RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486260.5

THBS3-207, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 5

Gene THBS3, Length 1,763 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-207ENST00000486260 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.77■■□□□ 1.88
THBS3-207ENST00000486260 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.75■■□□□ 1.87
THBS3-207ENST00000486260 OSCARQ8IYS5 282 aa26.72■■□□□ 1.87
THBS3-207ENST00000486260 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.72■■□□□ 1.87
THBS3-207ENST00000486260 IQGAP2Q13576 1575 aa26.67■■□□□ 1.86
THBS3-207ENST00000486260 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
THBS3-207ENST00000486260 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.64■■□□□ 1.86
THBS3-207ENST00000486260 JPH4Q96JJ6 628 aa26.59■■□□□ 1.85
THBS3-207ENST00000486260 CEP162Q5TB80 1403 aa26.58■■□□□ 1.84
THBS3-207ENST00000486260 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.54■■□□□ 1.84
THBS3-207ENST00000486260 CLIP1P30622 1438 aa26.52■■□□□ 1.84
THBS3-207ENST00000486260 SHROOM2Q13796 1616 aa26.51■■□□□ 1.83
THBS3-207ENST00000486260 P3H3Q8IVL6 736 aa26.47■■□□□ 1.83
THBS3-207ENST00000486260 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
THBS3-207ENST00000486260 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.46■■□□□ 1.83
THBS3-207ENST00000486260 DISP1Q96F81 1524 aa26.45■■□□□ 1.83
THBS3-207ENST00000486260 SAMD9Q5K651 1589 aa26.45■■□□□ 1.82
THBS3-207ENST00000486260 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.44■■□□□ 1.82
THBS3-207ENST00000486260 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.41■■□□□ 1.82
THBS3-207ENST00000486260 KIAA0556O60303 1618 aa26.4■■□□□ 1.82
THBS3-207ENST00000486260 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.4■■□□□ 1.82
THBS3-207ENST00000486260 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.38■■□□□ 1.81
THBS3-207ENST00000486260 ARAP1Q96P48 1450 aa26.36■■□□□ 1.81
THBS3-207ENST00000486260 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
THBS3-207ENST00000486260 ARHGEF11O15085 1522 aa26.26■■□□□ 1.79
THBS3-207ENST00000486260 PTPRGP23470 1445 aa26.23■■□□□ 1.79
THBS3-207ENST00000486260 FMN1Q68DA7 1419 aa26.21■■□□□ 1.79
THBS3-207ENST00000486260 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.2■■□□□ 1.78
THBS3-207ENST00000486260 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.2■■□□□ 1.78
THBS3-207ENST00000486260 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.2■■□□□ 1.78
THBS3-207ENST00000486260 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.19■■□□□ 1.78
THBS3-207ENST00000486260 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.13■■□□□ 1.77
THBS3-207ENST00000486260 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
THBS3-207ENST00000486260 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
THBS3-207ENST00000486260 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.09■■□□□ 1.77
THBS3-207ENST00000486260 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.09■■□□□ 1.77
THBS3-207ENST00000486260 ABCA8O94911 1581 aa26.07■■□□□ 1.76
THBS3-207ENST00000486260 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.07■■□□□ 1.76
THBS3-207ENST00000486260 UACAQ9BZF9 1416 aa26.06■■□□□ 1.76
THBS3-207ENST00000486260 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.05■■□□□ 1.76
THBS3-207ENST00000486260 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.04■■□□□ 1.76
THBS3-207ENST00000486260 HECW1Q76N89 1606 aa26■■□□□ 1.75
THBS3-207ENST00000486260 ABCC2Q92887 1545 aa26■■□□□ 1.75
THBS3-207ENST00000486260 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
THBS3-207ENST00000486260 ARID3CA6NKF2 412 aa26■■□□□ 1.75
THBS3-207ENST00000486260 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.97■■□□□ 1.75
THBS3-207ENST00000486260 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.96■■□□□ 1.75
THBS3-207ENST00000486260 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.95■■□□□ 1.74
THBS3-207ENST00000486260 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
THBS3-207ENST00000486260 APLP2Q06481 763 aa25.92■■□□□ 1.74
THBS3-207ENST00000486260 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
THBS3-207ENST00000486260 ATP10BO94823 1461 aa25.9■■□□□ 1.74
THBS3-207ENST00000486260 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
THBS3-207ENST00000486260 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
THBS3-207ENST00000486260 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.89■■□□□ 1.73
THBS3-207ENST00000486260 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.86■■□□□ 1.73
THBS3-207ENST00000486260 TIAM1Q13009 1591 aa25.85■■□□□ 1.73
THBS3-207ENST00000486260 MAP3K1Q13233 1512 aa25.84■■□□□ 1.73
THBS3-207ENST00000486260 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
THBS3-207ENST00000486260 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.83■■□□□ 1.73
THBS3-207ENST00000486260 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.81■■□□□ 1.72
THBS3-207ENST00000486260 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
THBS3-207ENST00000486260 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
THBS3-207ENST00000486260 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
THBS3-207ENST00000486260 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.75■■□□□ 1.71
THBS3-207ENST00000486260 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.75■■□□□ 1.71
THBS3-207ENST00000486260 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.74■■□□□ 1.71
THBS3-207ENST00000486260 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.73■■□□□ 1.71
THBS3-207ENST00000486260 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
THBS3-207ENST00000486260 ASXL2Q76L83 1435 aa25.68■■□□□ 1.7
THBS3-207ENST00000486260 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.67■■□□□ 1.7
THBS3-207ENST00000486260 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.64■■□□□ 1.69
THBS3-207ENST00000486260 KCNH8Q96L42 1107 aa25.63■■□□□ 1.69
THBS3-207ENST00000486260 MAPKBP1O60336 1514 aa25.63■■□□□ 1.69
THBS3-207ENST00000486260 KIF14Q15058 1648 aa25.59■■□□□ 1.69
THBS3-207ENST00000486260 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
THBS3-207ENST00000486260 NCOA2Q15596 1464 aa25.56■■□□□ 1.68
THBS3-207ENST00000486260 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
THBS3-207ENST00000486260 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.49■■□□□ 1.67
THBS3-207ENST00000486260 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.48■■□□□ 1.67
THBS3-207ENST00000486260 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.46■■□□□ 1.67
THBS3-207ENST00000486260 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.45■■□□□ 1.66
THBS3-207ENST00000486260 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.42■■□□□ 1.66
THBS3-207ENST00000486260 DIP2BQ9P265 1576 aa25.42■■□□□ 1.66
THBS3-207ENST00000486260 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.42■■□□□ 1.66
THBS3-207ENST00000486260 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
THBS3-207ENST00000486260 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.41■■□□□ 1.66
THBS3-207ENST00000486260 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.39■■□□□ 1.65
THBS3-207ENST00000486260 GLI2P10070 1586 aa25.39■■□□□ 1.65
THBS3-207ENST00000486260 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.36■■□□□ 1.65
THBS3-207ENST00000486260 CD109Q6YHK3 1445 aa25.35■■□□□ 1.65
THBS3-207ENST00000486260 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
THBS3-207ENST00000486260 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.35■■□□□ 1.65
THBS3-207ENST00000486260 PLCH2O75038 1416 aa25.35■■□□□ 1.65
THBS3-207ENST00000486260 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.34■■□□□ 1.65
THBS3-207ENST00000486260 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.34■■□□□ 1.65
THBS3-207ENST00000486260 PREX2Q70Z35 1606 aa25.33■■□□□ 1.65
THBS3-207ENST00000486260 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.33■■□□□ 1.65
THBS3-207ENST00000486260 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.32■■□□□ 1.64
THBS3-207ENST00000486260 MIA2Q96PC5 1412 aa25.31■■□□□ 1.64
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