RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491889.5

GLIS3-217, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 797 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-217ENST00000491889 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.34■■■■□ 3.09
GLIS3-217ENST00000491889 SHROOM2Q13796 1616 aa34.32■■■■□ 3.08
GLIS3-217ENST00000491889 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
GLIS3-217ENST00000491889 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.28■■■■□ 3.08
GLIS3-217ENST00000491889 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.19■■■■□ 3.06
GLIS3-217ENST00000491889 IQGAP2Q13576 1575 aa34.16■■■■□ 3.06
GLIS3-217ENST00000491889 ARAP1Q96P48 1450 aa34.16■■■■□ 3.06
GLIS3-217ENST00000491889 JPH4Q96JJ6 628 aa34.16■■■■□ 3.06
GLIS3-217ENST00000491889 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.15■■■■□ 3.06
GLIS3-217ENST00000491889 KIF21BO75037 1637 aa34.13■■■■□ 3.05
GLIS3-217ENST00000491889 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
GLIS3-217ENST00000491889 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.01■■■■□ 3.03
GLIS3-217ENST00000491889 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.98■■■■□ 3.03
GLIS3-217ENST00000491889 DISP1Q96F81 1524 aa33.89■■■■□ 3.02
GLIS3-217ENST00000491889 GOLGA3Q08378 1498 aa33.89■■■■□ 3.02
GLIS3-217ENST00000491889 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.88■■■■□ 3.01
GLIS3-217ENST00000491889 KIAA0556O60303 1618 aa33.84■■■■□ 3.01
GLIS3-217ENST00000491889 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.82■■■■□ 3
GLIS3-217ENST00000491889 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.76■■■■□ 3
GLIS3-217ENST00000491889 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
GLIS3-217ENST00000491889 PTPRGP23470 1445 aa33.71■■■□□ 2.99
GLIS3-217ENST00000491889 SAMD9Q5K651 1589 aa33.7■■■□□ 2.99
GLIS3-217ENST00000491889 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
GLIS3-217ENST00000491889 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.62■■■□□ 2.97
GLIS3-217ENST00000491889 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.6■■■□□ 2.97
GLIS3-217ENST00000491889 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.57■■■□□ 2.96
GLIS3-217ENST00000491889 P3H3Q8IVL6 736 aa33.56■■■□□ 2.96
GLIS3-217ENST00000491889 UACAQ9BZF9 1416 aa33.51■■■□□ 2.95
GLIS3-217ENST00000491889 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.49■■■□□ 2.95
GLIS3-217ENST00000491889 ABCC2Q92887 1545 aa33.48■■■□□ 2.95
GLIS3-217ENST00000491889 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.48■■■□□ 2.95
GLIS3-217ENST00000491889 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.46■■■□□ 2.95
GLIS3-217ENST00000491889 ABCA8O94911 1581 aa33.46■■■□□ 2.95
GLIS3-217ENST00000491889 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.44■■■□□ 2.94
GLIS3-217ENST00000491889 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.37■■■□□ 2.93
GLIS3-217ENST00000491889 MAPKBP1O60336 1514 aa33.34■■■□□ 2.93
GLIS3-217ENST00000491889 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.33■■■□□ 2.93
GLIS3-217ENST00000491889 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.33■■■□□ 2.93
GLIS3-217ENST00000491889 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.32■■■□□ 2.92
GLIS3-217ENST00000491889 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.31■■■□□ 2.92
GLIS3-217ENST00000491889 CLIP1P30622 1438 aa33.28■■■□□ 2.92
GLIS3-217ENST00000491889 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.23■■■□□ 2.91
GLIS3-217ENST00000491889 FMN1Q68DA7 1419 aa33.21■■■□□ 2.91
GLIS3-217ENST00000491889 CEP162Q5TB80 1403 aa33.2■■■□□ 2.91
GLIS3-217ENST00000491889 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.18■■■□□ 2.9
GLIS3-217ENST00000491889 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.18■■■□□ 2.9
GLIS3-217ENST00000491889 ASXL2Q76L83 1435 aa33.18■■■□□ 2.9
GLIS3-217ENST00000491889 ATP10BO94823 1461 aa33.15■■■□□ 2.9
GLIS3-217ENST00000491889 DIP2BQ9P265 1576 aa33.13■■■□□ 2.89
GLIS3-217ENST00000491889 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.13■■■□□ 2.89
