RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-208ENST00000487290 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.79■■■□□ 2.04
HCLS1-208ENST00000487290 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.79■■■□□ 2.04
HCLS1-208ENST00000487290 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.78■■■□□ 2.04
HCLS1-208ENST00000487290 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.74■■■□□ 2.03
HCLS1-208ENST00000487290 KIF21BO75037 1637 aa27.72■■■□□ 2.03
HCLS1-208ENST00000487290 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.68■■■□□ 2.02
HCLS1-208ENST00000487290 IQGAP2Q13576 1575 aa27.67■■■□□ 2.02
HCLS1-208ENST00000487290 ARAP1Q96P48 1450 aa27.6■■■□□ 2.01
HCLS1-208ENST00000487290 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.6■■■□□ 2.01
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HCLS1-208ENST00000487290 KIAA0556O60303 1618 aa27.42■■□□□ 1.98
HCLS1-208ENST00000487290 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.4■■□□□ 1.98
HCLS1-208ENST00000487290 SAMD9Q5K651 1589 aa27.37■■□□□ 1.97
HCLS1-208ENST00000487290 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.31■■□□□ 1.96
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HCLS1-208ENST00000487290 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.27■■□□□ 1.96
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HCLS1-208ENST00000487290 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.21■■□□□ 1.95
HCLS1-208ENST00000487290 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.19■■□□□ 1.94
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HCLS1-208ENST00000487290 UACAQ9BZF9 1416 aa27.11■■□□□ 1.93
HCLS1-208ENST00000487290 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.09■■□□□ 1.93
HCLS1-208ENST00000487290 MAPKBP1O60336 1514 aa27.05■■□□□ 1.92
HCLS1-208ENST00000487290 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.04■■□□□ 1.92
HCLS1-208ENST00000487290 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.03■■□□□ 1.92
HCLS1-208ENST00000487290 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.02■■□□□ 1.92
HCLS1-208ENST00000487290 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.99■■□□□ 1.91
HCLS1-208ENST00000487290 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.98■■□□□ 1.91
HCLS1-208ENST00000487290 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
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HCLS1-208ENST00000487290 FMN1Q68DA7 1419 aa26.92■■□□□ 1.9
HCLS1-208ENST00000487290 P3H3Q8IVL6 736 aa26.92■■□□□ 1.9
HCLS1-208ENST00000487290 CEP162Q5TB80 1403 aa26.89■■□□□ 1.89
HCLS1-208ENST00000487290 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
HCLS1-208ENST00000487290 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
HCLS1-208ENST00000487290 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
HCLS1-208ENST00000487290 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.84■■□□□ 1.89
HCLS1-208ENST00000487290 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.83■■□□□ 1.89
HCLS1-208ENST00000487290 DIP2BQ9P265 1576 aa26.82■■□□□ 1.88
HCLS1-208ENST00000487290 HECW1Q76N89 1606 aa26.82■■□□□ 1.88
HCLS1-208ENST00000487290 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.81■■□□□ 1.88
HCLS1-208ENST00000487290 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.81■■□□□ 1.88
HCLS1-208ENST00000487290 ATP10BO94823 1461 aa26.81■■□□□ 1.88
HCLS1-208ENST00000487290 ASXL2Q76L83 1435 aa26.8■■□□□ 1.88
HCLS1-208ENST00000487290 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
HCLS1-208ENST00000487290 GLI2P10070 1586 aa26.75■■□□□ 1.87
HCLS1-208ENST00000487290 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.75■■□□□ 1.87
HCLS1-208ENST00000487290 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.75■■□□□ 1.87
HCLS1-208ENST00000487290 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.74■■□□□ 1.87
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HCLS1-208ENST00000487290 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.65■■□□□ 1.86
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HCLS1-208ENST00000487290 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.63■■□□□ 1.85
HCLS1-208ENST00000487290 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.59■■□□□ 1.85
HCLS1-208ENST00000487290 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.59■■□□□ 1.85
HCLS1-208ENST00000487290 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
HCLS1-208ENST00000487290 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.57■■□□□ 1.84
HCLS1-208ENST00000487290 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
HCLS1-208ENST00000487290 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.55■■□□□ 1.84
HCLS1-208ENST00000487290 ARID3CA6NKF2 412 aa26.51■■□□□ 1.83
HCLS1-208ENST00000487290 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HCLS1-208ENST00000487290 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.47■■□□□ 1.83
HCLS1-208ENST00000487290 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.46■■□□□ 1.83
HCLS1-208ENST00000487290 TSPOAP1O95153 1857 aa26.45■■□□□ 1.82
HCLS1-208ENST00000487290 MAP3K1Q13233 1512 aa26.44■■□□□ 1.82
HCLS1-208ENST00000487290 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
HCLS1-208ENST00000487290 KIF14Q15058 1648 aa26.43■■□□□ 1.82
HCLS1-208ENST00000487290 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
HCLS1-208ENST00000487290 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.42■■□□□ 1.82
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HCLS1-208ENST00000487290 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.41■■□□□ 1.82
HCLS1-208ENST00000487290 TIAM1Q13009 1591 aa26.41■■□□□ 1.82
HCLS1-208ENST00000487290 CD109Q6YHK3 1445 aa26.39■■□□□ 1.82
HCLS1-208ENST00000487290 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
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HCLS1-208ENST00000487290 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.37■■□□□ 1.81
HCLS1-208ENST00000487290 KCNH8Q96L42 1107 aa26.36■■□□□ 1.81
HCLS1-208ENST00000487290 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.33■■□□□ 1.81
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HCLS1-208ENST00000487290 NEO1Q92859 1461 aa26.3■■□□□ 1.8
HCLS1-208ENST00000487290 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.27■■□□□ 1.8
HCLS1-208ENST00000487290 PREX2Q70Z35 1606 aa26.27■■□□□ 1.8
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HCLS1-208ENST00000487290 PLCH2O75038 1416 aa26.26■■□□□ 1.79
HCLS1-208ENST00000487290 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.25■■□□□ 1.79
HCLS1-208ENST00000487290 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.25■■□□□ 1.79
HCLS1-208ENST00000487290 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.24■■□□□ 1.79
HCLS1-208ENST00000487290 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.23■■□□□ 1.79
HCLS1-208ENST00000487290 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
HCLS1-208ENST00000487290 FANCAO15360 1455 aa26.19■■□□□ 1.78
HCLS1-208ENST00000487290 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
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