RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483868.5

TPRA1-208, Transcript of transmembrane protein adipocyte associated 1, human

TSL 5

Gene TPRA1, Length 1,720 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPRA1-208	ENST00000483868	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	45.12	■■■■■ 4.81
TPRA1-208	ENST00000483868	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		45.02	■■■■■ 4.8
TPRA1-208	ENST00000483868	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		45.02	■■■■■ 4.8
TPRA1-208	ENST00000483868	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		44.99	■■■■■ 4.79
TPRA1-208	ENST00000483868	IQGAP2	Q13576	1575 aa		44.91	■■■■■ 4.78
TPRA1-208	ENST00000483868	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		44.86	■■■■■ 4.77
TPRA1-208	ENST00000483868	JPH4	Q96JJ6	628 aa		44.84	■■■■■ 4.77
TPRA1-208	ENST00000483868	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	44.84	■■■■■ 4.77
TPRA1-208	ENST00000483868	SHROOM2	Q13796	1616 aa		44.75	■■■■■ 4.75
TPRA1-208	ENST00000483868	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		44.69	■■■■■ 4.74
TPRA1-208	ENST00000483868	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	44.67	■■■■■ 4.74
TPRA1-208	ENST00000483868	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		44.64	■■■■■ 4.74
TPRA1-208	ENST00000483868	DISP1	Q96F81	1524 aa		44.6	■■■■■ 4.73
TPRA1-208	ENST00000483868	P3H3	Q8IVL6	736 aa		44.55	■■■■■ 4.72
TPRA1-208	ENST00000483868	CEP162	Q5TB80	1403 aa		44.55	■■■■■ 4.72
TPRA1-208	ENST00000483868	SAMD9	Q5K651	1589 aa		44.5	■■■■■ 4.71
TPRA1-208	ENST00000483868	CLIP1	P30622	1438 aa		44.49	■■■■■ 4.71
TPRA1-208	ENST00000483868	KIAA0556	O60303	1618 aa		44.49	■■■■■ 4.71
TPRA1-208	ENST00000483868	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		44.48	■■■■■ 4.71
TPRA1-208	ENST00000483868	ARHGEF11	O15085	1522 aa		44.47	■■■■■ 4.71
TPRA1-208	ENST00000483868	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		44.46	■■■■■ 4.71
TPRA1-208	ENST00000483868	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		44.42	■■■■■ 4.7
TPRA1-208	ENST00000483868	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		44.41	■■■■■ 4.7
TPRA1-208	ENST00000483868	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		44.39	■■■■■ 4.7
TPRA1-208	ENST00000483868	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		44.38	■■■■■ 4.69
TPRA1-208	ENST00000483868	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		44.38	■■■■■ 4.69
TPRA1-208	ENST00000483868	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		44.38	■■■■■ 4.69
TPRA1-208	ENST00000483868	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	44.37	■■■■■ 4.69
TPRA1-208	ENST00000483868	ARAP1	Q96P48	1450 aa		44.3	■■■■■ 4.68
TPRA1-208	ENST00000483868	PTPRG	P23470	1445 aa		44.22	■■■■■ 4.67
TPRA1-208	ENST00000483868	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		44.1	■■■■■ 4.65
TPRA1-208	ENST00000483868	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		44.05	■■■■■ 4.64
TPRA1-208	ENST00000483868	FMN1	Q68DA7	1419 aa		44.01	■■■■■ 4.64
TPRA1-208	ENST00000483868	UACA	Q9BZF9	1416 aa		43.95	■■■■■ 4.63
TPRA1-208	ENST00000483868	ABCA8	O94911	1581 aa		43.94	■■■■■ 4.62
TPRA1-208	ENST00000483868	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		43.91	■■■■■ 4.62
TPRA1-208	ENST00000483868	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		43.88	■■■■■ 4.62
TPRA1-208	ENST00000483868	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	43.87	■■■■■ 4.61
TPRA1-208	ENST00000483868	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		43.85	■■■■■ 4.61
TPRA1-208	ENST00000483868	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	43.84	■■■■■ 4.61
TPRA1-208	ENST00000483868	ABCC2	Q92887	1545 aa		43.83	■■■■■ 4.61
TPRA1-208	ENST00000483868	ARID3C	A6NKF2	412 aa		43.82	■■■■■ 4.61
TPRA1-208	ENST00000483868	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		43.82	■■■■■ 4.61
TPRA1-208	ENST00000483868	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		43.8	■■■■■ 4.6
TPRA1-208	ENST00000483868	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	43.79	■■■■■ 4.6
TPRA1-208	ENST00000483868	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		43.74	■■■■■ 4.59
TPRA1-208	ENST00000483868	HECW1	Q76N89	1606 aa		43.69	■■■■■ 4.58
TPRA1-208	ENST00000483868	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		43.68	■■■■■ 4.58
TPRA1-208	ENST00000483868	ATP10B	O94823	1461 aa		43.64	■■■■■ 4.58
TPRA1-208	ENST00000483868	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	43.63	■■■■■ 4.57
TPRA1-208	ENST00000483868	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		43.63	■■■■■ 4.57
TPRA1-208	ENST00000483868	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	43.62	■■■■■ 4.57
TPRA1-208	ENST00000483868	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	43.57	■■■■■ 4.57
TPRA1-208	ENST00000483868	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	43.55	■■■■■ 4.56
TPRA1-208	ENST00000483868	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	43.55	■■■■■ 4.56
TPRA1-208	ENST00000483868	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	43.52	■■■■■ 4.56
TPRA1-208	ENST00000483868	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		43.48	■■■■■ 4.55
TPRA1-208	ENST00000483868	TIAM1	Q13009	1591 aa		43.39	■■■■■ 4.54
TPRA1-208	ENST00000483868	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		43.36	■■■■■ 4.53
TPRA1-208	ENST00000483868	ASXL2	Q76L83	1435 aa		43.36	■■■■■ 4.53
TPRA1-208	ENST00000483868	APLP2	Q06481	763 aa		43.35	■■■■■ 4.53
TPRA1-208	ENST00000483868	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		43.35	■■■■■ 4.53
TPRA1-208	ENST00000483868	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	43.33	■■■■■ 4.53
TPRA1-208	ENST00000483868	MAP3K1	Q13233	1512 aa		43.31	■■■■■ 4.52
TPRA1-208	ENST00000483868	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		43.31	■■■■■ 4.52
TPRA1-208	ENST00000483868	MAPKBP1	O60336	1514 aa		43.3	■■■■■ 4.52
TPRA1-208	ENST00000483868	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	43.27	■■■■■ 4.52
TPRA1-208	ENST00000483868	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		43.25	■■■■■ 4.51
TPRA1-208	ENST00000483868	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	43.24	■■■■■ 4.51
TPRA1-208	ENST00000483868	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		43.22	■■■■■ 4.51
TPRA1-208	ENST00000483868	KCNH8	Q96L42	1107 aa		43.21	■■■■■ 4.51
TPRA1-208	ENST00000483868	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		43.21	■■■■■ 4.51
TPRA1-208	ENST00000483868	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	43.2	■■■■■ 4.51
TPRA1-208	ENST00000483868	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		43.11	■■■■■ 4.49
TPRA1-208	ENST00000483868	KIF14	Q15058	1648 aa		43.09	■■■■■ 4.49
TPRA1-208	ENST00000483868	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		43.02	■■■■■ 4.48
TPRA1-208	ENST00000483868	DIP2B	Q9P265	1576 aa		42.99	■■■■■ 4.47
TPRA1-208	ENST00000483868	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		42.97	■■■■■ 4.47
TPRA1-208	ENST00000483868	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	42.97	■■■■■ 4.47
TPRA1-208	ENST00000483868	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.93	■■■■■ 4.46
TPRA1-208	ENST00000483868	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.93	■■■■■ 4.46
TPRA1-208	ENST00000483868	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		42.93	■■■■■ 4.46
TPRA1-208	ENST00000483868	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.9	■■■■■ 4.46
TPRA1-208	ENST00000483868	GLI2	P10070	1586 aa		42.88	■■■■■ 4.45
TPRA1-208	ENST00000483868	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		42.87	■■■■■ 4.45
TPRA1-208	ENST00000483868	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	42.85	■■■■■ 4.45
TPRA1-208	ENST00000483868	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		42.8	■■■■■ 4.44
TPRA1-208	ENST00000483868	CD109	Q6YHK3	1445 aa		42.77	■■■■■ 4.44
TPRA1-208	ENST00000483868	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.77	■■■■■ 4.44
TPRA1-208	ENST00000483868	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		42.76	■■■■■ 4.44
TPRA1-208	ENST00000483868	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.76	■■■■■ 4.44
TPRA1-208	ENST00000483868	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		42.73	■■■■■ 4.43
TPRA1-208	ENST00000483868	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		42.69	■■■■■ 4.42
TPRA1-208	ENST00000483868	PLCH2	O75038	1416 aa		42.69	■■■■■ 4.42
TPRA1-208	ENST00000483868	TSPOAP1	O95153	1857 aa		42.68	■■■■■ 4.42
TPRA1-208	ENST00000483868	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		42.66	■■■■■ 4.42
TPRA1-208	ENST00000483868	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.65	■■■■■ 4.42
TPRA1-208	ENST00000483868	PREX2	Q70Z35	1606 aa		42.65	■■■■■ 4.42
TPRA1-208	ENST00000483868	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	42.61	■■■■■ 4.41
TPRA1-208	ENST00000483868	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.61	■■■■■ 4.41

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