RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487873.1

C6orf136-211, Transcript of chromosome 6 open reading frame 136, humanhuman

TSL 3

Gene C6orf136, Length 464 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf136-211ENST00000487873 ARHGEF11O15085 1522 aa23.01■■□□□ 1.27
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C6orf136-211ENST00000487873 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.93■■□□□ 1.26
C6orf136-211ENST00000487873 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.93■■□□□ 1.26
C6orf136-211ENST00000487873 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
C6orf136-211ENST00000487873 SHROOM2Q13796 1616 aa22.9■■□□□ 1.26
C6orf136-211ENST00000487873 IQGAP2Q13576 1575 aa22.88■■□□□ 1.25
C6orf136-211ENST00000487873 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.87■■□□□ 1.25
C6orf136-211ENST00000487873 KIF21BO75037 1637 aa22.86■■□□□ 1.25
C6orf136-211ENST00000487873 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.85■■□□□ 1.25
C6orf136-211ENST00000487873 ARAP1Q96P48 1450 aa22.83■■□□□ 1.25
C6orf136-211ENST00000487873 GOLGA3Q08378 1498 aa22.8■■□□□ 1.24
C6orf136-211ENST00000487873 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
C6orf136-211ENST00000487873 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.78■■□□□ 1.24
C6orf136-211ENST00000487873 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.75■■□□□ 1.23
C6orf136-211ENST00000487873 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.74■■□□□ 1.23
C6orf136-211ENST00000487873 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.74■■□□□ 1.23
C6orf136-211ENST00000487873 PTPRGP23470 1445 aa22.7■■□□□ 1.22
C6orf136-211ENST00000487873 DISP1Q96F81 1524 aa22.69■■□□□ 1.22
C6orf136-211ENST00000487873 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.68■■□□□ 1.22
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C6orf136-211ENST00000487873 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
C6orf136-211ENST00000487873 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.56■■□□□ 1.2
C6orf136-211ENST00000487873 P3H3Q8IVL6 736 aa22.54■■□□□ 1.2
C6orf136-211ENST00000487873 UACAQ9BZF9 1416 aa22.54■■□□□ 1.2
C6orf136-211ENST00000487873 SAMD9Q5K651 1589 aa22.53■■□□□ 1.2
C6orf136-211ENST00000487873 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.5■■□□□ 1.19
C6orf136-211ENST00000487873 ABCC2Q92887 1545 aa22.45■■□□□ 1.18
C6orf136-211ENST00000487873 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.44■■□□□ 1.18
C6orf136-211ENST00000487873 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.42■■□□□ 1.18
C6orf136-211ENST00000487873 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.41■■□□□ 1.18
C6orf136-211ENST00000487873 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.41■■□□□ 1.18
C6orf136-211ENST00000487873 CLIP1P30622 1438 aa22.4■■□□□ 1.18
C6orf136-211ENST00000487873 FMN1Q68DA7 1419 aa22.4■■□□□ 1.18
C6orf136-211ENST00000487873 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.39■■□□□ 1.17
C6orf136-211ENST00000487873 ABCA8O94911 1581 aa22.38■■□□□ 1.17
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C6orf136-211ENST00000487873 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.36■■□□□ 1.17
C6orf136-211ENST00000487873 MAPKBP1O60336 1514 aa22.34■■□□□ 1.17
C6orf136-211ENST00000487873 CEP162Q5TB80 1403 aa22.31■■□□□ 1.16
C6orf136-211ENST00000487873 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.28■■□□□ 1.16
C6orf136-211ENST00000487873 ASXL2Q76L83 1435 aa22.27■■□□□ 1.16
C6orf136-211ENST00000487873 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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C6orf136-211ENST00000487873 ATP10BO94823 1461 aa22.23■■□□□ 1.15
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C6orf136-211ENST00000487873 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.23■■□□□ 1.15
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C6orf136-211ENST00000487873 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.2■■□□□ 1.14
C6orf136-211ENST00000487873 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.2■■□□□ 1.14
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C6orf136-211ENST00000487873 HECW1Q76N89 1606 aa22.17■■□□□ 1.14
C6orf136-211ENST00000487873 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.15■■□□□ 1.14
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C6orf136-211ENST00000487873 KCNH8Q96L42 1107 aa22.12■■□□□ 1.13
C6orf136-211ENST00000487873 DIP2BQ9P265 1576 aa22.12■■□□□ 1.13
C6orf136-211ENST00000487873 GLI2P10070 1586 aa22.1■■□□□ 1.13
C6orf136-211ENST00000487873 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
C6orf136-211ENST00000487873 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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C6orf136-211ENST00000487873 CD109Q6YHK3 1445 aa22■■□□□ 1.11
C6orf136-211ENST00000487873 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22■■□□□ 1.11
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C6orf136-211ENST00000487873 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.97■■□□□ 1.11
C6orf136-211ENST00000487873 APLP2Q06481 763 aa21.96■■□□□ 1.11
C6orf136-211ENST00000487873 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.93■■□□□ 1.1
C6orf136-211ENST00000487873 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.93■■□□□ 1.1
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C6orf136-211ENST00000487873 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.91■■□□□ 1.1
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C6orf136-211ENST00000487873 KIF14Q15058 1648 aa21.88■■□□□ 1.09
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C6orf136-211ENST00000487873 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
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C6orf136-211ENST00000487873 PLCH2O75038 1416 aa21.82■■□□□ 1.08
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C6orf136-211ENST00000487873 TIAM1Q13009 1591 aa21.82■■□□□ 1.08
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C6orf136-211ENST00000487873 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.78■■□□□ 1.08
C6orf136-211ENST00000487873 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.78■■□□□ 1.08
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C6orf136-211ENST00000487873 FANCAO15360 1455 aa21.77■■□□□ 1.07
C6orf136-211ENST00000487873 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.77■■□□□ 1.07
C6orf136-211ENST00000487873 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.76■■□□□ 1.07
C6orf136-211ENST00000487873 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.74■■□□□ 1.07
C6orf136-211ENST00000487873 KDM6BO15054 1643 aa21.74■■□□□ 1.07
C6orf136-211ENST00000487873 AKNAQ7Z591 1439 aa21.73■■□□□ 1.07
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C6orf136-211ENST00000487873 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
C6orf136-211ENST00000487873 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
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