GLIS3-217ENST00000491889 ARID3CA6NKF2 412 aa33.12■■■□□ 2.89
GLIS3-217ENST00000491889 HECW1Q76N89 1606 aa33.09■■■□□ 2.89
GLIS3-217ENST00000491889 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
GLIS3-217ENST00000491889 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.05■■■□□ 2.88
GLIS3-217ENST00000491889 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.01■■■□□ 2.87
GLIS3-217ENST00000491889 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33■■■□□ 2.87
GLIS3-217ENST00000491889 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.99■■■□□ 2.87
GLIS3-217ENST00000491889 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
GLIS3-217ENST00000491889 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
GLIS3-217ENST00000491889 GLI2P10070 1586 aa32.97■■■□□ 2.87
GLIS3-217ENST00000491889 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
GLIS3-217ENST00000491889 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
GLIS3-217ENST00000491889 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
GLIS3-217ENST00000491889 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.95■■■□□ 2.87
GLIS3-217ENST00000491889 TSPOAP1O95153 1857 aa32.87■■■□□ 2.85
GLIS3-217ENST00000491889 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.87■■■□□ 2.85
GLIS3-217ENST00000491889 KCNH8Q96L42 1107 aa32.85■■■□□ 2.85
GLIS3-217ENST00000491889 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.85■■■□□ 2.85
GLIS3-217ENST00000491889 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.82■■■□□ 2.84
GLIS3-217ENST00000491889 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.81■■■□□ 2.84
GLIS3-217ENST00000491889 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
GLIS3-217ENST00000491889 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.79■■■□□ 2.84
GLIS3-217ENST00000491889 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.77■■■□□ 2.84
GLIS3-217ENST00000491889 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
GLIS3-217ENST00000491889 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.83
GLIS3-217ENST00000491889 CD109Q6YHK3 1445 aa32.7■■■□□ 2.83
GLIS3-217ENST00000491889 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.69■■■□□ 2.82
GLIS3-217ENST00000491889 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.67■■■□□ 2.82
GLIS3-217ENST00000491889 KIF14Q15058 1648 aa32.66■■■□□ 2.82
GLIS3-217ENST00000491889 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.65■■■□□ 2.82
GLIS3-217ENST00000491889 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.63■■■□□ 2.81
GLIS3-217ENST00000491889 TIAM1Q13009 1591 aa32.57■■■□□ 2.8
GLIS3-217ENST00000491889 KDM6BO15054 1643 aa32.53■■■□□ 2.8
GLIS3-217ENST00000491889 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.52■■■□□ 2.8
GLIS3-217ENST00000491889 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.51■■■□□ 2.79
GLIS3-217ENST00000491889 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.51■■■□□ 2.79
GLIS3-217ENST00000491889 MAP3K1Q13233 1512 aa32.48■■■□□ 2.79
GLIS3-217ENST00000491889 PLCH2O75038 1416 aa32.44■■■□□ 2.78
GLIS3-217ENST00000491889 NEO1Q92859 1461 aa32.43■■■□□ 2.78
GLIS3-217ENST00000491889 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
GLIS3-217ENST00000491889 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.42■■■□□ 2.78
GLIS3-217ENST00000491889 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.42■■■□□ 2.78
GLIS3-217ENST00000491889 FANCAO15360 1455 aa32.41■■■□□ 2.78
GLIS3-217ENST00000491889 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.4■■■□□ 2.78
GLIS3-217ENST00000491889 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.4■■■□□ 2.78
GLIS3-217ENST00000491889 PREX2Q70Z35 1606 aa32.4■■■□□ 2.78
GLIS3-217ENST00000491889 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.39■■■□□ 2.78
GLIS3-217ENST00000491889 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.37■■■□□ 2.77
GLIS3-217ENST00000491889 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
GLIS3-217ENST00000491889 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms