RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496567.5

C9orf3-222, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 1,575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-222ENST00000496567 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.48■■■■□ 3.27
C9orf3-222ENST00000496567 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
C9orf3-222ENST00000496567 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.44■■■■□ 3.26
C9orf3-222ENST00000496567 IQGAP2Q13576 1575 aa35.38■■■■□ 3.25
C9orf3-222ENST00000496567 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.31■■■■□ 3.24
C9orf3-222ENST00000496567 JPH4Q96JJ6 628 aa35.31■■■■□ 3.24
C9orf3-222ENST00000496567 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.27■■■■□ 3.24
C9orf3-222ENST00000496567 SHROOM2Q13796 1616 aa35.27■■■■□ 3.24
C9orf3-222ENST00000496567 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.21■■■■□ 3.23
C9orf3-222ENST00000496567 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
C9orf3-222ENST00000496567 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.11■■■■□ 3.21
C9orf3-222ENST00000496567 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.11■■■■□ 3.21
C9orf3-222ENST00000496567 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
C9orf3-222ENST00000496567 ARHGEF11O15085 1522 aa35.07■■■■□ 3.2
C9orf3-222ENST00000496567 DISP1Q96F81 1524 aa35.06■■■■□ 3.2
C9orf3-222ENST00000496567 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.03■■■■□ 3.2
C9orf3-222ENST00000496567 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.03■■■■□ 3.2
C9orf3-222ENST00000496567 KIAA0556O60303 1618 aa35.02■■■■□ 3.2
C9orf3-222ENST00000496567 SAMD9Q5K651 1589 aa35.01■■■■□ 3.2
C9orf3-222ENST00000496567 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.98■■■■□ 3.19
C9orf3-222ENST00000496567 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.98■■■■□ 3.19
C9orf3-222ENST00000496567 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.98■■■■□ 3.19
C9orf3-222ENST00000496567 CLIP1P30622 1438 aa34.97■■■■□ 3.19
C9orf3-222ENST00000496567 CEP162Q5TB80 1403 aa34.96■■■■□ 3.19
C9orf3-222ENST00000496567 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.92■■■■□ 3.18
C9orf3-222ENST00000496567 P3H3Q8IVL6 736 aa34.92■■■■□ 3.18
C9orf3-222ENST00000496567 PTPRGP23470 1445 aa34.85■■■■□ 3.17
C9orf3-222ENST00000496567 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.84■■■■□ 3.17
C9orf3-222ENST00000496567 ARAP1Q96P48 1450 aa34.82■■■■□ 3.16
C9orf3-222ENST00000496567 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
C9orf3-222ENST00000496567 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.73■■■■□ 3.15
C9orf3-222ENST00000496567 FMN1Q68DA7 1419 aa34.71■■■■□ 3.15
C9orf3-222ENST00000496567 UACAQ9BZF9 1416 aa34.64■■■■□ 3.14
C9orf3-222ENST00000496567 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.6■■■■□ 3.13
C9orf3-222ENST00000496567 ABCA8O94911 1581 aa34.59■■■■□ 3.13
C9orf3-222ENST00000496567 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.56■■■■□ 3.12
C9orf3-222ENST00000496567 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.56■■■■□ 3.12
C9orf3-222ENST00000496567 ABCC2Q92887 1545 aa34.55■■■■□ 3.12
C9orf3-222ENST00000496567 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.51■■■■□ 3.11
C9orf3-222ENST00000496567 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.51■■■■□ 3.11
C9orf3-222ENST00000496567 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.48■■■■□ 3.11
C9orf3-222ENST00000496567 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
C9orf3-222ENST00000496567 HECW1Q76N89 1606 aa34.45■■■■□ 3.1
C9orf3-222ENST00000496567 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.44■■■■□ 3.1
C9orf3-222ENST00000496567 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
C9orf3-222ENST00000496567 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
C9orf3-222ENST00000496567 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.41■■■■□ 3.1
C9orf3-222ENST00000496567 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.38■■■■□ 3.09
C9orf3-222ENST00000496567 ATP10BO94823 1461 aa34.32■■■■□ 3.09
C9orf3-222ENST00000496567 ARID3CA6NKF2 412 aa34.32■■■■□ 3.08
C9orf3-222ENST00000496567 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
C9orf3-222ENST00000496567 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
C9orf3-222ENST00000496567 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.3■■■■□ 3.08
C9orf3-222ENST00000496567 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
C9orf3-222ENST00000496567 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
C9orf3-222ENST00000496567 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.24■■■■□ 3.07
C9orf3-222ENST00000496567 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
C9orf3-222ENST00000496567 APLP2Q06481 763 aa34.19■■■■□ 3.06
C9orf3-222ENST00000496567 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
C9orf3-222ENST00000496567 MAPKBP1O60336 1514 aa34.19■■■■□ 3.06
C9orf3-222ENST00000496567 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.15■■■■□ 3.06
C9orf3-222ENST00000496567 ASXL2Q76L83 1435 aa34.14■■■■□ 3.06
C9orf3-222ENST00000496567 MAP3K1Q13233 1512 aa34.13■■■■□ 3.05
C9orf3-222ENST00000496567 TIAM1Q13009 1591 aa34.11■■■■□ 3.05
C9orf3-222ENST00000496567 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.1■■■■□ 3.05
C9orf3-222ENST00000496567 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.09■■■■□ 3.05
C9orf3-222ENST00000496567 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
C9orf3-222ENST00000496567 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.01■■■■□ 3.04
C9orf3-222ENST00000496567 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.98■■■■□ 3.03
C9orf3-222ENST00000496567 KCNH8Q96L42 1107 aa33.98■■■■□ 3.03
C9orf3-222ENST00000496567 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.96■■■■□ 3.03
C9orf3-222ENST00000496567 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.96■■■■□ 3.03
C9orf3-222ENST00000496567 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.94■■■■□ 3.02
C9orf3-222ENST00000496567 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
C9orf3-222ENST00000496567 DIP2BQ9P265 1576 aa33.89■■■■□ 3.02
C9orf3-222ENST00000496567 KIF14Q15058 1648 aa33.89■■■■□ 3.02
C9orf3-222ENST00000496567 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.86■■■■□ 3.01
C9orf3-222ENST00000496567 GLI2P10070 1586 aa33.86■■■■□ 3.01
C9orf3-222ENST00000496567 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
C9orf3-222ENST00000496567 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
C9orf3-222ENST00000496567 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.8■■■■□ 3
C9orf3-222ENST00000496567 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.8■■■■□ 3
C9orf3-222ENST00000496567 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.8■■■■□ 3
C9orf3-222ENST00000496567 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.74■■■□□ 2.99
C9orf3-222ENST00000496567 NCOA2Q15596 1464 aa33.74■■■□□ 2.99
C9orf3-222ENST00000496567 CD109Q6YHK3 1445 aa33.72■■■□□ 2.99
C9orf3-222ENST00000496567 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.71■■■□□ 2.99
C9orf3-222ENST00000496567 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
C9orf3-222ENST00000496567 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.69■■■□□ 2.98
C9orf3-222ENST00000496567 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.65■■■□□ 2.98
C9orf3-222ENST00000496567 PLCH2O75038 1416 aa33.63■■■□□ 2.97
C9orf3-222ENST00000496567 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
C9orf3-222ENST00000496567 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.6■■■□□ 2.97
C9orf3-222ENST00000496567 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.6■■■□□ 2.97
C9orf3-222ENST00000496567 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.59■■■□□ 2.97
C9orf3-222ENST00000496567 PREX2Q70Z35 1606 aa33.59■■■□□ 2.97
C9orf3-222ENST00000496567 TSPOAP1O95153 1857 aa33.58■■■□□ 2.97
C9orf3-222ENST00000496567 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.56■■■□□ 2.96
C9orf3-222ENST00000496567 MYOM3Q5VTT5 1437 aa33.56■■■□□ 2.96
C9orf3-222ENST00000496567 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms