RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498841.5

PFKL-211, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PFKL, Length 3,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-211ENST00000498841 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.59■■□□□ 1.53
PFKL-211ENST00000498841 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PFKL-211ENST00000498841 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.54■■□□□ 1.52
PFKL-211ENST00000498841 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PFKL-211ENST00000498841 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.46■■□□□ 1.51
PFKL-211ENST00000498841 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.42■■□□□ 1.5
PFKL-211ENST00000498841 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.41■■□□□ 1.5
PFKL-211ENST00000498841 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.38■■□□□ 1.49
PFKL-211ENST00000498841 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.37■■□□□ 1.49
PFKL-211ENST00000498841 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PFKL-211ENST00000498841 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.36■■□□□ 1.49
PFKL-211ENST00000498841 MIER1Q8N108 512 aa24.35■■□□□ 1.49
PFKL-211ENST00000498841 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.35■■□□□ 1.49
PFKL-211ENST00000498841 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.492e-7■■■■□ 22.9
PFKL-211ENST00000498841 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PFKL-211ENST00000498841 TIAM1Q13009 1591 aa24.31■■□□□ 1.48
PFKL-211ENST00000498841 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PFKL-211ENST00000498841 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.28■■□□□ 1.48
PFKL-211ENST00000498841 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.27■■□□□ 1.48
PFKL-211ENST00000498841 FBLN2P98095 1184 aa24.27■■□□□ 1.48
PFKL-211ENST00000498841 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.27■■□□□ 1.48
PFKL-211ENST00000498841 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.24■■□□□ 1.47
PFKL-211ENST00000498841 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.22■■□□□ 1.47
PFKL-211ENST00000498841 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.16■■□□□ 1.46
PFKL-211ENST00000498841 CUL7Q14999 1698 aa24.15■■□□□ 1.46
PFKL-211ENST00000498841 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
PFKL-211ENST00000498841 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
PFKL-211ENST00000498841 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.12■■□□□ 1.45
PFKL-211ENST00000498841 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.1■■□□□ 1.45
PFKL-211ENST00000498841 WDR97A6NE52 1622 aa24.09■■□□□ 1.45
PFKL-211ENST00000498841 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.08■■□□□ 1.45
PFKL-211ENST00000498841 ERCC6Q03468 1493 aa24.08■■□□□ 1.44
PFKL-211ENST00000498841 FMN1Q68DA7 1419 aa24.07■■□□□ 1.44
PFKL-211ENST00000498841 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.07■■□□□ 1.44
PFKL-211ENST00000498841 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.05■■□□□ 1.44
PFKL-211ENST00000498841 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.04■■□□□ 1.44
PFKL-211ENST00000498841 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PFKL-211ENST00000498841 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.02■■□□□ 1.44
PFKL-211ENST00000498841 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.02■■□□□ 1.44
PFKL-211ENST00000498841 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.99■■□□□ 1.43
PFKL-211ENST00000498841 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.98■■□□□ 1.43
PFKL-211ENST00000498841 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.43
PFKL-211ENST00000498841 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.95■■□□□ 1.42
PFKL-211ENST00000498841 MAP3K1Q13233 1512 aa23.95■■□□□ 1.42
PFKL-211ENST00000498841 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.94■■□□□ 1.42
PFKL-211ENST00000498841 TRIM52Q96A61 297 aa23.92■■□□□ 1.42
PFKL-211ENST00000498841 PBRM1Q86U86 1689 aa23.92■■□□□ 1.42
PFKL-211ENST00000498841 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PFKL-211ENST00000498841 NCOA2Q15596 1464 aa23.91■■□□□ 1.42
PFKL-211ENST00000498841 MAPKBP1O60336 1514 aa23.91■■□□□ 1.42
PFKL-211ENST00000498841 PTPRKQ15262 1439 aa23.9■■□□□ 1.42
PFKL-211ENST00000498841 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.89■■□□□ 1.42
PFKL-211ENST00000498841 GRIN2BQ13224 1484 aa23.89■■□□□ 1.42
PFKL-211ENST00000498841 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
PFKL-211ENST00000498841 SAMD9Q5K651 1589 aa23.85■■□□□ 1.41
PFKL-211ENST00000498841 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PFKL-211ENST00000498841 IQGAP2Q13576 1575 aa23.84■■□□□ 1.41
PFKL-211ENST00000498841 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PFKL-211ENST00000498841 FOXD1Q16676 465 aa23.84■■□□□ 1.41
PFKL-211ENST00000498841 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.83■■□□□ 1.41
PFKL-211ENST00000498841 ADAMTS12P58397 1594 aa23.82■■□□□ 1.4
PFKL-211ENST00000498841 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
PFKL-211ENST00000498841 KCNH8Q96L42 1107 aa23.81■■□□□ 1.4
PFKL-211ENST00000498841 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.8■■□□□ 1.4
PFKL-211ENST00000498841 IFT140Q96RY7 1462 aa23.78■■□□□ 1.4
PFKL-211ENST00000498841 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.77■■□□□ 1.4
PFKL-211ENST00000498841 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PFKL-211ENST00000498841 TONSLQ96HA7 1378 aa23.72■■□□□ 1.39
PFKL-211ENST00000498841 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PFKL-211ENST00000498841 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PFKL-211ENST00000498841 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PFKL-211ENST00000498841 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.7■■□□□ 1.38
PFKL-211ENST00000498841 WDR62O43379 1518 aa23.68■■□□□ 1.38
PFKL-211ENST00000498841 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.68■■□□□ 1.38
PFKL-211ENST00000498841 GRIN2AQ12879 1464 aa23.68■■□□□ 1.38
PFKL-211ENST00000498841 NAIPQ13075 1403 aa23.66■■□□□ 1.38
PFKL-211ENST00000498841 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.66■■□□□ 1.38
PFKL-211ENST00000498841 JPH4Q96JJ6 628 aa23.65■■□□□ 1.38
PFKL-211ENST00000498841 HECW1Q76N89 1606 aa23.64■■□□□ 1.38
PFKL-211ENST00000498841 BCL11AQ9H165 835 aa23.64■■□□□ 1.38
PFKL-211ENST00000498841 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
PFKL-211ENST00000498841 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.63■■□□□ 1.37
PFKL-211ENST00000498841 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.62■■□□□ 1.37
PFKL-211ENST00000498841 DISP1Q96F81 1524 aa23.61■■□□□ 1.37
PFKL-211ENST00000498841 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PFKL-211ENST00000498841 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.61■■□□□ 1.37
PFKL-211ENST00000498841 HFM1A2PYH4 1435 aa23.61■■□□□ 1.37
PFKL-211ENST00000498841 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.59■■□□□ 1.37
PFKL-211ENST00000498841 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PFKL-211ENST00000498841 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PFKL-211ENST00000498841 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PFKL-211ENST00000498841 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PFKL-211ENST00000498841 KIAA0556O60303 1618 aa23.55■■□□□ 1.36
PFKL-211ENST00000498841 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.364e-7■■■■■ 46.2
PFKL-211ENST00000498841 BCANQ96GW7 911 aa23.55■■□□□ 1.36
PFKL-211ENST00000498841 UACAQ9BZF9 1416 aa23.55■■□□□ 1.36
PFKL-211ENST00000498841 KDM6BO15054 1643 aa23.54■■□□□ 1.36
PFKL-211ENST00000498841 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PFKL-211ENST00000498841 CEP170Q5SW79 1584 aa23.52■■□□□ 1.36
PFKL-211ENST00000498841 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms