RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494396.5

SYP-208, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 2,062 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-208ENST00000494396 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SYP-208ENST00000494396 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SYP-208ENST00000494396 IFT140Q96RY7 1462 aa24.9■■□□□ 1.58
SYP-208ENST00000494396 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.86■■□□□ 1.57
SYP-208ENST00000494396 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
SYP-208ENST00000494396 PBRM1Q86U86 1689 aa24.78■■□□□ 1.56
SYP-208ENST00000494396 ARAP1Q96P48 1450 aa24.77■■□□□ 1.56
SYP-208ENST00000494396 GRIN2BQ13224 1484 aa24.76■■□□□ 1.55
SYP-208ENST00000494396 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SYP-208ENST00000494396 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.75■■□□□ 1.55
SYP-208ENST00000494396 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SYP-208ENST00000494396 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SYP-208ENST00000494396 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.71■■□□□ 1.55
SYP-208ENST00000494396 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.68■■□□□ 1.54
SYP-208ENST00000494396 ADAMTS12P58397 1594 aa24.67■■□□□ 1.54
SYP-208ENST00000494396 APLP2Q06481 763 aa24.66■■□□□ 1.54
SYP-208ENST00000494396 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SYP-208ENST00000494396 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.59■■□□□ 1.53
SYP-208ENST00000494396 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.57■■□□□ 1.52
SYP-208ENST00000494396 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.54■■□□□ 1.52
SYP-208ENST00000494396 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
SYP-208ENST00000494396 P3H3Q8IVL6 736 aa24.49■■□□□ 1.51
SYP-208ENST00000494396 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.47■■□□□ 1.51
SYP-208ENST00000494396 GRIN2AQ12879 1464 aa24.45■■□□□ 1.51
SYP-208ENST00000494396 SAMD9Q5K651 1589 aa24.45■■□□□ 1.51
SYP-208ENST00000494396 IQGAP2Q13576 1575 aa24.44■■□□□ 1.5
SYP-208ENST00000494396 SYNJ2O15056 1496 aa24.43■■□□□ 1.5
SYP-208ENST00000494396 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
SYP-208ENST00000494396 FMN1Q68DA7 1419 aa24.39■■□□□ 1.5
SYP-208ENST00000494396 MAP3K1Q13233 1512 aa24.38■■□□□ 1.49
SYP-208ENST00000494396 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.38■■□□□ 1.49
SYP-208ENST00000494396 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SYP-208ENST00000494396 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SYP-208ENST00000494396 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.35■■□□□ 1.49
SYP-208ENST00000494396 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.35■■□□□ 1.49
SYP-208ENST00000494396 TIAM1Q13009 1591 aa24.33■■□□□ 1.49
SYP-208ENST00000494396 FBLN2P98095 1184 aa24.32■■□□□ 1.48
SYP-208ENST00000494396 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.32■■□□□ 1.48
SYP-208ENST00000494396 MIER1Q8N108 512 aa24.3■■□□□ 1.48
SYP-208ENST00000494396 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SYP-208ENST00000494396 CEP170Q5SW79 1584 aa24.27■■□□□ 1.48
SYP-208ENST00000494396 NUP160Q12769 1436 aa24.26■■□□□ 1.47
SYP-208ENST00000494396 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.26■■□□□ 1.47
SYP-208ENST00000494396 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SYP-208ENST00000494396 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SYP-208ENST00000494396 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.23■■□□□ 1.47
SYP-208ENST00000494396 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SYP-208ENST00000494396 DISP1Q96F81 1524 aa24.19■■□□□ 1.46
SYP-208ENST00000494396 KIAA0556O60303 1618 aa24.18■■□□□ 1.46
SYP-208ENST00000494396 JPH4Q96JJ6 628 aa24.11■■□□□ 1.45
SYP-208ENST00000494396 HECW1Q76N89 1606 aa24.1■■□□□ 1.45
SYP-208ENST00000494396 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.09■■□□□ 1.45
SYP-208ENST00000494396 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.08■■□□□ 1.45
SYP-208ENST00000494396 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.08■■□□□ 1.45
SYP-208ENST00000494396 CHD1O14646 1710 aa24.08■■□□□ 1.44
SYP-208ENST00000494396 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.08■■□□□ 1.44
SYP-208ENST00000494396 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.05■■□□□ 1.44
SYP-208ENST00000494396 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.02■■□□□ 1.44
SYP-208ENST00000494396 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SYP-208ENST00000494396 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.98■■□□□ 1.43
SYP-208ENST00000494396 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.97■■□□□ 1.43
SYP-208ENST00000494396 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
SYP-208ENST00000494396 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
SYP-208ENST00000494396 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
SYP-208ENST00000494396 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
SYP-208ENST00000494396 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
SYP-208ENST00000494396 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.9■■□□□ 1.42
SYP-208ENST00000494396 NCOA2Q15596 1464 aa23.9■■□□□ 1.42
SYP-208ENST00000494396 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.89■■□□□ 1.41
SYP-208ENST00000494396 SHROOM2Q13796 1616 aa23.88■■□□□ 1.41
SYP-208ENST00000494396 ARID3CA6NKF2 412 aa23.88■■□□□ 1.41
SYP-208ENST00000494396 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SYP-208ENST00000494396 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.41
SYP-208ENST00000494396 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.85■■□□□ 1.41
SYP-208ENST00000494396 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SYP-208ENST00000494396 ARHGEF11O15085 1522 aa23.84■■□□□ 1.41
SYP-208ENST00000494396 ITGAEP38570 1179 aa23.83■■□□□ 1.41
SYP-208ENST00000494396 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
SYP-208ENST00000494396 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.83■■□□□ 1.4
SYP-208ENST00000494396 ABCA8O94911 1581 aa23.82■■□□□ 1.4
SYP-208ENST00000494396 PTPRGP23470 1445 aa23.82■■□□□ 1.4
SYP-208ENST00000494396 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.81■■□□□ 1.4
SYP-208ENST00000494396 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.8■■□□□ 1.4
SYP-208ENST00000494396 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.75■■□□□ 1.39
SYP-208ENST00000494396 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.72■■□□□ 1.39
SYP-208ENST00000494396 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SYP-208ENST00000494396 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.71■■□□□ 1.39
SYP-208ENST00000494396 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.7■■□□□ 1.38
SYP-208ENST00000494396 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.69■■□□□ 1.38
SYP-208ENST00000494396 MIA2Q96PC5 1412 aa23.68■■□□□ 1.38
SYP-208ENST00000494396 ATP10BO94823 1461 aa23.68■■□□□ 1.38
SYP-208ENST00000494396 UACAQ9BZF9 1416 aa23.67■■□□□ 1.38
SYP-208ENST00000494396 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SYP-208ENST00000494396 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.64■■□□□ 1.37
SYP-208ENST00000494396 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.62■■□□□ 1.37
SYP-208ENST00000494396 ABCC2Q92887 1545 aa23.59■■□□□ 1.37
SYP-208ENST00000494396 KIF14Q15058 1648 aa23.57■■□□□ 1.36
SYP-208ENST00000494396 PTPRKQ15262 1439 aa23.56■■□□□ 1.36
SYP-208ENST00000494396 OSCARQ8IYS5 282 aa23.56■■□□□ 1.36
SYP-208ENST00000494396 MAPKBP1O60336 1514 aa23.54■■□□□ 1.36
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