RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-208ENST00000504294 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-208ENST00000504294 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2-208ENST00000504294 SHROOM2Q13796 1616 aa23.95■■□□□ 1.43
SH3BP2-208ENST00000504294 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-208ENST00000504294 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP2-208ENST00000504294 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2-208ENST00000504294 IQGAP2Q13576 1575 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2-208ENST00000504294 KIF21BO75037 1637 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP2-208ENST00000504294 ARAP1Q96P48 1450 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP2-208ENST00000504294 GOLGA3Q08378 1498 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2-208ENST00000504294 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2-208ENST00000504294 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2-208ENST00000504294 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-208ENST00000504294 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-208ENST00000504294 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-208ENST00000504294 PTPRGP23470 1445 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-208ENST00000504294 DISP1Q96F81 1524 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-208ENST00000504294 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-208ENST00000504294 KIAA0556O60303 1618 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-208ENST00000504294 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-208ENST00000504294 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-208ENST00000504294 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-208ENST00000504294 UACAQ9BZF9 1416 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-208ENST00000504294 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-208ENST00000504294 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-208ENST00000504294 SAMD9Q5K651 1589 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-208ENST00000504294 P3H3Q8IVL6 736 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCC2Q92887 1545 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-208ENST00000504294 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-208ENST00000504294 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-208ENST00000504294 FMN1Q68DA7 1419 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-208ENST00000504294 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCA8O94911 1581 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-208ENST00000504294 MAPKBP1O60336 1514 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-208ENST00000504294 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-208ENST00000504294 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-208ENST00000504294 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-208ENST00000504294 CLIP1P30622 1438 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-208ENST00000504294 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-208ENST00000504294 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-208ENST00000504294 ASXL2Q76L83 1435 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-208ENST00000504294 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-208ENST00000504294 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CEP162Q5TB80 1403 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP10BO94823 1461 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-208ENST00000504294 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-208ENST00000504294 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-208ENST00000504294 HECW1Q76N89 1606 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-208ENST00000504294 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2-208ENST00000504294 ARID3CA6NKF2 412 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-208ENST00000504294 GLI2P10070 1586 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-208ENST00000504294 DIP2BQ9P265 1576 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-208ENST00000504294 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-208ENST00000504294 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNH8Q96L42 1107 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-208ENST00000504294 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2-208ENST00000504294 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-208ENST00000504294 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-208ENST00000504294 CD109Q6YHK3 1445 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-208ENST00000504294 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-208ENST00000504294 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-208ENST00000504294 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-208ENST00000504294 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-208ENST00000504294 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-208ENST00000504294 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-208ENST00000504294 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-208ENST00000504294 APLP2Q06481 763 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-208ENST00000504294 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-208ENST00000504294 KIF14Q15058 1648 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-208ENST00000504294 TSPOAP1O95153 1857 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-208ENST00000504294 MAP3K1Q13233 1512 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-208ENST00000504294 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-208ENST00000504294 NEO1Q92859 1461 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-208ENST00000504294 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-208ENST00000504294 PLCH2O75038 1416 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-208ENST00000504294 KDM6BO15054 1643 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-208ENST00000504294 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-208ENST00000504294 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-208ENST00000504294 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-208ENST00000504294 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-208ENST00000504294 TIAM1Q13009 1591 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-208ENST00000504294 FANCAO15360 1455 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-208ENST00000504294 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-208ENST00000504294 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-208ENST00000504294 AKNAQ7Z591 1439 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-208ENST00000504294 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-208ENST00000504294 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-208ENST00000504294 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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