000507538 PLCH2O75038 1416 aa28.43■■■□□ 2.14
RASGEF1B-205ENST00000507538 TIAM1Q13009 1591 aa28.42■■■□□ 2.14
RASGEF1B-205ENST00000507538 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.42■■■□□ 2.14
RASGEF1B-205ENST00000507538 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.41■■■□□ 2.14
RASGEF1B-205ENST00000507538 FANCAO15360 1455 aa28.4■■■□□ 2.14
RASGEF1B-205ENST00000507538 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.38■■■□□ 2.13
RASGEF1B-205ENST00000507538 MAP3K1Q13233 1512 aa28.38■■■□□ 2.13
RASGEF1B-205ENST00000507538 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.35■■■□□ 2.13
RASGEF1B-205ENST00000507538 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.35■■■□□ 2.13
RASGEF1B-205ENST00000507538 AKNAQ7Z591 1439 aa28.34■■■□□ 2.13
RASGEF1B-205ENST00000507538 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.32■■■□□ 2.12
RASGEF1B-205ENST00000507538 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.31■■■□□ 2.12
RASGEF1B-205ENST00000507538 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.31■■■□□ 2.12
RASGEF1B-205ENST00000507538 APLP2Q06481 763 aa28.29■■■□□ 2.12
RASGEF1B-205ENST00000507538 PREX2Q70Z35 1606 aa28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms