RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498183.5

GRAMD1C-215, Transcript of GRAM domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene GRAMD1C, Length 735 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1C-215ENST00000498183 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.25■■■■□ 3.39
GRAMD1C-215ENST00000498183 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
GRAMD1C-215ENST00000498183 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.23■■■■□ 3.39
GRAMD1C-215ENST00000498183 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.21■■■■□ 3.39
GRAMD1C-215ENST00000498183 IQGAP2Q13576 1575 aa36.15■■■■□ 3.38
GRAMD1C-215ENST00000498183 JPH4Q96JJ6 628 aa36.12■■■■□ 3.37
GRAMD1C-215ENST00000498183 SHROOM2Q13796 1616 aa36.07■■■■□ 3.36
GRAMD1C-215ENST00000498183 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
GRAMD1C-215ENST00000498183 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.01■■■■□ 3.35
GRAMD1C-215ENST00000498183 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36■■■■□ 3.35
GRAMD1C-215ENST00000498183 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
GRAMD1C-215ENST00000498183 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.98■■■■□ 3.35
GRAMD1C-215ENST00000498183 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.97■■■■□ 3.35
GRAMD1C-215ENST00000498183 ARHGEF11O15085 1522 aa35.91■■■■□ 3.34
GRAMD1C-215ENST00000498183 DISP1Q96F81 1524 aa35.89■■■■□ 3.34
GRAMD1C-215ENST00000498183 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.86■■■■□ 3.33
GRAMD1C-215ENST00000498183 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.86■■■■□ 3.33
GRAMD1C-215ENST00000498183 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.86■■■■□ 3.33
GRAMD1C-215ENST00000498183 P3H3Q8IVL6 736 aa35.84■■■■□ 3.33
GRAMD1C-215ENST00000498183 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.83■■■■□ 3.33
GRAMD1C-215ENST00000498183 KIAA0556O60303 1618 aa35.81■■■■□ 3.32
GRAMD1C-215ENST00000498183 SAMD9Q5K651 1589 aa35.79■■■■□ 3.32
GRAMD1C-215ENST00000498183 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
GRAMD1C-215ENST00000498183 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.73■■■■□ 3.31
GRAMD1C-215ENST00000498183 CEP162Q5TB80 1403 aa35.73■■■■□ 3.31
GRAMD1C-215ENST00000498183 CLIP1P30622 1438 aa35.72■■■■□ 3.31
GRAMD1C-215ENST00000498183 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.71■■■■□ 3.31
GRAMD1C-215ENST00000498183 ARAP1Q96P48 1450 aa35.69■■■■□ 3.3
GRAMD1C-215ENST00000498183 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.68■■■■□ 3.3
GRAMD1C-215ENST00000498183 PTPRGP23470 1445 aa35.63■■■■□ 3.29
GRAMD1C-215ENST00000498183 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.61■■■■□ 3.29
GRAMD1C-215ENST00000498183 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.44■■■■□ 3.26
GRAMD1C-215ENST00000498183 UACAQ9BZF9 1416 aa35.4■■■■□ 3.26
GRAMD1C-215ENST00000498183 ABCA8O94911 1581 aa35.38■■■■□ 3.25
GRAMD1C-215ENST00000498183 FMN1Q68DA7 1419 aa35.38■■■■□ 3.25
GRAMD1C-215ENST00000498183 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.34■■■■□ 3.25
GRAMD1C-215ENST00000498183 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.32■■■■□ 3.25
GRAMD1C-215ENST00000498183 ABCC2Q92887 1545 aa35.32■■■■□ 3.24
GRAMD1C-215ENST00000498183 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.3■■■■□ 3.24
GRAMD1C-215ENST00000498183 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
GRAMD1C-215ENST00000498183 ARID3CA6NKF2 412 aa35.26■■■■□ 3.24
GRAMD1C-215ENST00000498183 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
GRAMD1C-215ENST00000498183 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.23■■■■□ 3.23
GRAMD1C-215ENST00000498183 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.22■■■■□ 3.23
GRAMD1C-215ENST00000498183 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
GRAMD1C-215ENST00000498183 HECW1Q76N89 1606 aa35.16■■■■□ 3.22
GRAMD1C-215ENST00000498183 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.14■■■■□ 3.22
GRAMD1C-215ENST00000498183 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.14■■■■□ 3.22
GRAMD1C-215ENST00000498183 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.14■■■■□ 3.22
GRAMD1C-215ENST00000498183 ATP10BO94823 1461 aa35.13■■■■□ 3.21
GRAMD1C-215ENST00000498183 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
GRAMD1C-215ENST00000498183 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.1■■■■□ 3.21
GRAMD1C-215ENST00000498183 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
GRAMD1C-215ENST00000498183 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.21
GRAMD1C-215ENST00000498183 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
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GRAMD1C-215ENST00000498183 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.97■■■■□ 3.19
GRAMD1C-215ENST00000498183 ASXL2Q76L83 1435 aa34.94■■■■□ 3.18
GRAMD1C-215ENST00000498183 MAPKBP1O60336 1514 aa34.92■■■■□ 3.18
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GRAMD1C-215ENST00000498183 TIAM1Q13009 1591 aa34.85■■■■□ 3.17
GRAMD1C-215ENST00000498183 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.84■■■■□ 3.17
GRAMD1C-215ENST00000498183 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.84■■■■□ 3.17
GRAMD1C-215ENST00000498183 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.84■■■■□ 3.17
GRAMD1C-215ENST00000498183 APLP2Q06481 763 aa34.82■■■■□ 3.16
GRAMD1C-215ENST00000498183 KCNH8Q96L42 1107 aa34.82■■■■□ 3.16
GRAMD1C-215ENST00000498183 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
GRAMD1C-215ENST00000498183 MAP3K1Q13233 1512 aa34.78■■■■□ 3.16
GRAMD1C-215ENST00000498183 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
GRAMD1C-215ENST00000498183 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
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GRAMD1C-215ENST00000498183 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.71■■■■□ 3.15
GRAMD1C-215ENST00000498183 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.7■■■■□ 3.15
GRAMD1C-215ENST00000498183 DIP2BQ9P265 1576 aa34.69■■■■□ 3.14
GRAMD1C-215ENST00000498183 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.68■■■■□ 3.14
GRAMD1C-215ENST00000498183 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
GRAMD1C-215ENST00000498183 KIF14Q15058 1648 aa34.66■■■■□ 3.14
GRAMD1C-215ENST00000498183 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.65■■■■□ 3.14
GRAMD1C-215ENST00000498183 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
GRAMD1C-215ENST00000498183 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.62■■■■□ 3.13
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GRAMD1C-215ENST00000498183 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.58■■■■□ 3.13
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GRAMD1C-215ENST00000498183 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.54■■■■□ 3.12
GRAMD1C-215ENST00000498183 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
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GRAMD1C-215ENST00000498183 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.48■■■■□ 3.11
GRAMD1C-215ENST00000498183 CD109Q6YHK3 1445 aa34.47■■■■□ 3.11
GRAMD1C-215ENST00000498183 TSPOAP1O95153 1857 aa34.44■■■■□ 3.1
GRAMD1C-215ENST00000498183 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.4■■■■□ 3.1
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GRAMD1C-215ENST00000498183 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.37■■■■□ 3.09
GRAMD1C-215ENST00000498183 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.37■■■■□ 3.09
GRAMD1C-215ENST00000498183 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
GRAMD1C-215ENST00000498183 PLCH2O75038 1416 aa34.37■■■■□ 3.09
GRAMD1C-215ENST00000498183 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.36■■■■□ 3.09
GRAMD1C-215ENST00000498183 PREX2Q70Z35 1606 aa34.32■■■■□ 3.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.32■■■■□ 3.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.29■■■■□ 3.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
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