RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489731.1

NOTCH2-204, Transcript of notch 2, humanhuman

TSL 5

Gene NOTCH2, Length 414 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2-204ENST00000489731 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa19.25■□□□□ 0.67
NOTCH2-204ENST00000489731 NUP160Q12769 1436 aa19.24■□□□□ 0.67
NOTCH2-204ENST00000489731 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.21■□□□□ 0.67
NOTCH2-204ENST00000489731 CEP162Q5TB80 1403 aa19.19■□□□□ 0.66
NOTCH2-204ENST00000489731 CHD1O14646 1710 aa19.19■□□□□ 0.66
NOTCH2-204ENST00000489731 IQGAP2Q13576 1575 aa19.19■□□□□ 0.66
NOTCH2-204ENST00000489731 CLIP1P30622 1438 aa19.17■□□□□ 0.66
NOTCH2-204ENST00000489731 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.15■□□□□ 0.66
NOTCH2-204ENST00000489731 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.15■□□□□ 0.66
NOTCH2-204ENST00000489731 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.15■□□□□ 0.66
NOTCH2-204ENST00000489731 CEP170Q5SW79 1584 aa19.15■□□□□ 0.66
NOTCH2-204ENST00000489731 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
NOTCH2-204ENST00000489731 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.14■□□□□ 0.65
NOTCH2-204ENST00000489731 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.12■□□□□ 0.65
NOTCH2-204ENST00000489731 JPH4Q96JJ6 628 aa19.12■□□□□ 0.65
NOTCH2-204ENST00000489731 ARHGEF11O15085 1522 aa19.09■□□□□ 0.65
NOTCH2-204ENST00000489731 UGGT2Q9NYU1 1516 aa19.09■□□□□ 0.65
NOTCH2-204ENST00000489731 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.03■□□□□ 0.64
NOTCH2-204ENST00000489731 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.02■□□□□ 0.63
NOTCH2-204ENST00000489731 FMN1Q68DA7 1419 aa19.01■□□□□ 0.63
NOTCH2-204ENST00000489731 SAMD9Q5K651 1589 aa19■□□□□ 0.63
NOTCH2-204ENST00000489731 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
NOTCH2-204ENST00000489731 APLP2Q06481 763 aa18.97■□□□□ 0.63
NOTCH2-204ENST00000489731 P3H3Q8IVL6 736 aa18.97■□□□□ 0.63
NOTCH2-204ENST00000489731 SHROOM2Q13796 1616 aa18.96■□□□□ 0.63
NOTCH2-204ENST00000489731 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.96■□□□□ 0.63
NOTCH2-204ENST00000489731 KIAA0556O60303 1618 aa18.96■□□□□ 0.63
NOTCH2-204ENST00000489731 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.94■□□□□ 0.62
NOTCH2-204ENST00000489731 DISP1Q96F81 1524 aa18.94■□□□□ 0.62
NOTCH2-204ENST00000489731 ARAP1Q96P48 1450 aa18.92■□□□□ 0.62
NOTCH2-204ENST00000489731 PTPRGP23470 1445 aa18.89■□□□□ 0.61
NOTCH2-204ENST00000489731 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
NOTCH2-204ENST00000489731 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
NOTCH2-204ENST00000489731 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.84■□□□□ 0.61
NOTCH2-204ENST00000489731 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.83■□□□□ 0.61
NOTCH2-204ENST00000489731 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.82■□□□□ 0.6
NOTCH2-204ENST00000489731 HECW1Q76N89 1606 aa18.78■□□□□ 0.6
NOTCH2-204ENST00000489731 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.77■□□□□ 0.6
NOTCH2-204ENST00000489731 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
NOTCH2-204ENST00000489731 UACAQ9BZF9 1416 aa18.76■□□□□ 0.59
NOTCH2-204ENST00000489731 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.74■□□□□ 0.59
NOTCH2-204ENST00000489731 MAP3K1Q13233 1512 aa18.74■□□□□ 0.59
NOTCH2-204ENST00000489731 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
NOTCH2-204ENST00000489731 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.72■□□□□ 0.59
NOTCH2-204ENST00000489731 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
NOTCH2-204ENST00000489731 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
NOTCH2-204ENST00000489731 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.71■□□□□ 0.59
NOTCH2-204ENST00000489731 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.71■□□□□ 0.59
NOTCH2-204ENST00000489731 ABCA8O94911 1581 aa18.7■□□□□ 0.58
NOTCH2-204ENST00000489731 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa18.7■□□□□ 0.58
NOTCH2-204ENST00000489731 ABCC2Q92887 1545 aa18.69■□□□□ 0.58
NOTCH2-204ENST00000489731 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
NOTCH2-204ENST00000489731 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
NOTCH2-204ENST00000489731 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.64■□□□□ 0.57
NOTCH2-204ENST00000489731 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.64■□□□□ 0.57
NOTCH2-204ENST00000489731 TIAM1Q13009 1591 aa18.64■□□□□ 0.57
NOTCH2-204ENST00000489731 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
NOTCH2-204ENST00000489731 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.6■□□□□ 0.57
NOTCH2-204ENST00000489731 ARID3CA6NKF2 412 aa18.58■□□□□ 0.56
NOTCH2-204ENST00000489731 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.58■□□□□ 0.56
NOTCH2-204ENST00000489731 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.58■□□□□ 0.56
NOTCH2-204ENST00000489731 ATP10BO94823 1461 aa18.57■□□□□ 0.56
NOTCH2-204ENST00000489731 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.56■□□□□ 0.56
NOTCH2-204ENST00000489731 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
NOTCH2-204ENST00000489731 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.52■□□□□ 0.56
NOTCH2-204ENST00000489731 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
NOTCH2-204ENST00000489731 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
NOTCH2-204ENST00000489731 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
NOTCH2-204ENST00000489731 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
NOTCH2-204ENST00000489731 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
NOTCH2-204ENST00000489731 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.46■□□□□ 0.55
NOTCH2-204ENST00000489731 KIF14Q15058 1648 aa18.44■□□□□ 0.54
NOTCH2-204ENST00000489731 WDR7Q9Y4E6 1490 aa18.44■□□□□ 0.54
NOTCH2-204ENST00000489731 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.42■□□□□ 0.54
NOTCH2-204ENST00000489731 ASXL2Q76L83 1435 aa18.42■□□□□ 0.54
NOTCH2-204ENST00000489731 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
NOTCH2-204ENST00000489731 NCOA2Q15596 1464 aa18.41■□□□□ 0.54
NOTCH2-204ENST00000489731 MAPKBP1O60336 1514 aa18.4■□□□□ 0.54
NOTCH2-204ENST00000489731 KCNH8Q96L42 1107 aa18.4■□□□□ 0.54
NOTCH2-204ENST00000489731 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.39■□□□□ 0.53
NOTCH2-204ENST00000489731 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.36■□□□□ 0.53
NOTCH2-204ENST00000489731 MIA2Q96PC5 1412 aa18.35■□□□□ 0.53
NOTCH2-204ENST00000489731 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
NOTCH2-204ENST00000489731 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.32■□□□□ 0.52
NOTCH2-204ENST00000489731 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.32■□□□□ 0.52
NOTCH2-204ENST00000489731 KIF13AQ9H1H9 1805 aa18.31■□□□□ 0.52
NOTCH2-204ENST00000489731 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
NOTCH2-204ENST00000489731 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.52
NOTCH2-204ENST00000489731 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.3■□□□□ 0.52
NOTCH2-204ENST00000489731 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.29■□□□□ 0.52
NOTCH2-204ENST00000489731 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.28■□□□□ 0.52
NOTCH2-204ENST00000489731 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
NOTCH2-204ENST00000489731 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
NOTCH2-204ENST00000489731 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
NOTCH2-204ENST00000489731 ARAP3Q8WWN8 1544 aa18.26■□□□□ 0.51
NOTCH2-204ENST00000489731 PLCH2O75038 1416 aa18.25■□□□□ 0.51
NOTCH2-204ENST00000489731 ABCA9Q8IUA7 1624 aa18.25■□□□□ 0.51
NOTCH2-204ENST00000489731 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.25■□□□□ 0.51
NOTCH2-204ENST00000489731 FAM69CQ0P6D2 419 aa18.24■□□□□ 0.51
NOTCH2-204ENST00000489731 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms